ナノテクノロジーによる超微小HPLCの作製とプロテオーム高速解析系への適用
ナノテクノロジーによる超微小HPLCの作製とプロテオーム高速解析系への適用
批准号:
14655309
负责人:
植田 充美
金额:
$1.86万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Exploratory Research
财政年份:
2002
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2002 至 --
中文摘要
既知のDNA情報を機能タンパク質に変換したり、ランダムなDNA情報からこれまでに存在しなかったタンパク質を創製したりする潜在的な能力のある技術である細胞表層デイスプレイという分子ツールを開発し、これを用いたコンビナトリアル・バイオエンジニアリングを展開してきた。遺伝子のコードするタンパク質のこれまでの発現系は、タンパク質を純粋にとりだすためには、細胞を破砕したり濃縮したり、種々のカラムクロマトグラフィー操作も必要とする。一方、細胞の表層にタンパク質を発現デイスプレイする系では、デイスプレイされた細胞を一つの支持体として、提示されたタンパク質の機能解析ができ、タンパク質のアミノ酸配列分析を待たずに、PCR法などの併用により、導入されたDNAの配列から提示されたタンパク質のアミノ酸配列が決定できる。このように、細胞表層デイスプレイの手法は、DNA情報と機能タンパク質との解析のいわゆる距離を一気に短縮させた。また、ナノテクノロジーによって開発されたゾル・ゲル法によるシリカ一体型モノリス担体がHPLCをキャピラリー化できることがわかったので、この特性を利用して微小化HPLCの作製を行い、ハイスループットデバイスを作製した。一方、種々の細胞のmRNAから作製したcDNAなどを鋳型にして、ランダムなプライマーやエラーの多いポリメラーゼを用いてランダムなDNAライブラリーを作製し、【酵母細胞表層デイスプレイ(Cell Surface Engineering)】技術を用いて、細胞表層に機能性タンパク質分子ライブラリーとして提示した、いわゆるタンパク質ライブラリーを調製することに成功した。このタンパク質ライブラリーの活性検索を微小化HPLCで行うための最適化を行なった。
英文摘要
既知のDNA情報を機能タンパク質に変換したり、ランダムなDNA情報からこれまでに存在しなかったタンパク質を創製したりする潜在的な能力のある技術である細胞表層デイスプレイという分子ツールを開発し、これを用いたコンビナトリアル・バイオエンジニアリングを展開してきた。遺伝子のコードするタンパク質のこれまでの発現系は、タンパク質を純粋にとりだすためには、細胞を破砕したり濃縮したり、種々のカラムクロマトグラフィー操作も必要とする。一方、細胞の表層にタンパク質を発現デイスプレイする系では、デイスプレイされた細胞を一つの支持体として、提示されたタンパク質の機能解析ができ、タンパク質のアミノ酸配列分析を待たずに、PCR法などの併用により、導入されたDNAの配列から提示されたタンパク質のアミノ酸配列が決定できる。このように、細胞表層デイスプレイの手法は、DNA情報と機能タンパク質との解析のいわゆる距離を一気に短縮させた。また、ナノテクノロジーによって開発されたゾル・ゲル法によるシリカ一体型モノリス担体がHPLCをキャピラリー化できることがわかったので、この特性を利用して微小化HPLCの作製を行い、ハイスループットデバイスを作製した。一方、種々の細胞のmRNAから作製したcDNAなどを鋳型にして、ランダムなプライマーやエラーの多いポリメラーゼを用いてランダムなDNAライブラリーを作製し、【酵母細胞表層デイスプレイ(Cell Surface Engineering)】技術を用いて、細胞表層に機能性タンパク質分子ライブラリーとして提示した、いわゆるタンパク質ライブラリーを調製することに成功した。このタンパク質ライブラリーの活性検索を微小化HPLCで行うための最適化を行なった。
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植田充美: "コンビナトリアル・バイオエンジニアリングによるゲノムを超えた新機能の創出"科学と生物. 40・4. 251-257 (2002)
Mitsumi Ueda:“通过组合生物工程创造超越基因组的新功能”《科学与生物学》40・4(2002)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
S.Shiraga et al.: "Construction of the combinatorial library of Rhizopus oryza lipase mutated in the lid domain by displaying on yeast cell surface"J.Mol.Catalysis. 17-3-5. 167-173 (2002)
S.Shiraga 等人:“通过在酵母细胞表面展示,构建在盖子结构域中突变的米根霉脂肪酶组合文库”J.Mol.Catalysis。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
W.Zou et al.: "Screening of a molecule endowing Saccharomyces cereisiae with M-nonane-tolerance from a combinatorial random protein library"Appl.Microbiol.Biotechnol.. 58・5. 806-812 (2002)
W. Zou 等:“从组合随机蛋白质库中筛选赋予酿酒酵母具有 M-壬烷耐受性的分子”Appl.Microbiol.Biotechnol.. 58・5 (2002)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
T.Matsumoto et al.: "Construction of yeast strains with high cell-surface lipase activity using novel display systems based on Flolp functional domain"Appl.Environ.Microbiol.. 68・9. 4517-4522 (2002)
T. Matsumoto 等人:“使用基于 Flolp 功能域的新型展示系统构建具有高细胞表面脂肪酶活性的酵母菌株”Appl.Environ.Microbiol.. 68・9 (2002)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
植田充美: "酵母細胞表層工学からのコンビナトリアル・バイオエンジニアリング"化学と教育. 50・8. 559-563 (2002)
上田光美:“酵母细胞表面工程的组合生物工程”化学与教育50・8(2002)。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
共 7 条
レアメタル・レアアース選択回収バイオキャッチャーのデザインと創製
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批准号:21656216
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
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资助金额:$2.11万
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财政年份:2009
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负责人:植田 充美
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依托单位:
細胞情報伝達リン酸化タンパク質の超高速選択分離可能なナノバイオHPLCの開発
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批准号:16658138
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项目类别:Grant-in-Aid for Exploratory Research
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资助金额:$2.37万
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财政年份:2004
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负责人:植田 充美
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依托单位:
真核・原核両細胞でエンハンサーとして機能するプロモーターの基礎的解析とその活用
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批准号:05806013
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项目类别:Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
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资助金额:$1.09万
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财政年份:1993
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负责人:植田 充美
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依托单位:
真核細胞・原核細胞両用誘導高発現型プロモーターの開発
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批准号:03855216
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1991
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负责人:植田 充美
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依托单位:
酵母ペルオキシゾームの発達に伴って誘導される酵素群の遺伝子発現調節
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批准号:63750920
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.51万
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财政年份:1988
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负责人:植田 充美
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依托单位:
タンパクの細胞内局在化機構を応用したオルガネラ内集積システムの構築に関する研究
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批准号:61750908
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.38万
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财政年份:1986
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负责人:植田 充美
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依托单位:
海外基金