Hypothesis: Both appearance and disappearance of viruses are controlled by the accumulation of amino acid substitution in receptor binding domain

假设:病毒的出现和消失都是由受体结合​​域氨基酸取代的积累控制的

基本信息

  • 批准号:
    02454184
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.86万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for General Scientific Research (B)
  • 财政年份:
    1990
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    1990 至 1992
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

The genome of the RNA viruses is known to evolve 10^6 times faster than ordinary DNA genome. This higher evolutionary rate is thought to be linked with both appearance and disappearance of the viruses in human world. To understand the interaction between cellular receptor molecule and receptor binding domain of the virion the nucleotide and amino acid substitutions in virus encoded proteins were analyzed. According to the nucleotide sequences of EV70 capsid protein VP1 we have constructed a fine phylogenetic tree. By analyzing the phylogenetic relationship and the substitution pattern among the isolates we deduced the original nucleotide sequence. The evolutionary rate was estimated to be 5x10^<-3>/site/year, whereas the rate of the 3C protease region of coxsackievirus A24 variant, an another agent that cause acute hemorrhagic conjunctivitis, was calculated to be 4.9x10^<-3>/site/year. Using a monoclonalantibody that is capable of blocking EV70 infection screening of the COS cells transfected with cDNA library derived from Hela cell mRNA was carried out by socalled "panning" method. The receptor molecules are found to be located on the surface of the susceptive cells and has the nucleotide sequence identical to that of the molecule which regulates a function of an immunologically important molecule.
已知RNA病毒的基因组进化速度比普通DNA基因组快10^6倍。这种更高的进化速度被认为与病毒在人类世界的出现和消失有关。为了了解细胞受体分子与病毒体受体结合结构域之间的相互作用,分析了病毒编码蛋白的核苷酸和氨基酸取代。根据EV 70衣壳蛋白VP 1的核苷酸序列,我们构建了一个很好的系统发育树。通过分析菌株间的系统发育关系和替换模式,我们推测了原始的核苷酸序列。进化速率估计为5x 10 ^<-3>/位点/年,而另一种引起急性出血性结膜炎的病原体柯萨奇病毒A24变异体的3C蛋白酶区域的速率计算为4.9x10^<-3>/位点/年。用能阻断EV 70感染的单克隆抗体,用“淘选”法筛选转染Hela细胞cDNA文库的COS细胞。发现受体分子位于免疫细胞的表面上,并且具有与调节免疫学上重要的分子的功能的分子相同的核苷酸序列。

项目成果

期刊论文数量(31)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
宮村 紀久子,山崎 修道: "エンテロウイルスの流行パターンと分子進化" 遺伝. 46. 36-44 (1992)
Kikuko Miyamura,Sumo Yamazaki:“肠道病毒的流行模式和分子进化”遗传学 46. 36-44 (1992)。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
武田 直和: "急性出血性結膜炎をおこす2つのエンテロウイルスの分子進化ー RF-PCR法によるゲノム解析と分子疫学" 日本臨床 1992年特別号 感染症 遺伝子診断と分子疫学. 642. 267-273 (1992)
Naokazu Takeda:“引起急性出血性结膜炎的两种肠道病毒的分子进化:使用 RF-PCR 和分子流行病学的基因组分析”日本临床 1992 年特刊传染病遗传诊断和分子流行病学 642. 267-273 (1992))。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Hiroaki Ishiko: "Phylogenetically Different Strains of a Variant of Coxsackierirus A24 were Pepeatedly Introduced but Discontinucd in Japan" Arch.Virol. (1992)
Hiroaki Ishiko:“柯萨奇病毒 A24 变种的系统发生上不同的菌株在日本曾多次引入,但已停止使用”Arch.Virol。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
N.Takeda: "Evolutionary study on enterovirus" 70. (1993)
N.Takeda:“肠道病毒的进化研究”70。(1993)
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  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
H.Ishiko: "Phylogenetically different strains of a variant of coxsackievirus A24 were repeatedly introduced but discontinued circulating in Japan" Arch. Virol. 126. 179-193 (1992)
H.Ishiko:“柯萨奇病毒 A24 变种的系统发育不同毒株被反复引入,但在日本停止传播”Arch。
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  • 通讯作者:
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