Relations between cell population dynamics in non-stationary environment and generation time fluctuation
Relations between cell population dynamics in non-stationary environment and generation time fluctuation
批准号:
21K20672
负责人:
野添 嵩
金额:
$2.0万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2021-08-30 至 2024-03-31
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英文摘要
前年度に引き続き有限集団の定常データに適用可能な既存の手法の妥当性及び限界を確認するための数値シミュレーションと実験データにへの適用を行ったことに加え、本年度は定常性の低い既存の実験データの解析を行った。まず従来の細胞系譜解析手法が環境の定常性を前提とせず適用できることに着目し、集団として増殖が静止した状態から採取された細胞が指数関数的に増殖するようになる過程という定常性の低い細胞系譜を定常性の高い細胞系譜と比較した。新たに導入された2種類の選択強度は、定常性の高い環境ではほぼ同じ値をとる傾向を示す一方で、定常性の低い細胞系譜ではその傾向から大きく外れることがわかった。以上の成果は本年度出版された論文で報告している。さらに、この論文では世代時間がゆらぐ増殖モデルでの理論計算も行っており、この結果も本研究を進める上で重要な指針となる。次に細胞の排除や死亡を含む個体群動態において細胞の定量的形質の違いによる選択がどの程度起きるのかを定量的に評価する方法を考案した。この手法は細胞の排除や死亡が起こらない細胞系譜を対象とした従来の解析の枠組みの拡張となっている。成長を持続する細菌集団に対し致死濃度の抗生物質を投与する中での生き死にを追跡した細胞系譜を対象とした解析や、増えた細胞を排除しながら一定数の細胞集団を維持するような増殖系の実験データを対象にした解析を行い、本手法の実験データへ適用可能性を評価した(海外共同研究者との共著論文として投稿中)。以上の成果は次年度実施する予定の変動環境下における増殖する細胞集団の実験データを解析する上で有用であることが期待される。
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ニューヨーク大学(米国)
纽约大学(美国)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
【研究成果】細胞運命の不平等さを定量化する ―― 細胞系譜情報を利用した統計解析手法を構築 ――
[研究成果]量化细胞命运的不平等——开发利用细胞谱系信息的统计分析方法——
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
マックス・プランク研究所(ドイツ)
马克斯·普朗克研究所(德国)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
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作者:
[]
通讯作者:
ESPCI, Paris(フランス)
ESPCI,巴黎(法国)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
遺伝子発現量のゆらぎとストレス環境下における細胞の生存の関係
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批准号:14J01376
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.41万
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财政年份:2014
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负责人:野添 嵩
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依托单位:
海外基金