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ヒトゲノムにおけるmiRNA標的遺伝子の網羅的探索および同定

人类基因组中miRNA靶基因的全面搜索与鉴定

基本信息

批准号：
17651111
负责人：
福田陽子
金额：
$ 2.3万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
2005
资助国家：
日本
起止时间：
2005 至 2007
项目状态：
已结题

项目摘要

ヒトに代表される哺乳類におけるmiRNAの発現制御機構を明らかとするために、昨年度までに完全長cDNAデータベースを用いて、miRNAの初期転写産物(Pri-miRNA)の構造を、全ゲノム的に解析し、数百種のマウスmiRNAの前駆体の構造を明らかとした。これをもとに、今年度はいくつかの興味深いmiRNAについてノックアウトマウスの作成を行っており、その表現型の解析を進めている。mRNAマイクロアレイによるトランスクリプトームから、特定のmiRNAをノックアウトした際に、同時にどのようなmRNAが変動するかを組織ごとにしらべ、これをもとに、miRNA標的遺伝子の同定を目指している。またプロテオーム解析およびメタボローム解析も行うことで、miRNAによる高次元の発現調節ネットワークを明らかにしようとしている。一方で、pri-miRNA-223の構造をマウス・ヒト・ミドリフグゲノム間で比較したところ、その長さやエクソン・イントロン構造は極めて多様なのに対し、miRNA配列及びその転写調節領域は良く保存されていることがわかった。miRNAのこのような情報から、祖先型ゲノムの構造を推測することが可能であると考え、他のmiRNAの構造についても解析を進めている。

This system is used on behalf of the mother of mammals, the miRNA system, the full-length cDNA license, the Pri-miRNA of miRNA, the analysis of the whole system, and the license of hundreds of miRNA predecessors. This year, we have a deep taste of the situation this year. This year, we have a lot of information about miRNA. This year, we have a lot of information. We have a lot of information. The mRNA system is responsible for monitoring the number of users, the specific miRNA system, the specific mRNA server, and at the same time, the location of the organization, the operator, the miRNA, and the target user. This is the first time to parse the data. This is the first time to parse the row data, miRNA data, and so on. The higher dimensional data will show that the data is different. On the one hand, the pri-miRNA-223 system is used to improve the quality of the system. In the first place, the miRNA system is used to improve the performance of the system. In the first place, the system is used to improve the performance of the system. The miRNA information system, the ancestor model, the information system, the information system, the information

项目成果

期刊论文数量（2）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Construction of microRNA expression vector in mammalian cells in "Methods in Molecular Biology - Gene Mapping, Discovery, and Expression Methods and Protocols"

“分子生物学方法 - 基因定位、发现和表达方法和方案”中哺乳动物细胞中 microRNA 表达载体的构建

DOI：
发表时间：
2006
期刊：
影响因子：
0
作者：
Haobo Guo;et al.;Shin'ya Sawada et al.;Jian Liu et al.;Kuniaki Nagamine et al.;Hisashi Hemmi et al.;Eiichiro Ono et al.;Yoko Fukuda;Yoko Fukuda
通讯作者：
Yoko Fukuda

Exploration of human miRNA target genes in neuronaL differentiailn

人类miRNA在神经元分化中靶基因的探索

DOI：
发表时间：
2005
期刊：
Nucleic Acids Symposium Series 49
影响因子：
0
作者：
Haobo Guo;et al.;Shin'ya Sawada et al.;Jian Liu et al.;Kuniaki Nagamine et al.;Hisashi Hemmi et al.;Eiichiro Ono et al.;Yoko Fukuda
通讯作者：
Yoko Fukuda