Elucidation of the mechanisms for collective motions of complex molecular systems with hierarchical structures

阐明具有层次结构的复杂分子系统的集体运动机制

• 批准号: 21840051
• 负责人: YANAO Tomohiro
• 金额: $ 1.73万
• 依托单位: Waseda University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
• 财政年份: 2009
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2009 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21840051/
• 关键词: 非線形力学; 幾何学; クラスター; DNA; 集団運動; 超球座標; キラリティ; nanlinear dynamics; geometric mechanics; hyperspherical coordinates; atamic cluster; water cluste; chirality; nucleosome; nonlinear dynamics; atomic cluster; water cluster; ozone

This study focused on the mechanisms for large-amplitude collective motions of complex molecular systems with highly-organized hierarchical structures and functions. We found that specific mode coupling and energy transfer among internal (vibrational) modes govern the onset and rates of structural transitions of atomic/molecular clusters. We also scrutinized elastic properties of DNA and clarified the mechanisms for the spontaneous selection of chirality of higher-order structures of DNA.

本研究主要探讨具有高度有序等级结构和功能的复杂分子系统的大振幅集体运动机制。我们发现，特定的模式耦合和内部（振动）模式之间的能量转移支配的原子/分子团簇的结构转变的发生和速率。我们还仔细研究了DNA的弹性性质，阐明了DNA高阶结构手性自发选择的机制。

项目成果

ナノ秩序構造体の集団運動の力学的機構

纳米有序结构集体运动的力学机制

• 发表时间: 2009
• 作者: 澤井秀朋;固武慶;山田章一;柳尾朋洋
• 通讯作者: 柳尾朋洋

原子分子集合体の構造変化運動の超球モード解析

原子分子聚集体结构变化运动的超球模分析

• 发表时间: 2009
• 作者: Moriya;T. J. and Tominaga;N;佐々木義卓;柳尾朋洋
• 通讯作者: 柳尾朋洋

Nonlinear dynamics and geometry of collective motions of complex molecular systems

复杂分子系统集体运动的非线性动力学和几何

• 发表时间: 2010
• 期刊: AIP Conference Proceedings Vol.1281
• 作者: Hajime Fujita;Mikio Furuta;Takahiko Yoshida;T. Yanao
• 通讯作者: T. Yanao

Dynamical mechanisms for collective motions of nanostructures

纳米结构集体运动的动力学机制

• 发表时间: 2010
• 期刊: 数理解析研究所講究録 Vol.1692
• 作者: Hajime Fujita;Mikio Furuta;Takahiko Yoshida;T. Yanao;澤井秀朋;池田幸太;T. Yanao
• 通讯作者: T. Yanao

高次元分子反応における位相空間構造の縮約と非平衡速度論

高维分子反应中相空间结构的简化和非平衡动力学

• 发表时间: 2009
• 作者: 柳尾朋洋;W.S.Koon;J.E.Marsden
• 通讯作者: J.E.Marsden