控制自身免疫风险等位基因致病功能的转录因子的鉴定-猫眼课题宝

控制自身免疫风险等位基因致病功能的转录因子的鉴定

批准号：

21K20647

负责人：

Ishigaki Kazuyoshi

金额：

$2.0万

依托单位：

Institute of Physical and Chemical Research

依托单位国家：

日本

项目类别：

Grant-in-Aid for Research Activity Start-up

财政年份：

2021

资助国家：

日本

项目状态：

已结题

起止时间：

2021-08-30 至 2023-03-31

来源：

https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K20647/

关键词：

リスク多型 GWAS ゲノム編集転写因子自己免疫疾患アレル特異的解析アレル特異的発現解析ゲノムワイド関連解析

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会议论文

Single-cell eQTL models reveal dynamic T cell state dependence of disease loci.

DOI： 10.1038/s41586-022-04713-1

发表时间： 2022-06

期刊：

Nature

影响因子： 64.8

作者：

[]

通讯作者：

HLA autoimmune risk alleles restrict the hypervariable region of T cell receptors.

DOI： 10.1038/s41588-022-01032-z

发表时间： 2022-04

期刊：

NATURE GENETICS

影响因子： 30.8

作者：

[Ishigaki, Kazuyoshi, Lagattuta, Kaitlyn, Luo, Yang, James, Eddie, Buckner, Jane, Raychaudhuri, Soumya]

通讯作者： Raychaudhuri, Soumya

Multi-ancestry genome-wide association analyses identify novel genetic mechanisms in rheumatoid arthritis.

DOI： 10.1038/s41588-022-01213-w

发表时间： 2022-11

期刊：

NATURE GENETICS

影响因子： 30.8

作者：

[Ishigaki, Kazuyoshi, Sakaue, Saori, Terao, Chikashi, Luo, Yang, Sonehara, Kyuto, Yamaguchi, Kensuke, Amariuta, Tiffany, Too, Chun Lai, Laufer, Vincent A., Scott, Ian C., Viatte, Sebastien, Takahashi, Meiko, Ohmura, Koichiro, Murasawa, Akira, Hashimoto, Motomu, Ito, Hiromu, Hammoudeh, Mohammed, Al Emadi, Samar, Masri, Basel K., Halabi, Hussein, Badsha, Humeira, Uthman, Imad W., Wu, Xin, Lin, Li, Li, Ting, Plant, Darren, Barton, Anne, Orozco, Gisela, Verstappen, Suzanne M. M., Bowes, John, MacGregor, Alexander J., Honda, Suguru, Koido, Masaru, Tomizuka, Kohei, Kamatani, Yoichiro, Tanaka, Hiroaki, Tanaka, Eiichi, Suzuki, Akari, Maeda, Yuichi, Yamamoto, Kenichi, Miyawaki, Satoru, Xie, Gang, Zhang, Jinyi, Amos, Christopher, I, Keystone, Edward, Wolbink, Gertjan, Van der Horst-Bruinsma, Irene, Cui, Jing, Liao, Katherine P., Carroll, Robert J., Lee, Hye-Soon, Bang, So-Young, Siminovitch, Katherine A., de Vries, Niek, Alfredsson, Lars, Rantapaa-Dahlqvist, Solbritt, Karlson, Elizabeth W., Bae, Sang-Cheol, Kimberly, Robert P., Edberg, Jeffrey C., Mariette, Xavier, Huizinga, Tom, Dieude, Philippe, Schneider, Matthias, Kerick, Martin, Denny, Joshua C., Matsuda, Koichi, Matsuo, Keitaro, Mimori, Tsuneyo, Matsuda, Fumihiko, Fujio, Keishi, Tanaka, Yoshiya, Kumanogoh, Atsushi, Traylor, Matthew, Lewis, Cathryn M., Eyre, Stephen, Xu, Huji, Saxena, Richa, Arayssi, Thurayya, Kochi, Yuta, Ikari, Katsunori, Harigai, Masayoshi, Gregersen, Peter K., Yamamoto, Kazuhiko, Bridges, S. Louis, Jr., Padyukov, Leonid, Martin, Javier, Klareskog, Lars, Okada, Yukinori, Raychaudhuri, Soumya]

通讯作者： Raychaudhuri, Soumya

Prediction of the cell-type-specific transcription of non-coding RNAs from genome sequences via machine learning

DOI： 10.1038/s41551-022-00961-8

发表时间： 2022-11-21

期刊：

NATURE BIOMEDICAL ENGINEERING

影响因子： 28.1

作者：

[Koido, Masaru, Hon, Chung-Chau, Terao, Chikashi]

通讯作者： Terao, Chikashi

Distinct transcriptome architectures underlying lupus establishment and exacerbation

DOI： 10.1016/j.cell.2022.07.021