転移性去勢感受性前立腺癌の分子生物学的解析に基づくプレシジョン医療の実現

基于转移性去势敏感前列腺癌分子生物学分析实现精准医疗

• 批准号: 22K20789
• 负责人: 住吉 崇幸
• 金额: $ 1.83万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-08-31 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22K20789/
• 关键词: ゲノム解析; トランプスクリプトーム解析; ホルモン感受性前立腺癌; 前立腺癌; プレシジョン医療

本研究に登録されたmHSPC患者203例から採取した生検組織のうち、57サンプルからDNAを、34サンプルからRNAを抽出した。DNA収量は平均2.6ugで、全サンプルがエクソンシーケンスに求められるクオリティ（DIN≧7）を満たしていた。現在34サンプルまで変異またはコピー数の解析を行い、変異は主にSPOP（n=7）、FOXA1（n=4）、CDK12（n=3）などに認められ、コピー数異常もNKX3-1やRB1の欠失、MYC増幅など、前立腺癌の特徴を現わしていた。MSH2のコピー数が著明に低下していたサンプルでは約1000個の変異が認められ、ミスマッチ修復遺伝子異常の特徴を示していた。RNAシーケンスは約90%のサンプル（34サンプル中31サンプル）で問題なく施行することができた。遺伝子発現のパターンが3 種類に分類され、そのうち1つのグループは他2つのグループと比べてアンドロゲン依存性が低く、生存期間が不良な傾向を示した。本研究で収集したほとんどの生検組織でゲノムおよびトランスクリプトーム解析を施行することが示された。

In this study, 203 patients with mHSPC were enrolled, 57 patients with mHSPC were enrolled, and 34 patients with mHSPC were enrolled. The average DNA content was 2.6 μ g, and the total DNA content was 2.7 μ g. Now, 34 cases of abnormal number of samples were analyzed, SPOP (n=7), FOXA1 (n=4), CDK12 (n=3) were identified, abnormal number of samples NKX3 -1 and RB1 were missing, MYC was increased, and characteristics of advanced adenocarcinoma were present. The number of MSH2 samples was significantly lower than that of MSH 2 samples. About 1000 samples were identified and the abnormal characteristics of MSH 2 samples were indicated. RNA is about 90% of the time. There are three types of genetic development: classification, classification, classification. This study focuses on the analysis of the biological organization of the human body and its effects.

项目成果

The feasibility of molecular profiling of prostate tissue samples obtained from patients with metastatic castration-resistant prostate cancer

对从转移性去势抵抗性前列腺癌患者获得的前列腺组织样本进行分子分析的可行性

• 发表时间: 2023
• 作者: Naoki Oike;Ryota Shirai;Taylor Gillis;Deandra Walker;Avery Bodlak;Timothy Porfilio;Michael Verneris;Masanori Hayashi;住吉 崇幸
• 通讯作者: 住吉 崇幸