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化石DNA解析によるハイマツ・キタゴヨウ間の遺伝子浸透の進行過程の推定

利用化石DNA分析推测日本松和日本松树之间基因渗透的进展

基本信息

批准号：
19657029
负责人：
綿野泰行
金额：
$ 2.05万
依托单位：
Chiba University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份：
2007
资助国家：
日本
起止时间：
2007 至 2008
项目状态：
已结题

项目摘要

東北南部の蔵王山系においては、キタゴヨウのミトコンドリテDNAがほぼ完全にハイマツ由来のものに、ハイマツの葉緑体DNAがほぼ完全にキタゴヨウ由来のものに置換されている。このような大規模な遺伝子浸透がどのような時間スケールで成立したのかを明らかにするために、高層湿原においてボーリングを行い、各層のボーリングコアに含まれる花粉化石からDNAを抽出し、過去の花粉の組成を明らかにする実験方法の確立を試みた。土壌サンプルはC14同位体分析の結果、最大で約3000年前であった。土壌サンプルから、花粉を濃縮する方法を検討し、2枚のフィルターの間に残った粒子を用いる方法を採用した。土壌からDNAを抽出する方法を検討し、ISOIL for Beads Beatingを使用した。PCR増幅用のプライマーは葉緑体のいくつかの領域で、キタゴヨクとハイマツ間に変異がある部分に短い断片が増えるように設計した。土壌DNAのPCRはAmpdirectを用いることで増幅できた。SSCP法による多型解析を行ったが、SSCPの偽バンドのため、低頻度の種の花粉の有無を決定することが困難であることがわかった。そこでリアルタイムPCR法によって二種の花粉DNAの相対濃度を測ることを試みた。この結果も実験結果の再現性に乏しく、各層準における信頼できる二種のDNAの相対濃度を決めるには至らなかった。本研究によって高層湿原のボーリングコアサンプルから約3000年前の花粉DNAを抽出し、PCR法によって葉緑体DNAを増幅する方法を確立することができた。今回よりもさらに深い層準の解析を行い、花粉組成が逆転するようなことがあれば、今回の方法でも有効であると考えられる。また比較する種のDNA変異が大きければSSCPによる偽バンドの問題は回避できる。この成果は、花粉化石DNAを用いた種組成の解析に発展することが期待される。

In the south and north of the country, the Wangshan system is in the middle of the world, and the whole family is in the middle of the world. In the north and south of the country, the DNA of the Wangshan system in the north and south of the country is in the north and south of the country. I don't know where it comes from. I don't know where it comes from. Large-scale models are impregnated with the samples in the laboratory, and the test results are established in the laboratory, in the high humidity field, in the high humidity field, and in the extraction of fossil pollen fossils, in which the DNA extraction method is used to determine the establishment of the test. The results of C14 isotope analysis of soil samples and the results of C14 isotope analysis show that the maximum is about 3000 years ago. The soil, pollen, pollen, and two residual particles were used in the method. The local DNA extracts the method and the ISOIL for Beads Beating uses it. The PCR frame is used in the field, the system, the field, the field, the length, the length The earth DNA PCR the Ampdirect to use the paraphernalia. SSCP method is used to analyze polymorphic DNA, SSCP, and low-density pollens. There is no significant difference between the two groups. The PCR method was used to test the two kinds of pollen DNA phase measurements. Results the results showed that there was a lack of sexual stress, and each level of information was related to the severity of DNA. In this study, pollen DNA extraction and PCR methods were used to determine the size of the body DNA in high humid plains. This time, we need to make a thorough analysis of the situation, the composition of pollen, the composition of pollen, and the method of this time. We need to know more about the DNA problem. We need to know how to avoid the SSCP problem. The results and pollen fossils of DNA have been analyzed and analyzed in this paper. The exhibition is looking forward to it.