血栓性微小血管症の病因診断の試みー腎生検組織の空間的トランスクリプトーム解析ー

尝试诊断血栓性微血管病的发病机制 - 肾活检组织的空间转录组分析 -

• 批准号: 22K20908
• 负责人: 岩崎 沙理
• 金额: $ 1.83万
• 依托单位: Hokkaido University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-08-31 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22K20908/
• 关键词: 空間的トランスクリプトーム; 血管内皮; 血栓性微小血管症; 腎病理

本研究では、様々な病因で発症する血栓性微小血管症（thrombotic microangiopathy: TMA）の症例について、腎生検組織を用いて、空間的transcriptome解析を行い、病因により差異が見いだされるかを検討する。GeoMX(NanoString社)のプラットフォームを用いて、腎生検組織上の内皮細胞のみからmRNAを抽出し、網羅的な whole transcriptome解析、および網羅的な蛋白解析（nCounter）を行う予定である。1. 病理学的TMAのうち比較的急性期の内皮細胞傷害像を示す、①TAFRO症候群(血小板減少、全身性浮腫、発熱、骨髄線維化や腎機能障害、臓器腫大を示す全身性炎症性疾患) に伴うTMA、②造血幹細胞移植後TMA、③薬剤性TMA(抗VEGF阻害剤)、④膠原病関連TMA（抗リン脂質抗体症候群等）を2-3例ずつ抽出した。病理組織学的因子、血液検査所見、尿所見、臨床経過や治療反応性について解析し、典型例を確認した。2. ヒト腎生検組織ホルマリン固定パラフィン包埋切片を用いて、 GeoMX(NanoString 社)をプラットフォームとする 空間的 transcriptome 解析、およびnCounterを用いた網羅的な蛋白解析を行うための予備実験を開始した。まず、パラフィンブロック品質を確認した。特殊スライドガラスを入手した。予備実験用に、固定条件等の異なる腎生検症例（IgA腎症等）を10例ほど抽出の上、パラフィン切片を接着させ、外注先に提出した。NanoString社の技術者とミーティングの上、遺伝子抽出や蛋白解析を行う関心領域を設定した。

This study is to investigate the etiology of thrombotic microangiopathy (TMA), the use of renal tissue, the analysis of spatial transcriptome, and the differences in etiology. GeoMX(NanoString) is used to extract mRNA from endothelial cells in kidney tissues, analyze the whole transcriptome of the network, and analyze the protein of the network (nCounter). 1. Pathological examination of TMA showed endothelial cell injury in acute phase,(1) TAFRO syndrome (thrombocytopenia, systemic edema, fever, bone marrow maintenance, renal dysfunction, organ enlargement, etc.) associated with TMA,(2) TMA after hematopoietic stem cell transplantation,(3) anti-VEGF inhibitor,(4) collagen-related TMA (anti-lipid antibody syndrome, etc.) in 2-3 cases. Pathological factors, blood examination findings, urine findings, clinical symptoms, treatment response analysis, typical cases confirmed 2. The preparation of the protein analysis of the kidney tissue is started by using GeoMX(NanoString) to analyze the protein in the space.まず、パラフィンブロック品质を确认した。Special needs to be addressed. In order to prepare for the use of different conditions of kidney disease (IgA kidney disease, etc.), 10 cases were extracted from the upper part of the sample, followed by the outer note. NanoString's engineers are interested in setting up the domain of protein analysis, gene extraction and protein analysis.

项目成果

抗リン脂質抗体症候群腎症の臨床病理学的検討

抗磷脂抗体综合征肾病的临床病理学研究

• 发表时间: 2022
• 作者: Yuka Maya 1 ;Yasuyuki Fujita 1 ;Kodai Miyamoto 1 ;Machiko Nishimura 2 ;Sari Iwasaki 3 ;Satoko Shimizu 1;岩崎 沙理;岩崎 沙理
• 通讯作者: 岩崎 沙理

腎病理企画：Peritubular capillaritis and Capillaropathy

肾脏病理学计划：管周毛细血管炎和毛细血管病

• 发表时间: 2022
• 作者: Yuka Maya 1 ;Yasuyuki Fujita 1 ;Kodai Miyamoto 1 ;Machiko Nishimura 2 ;Sari Iwasaki 3 ;Satoko Shimizu 1;岩崎 沙理
• 通讯作者: 岩崎 沙理

Pseudoangiomatous stromal hyperplasia (PASH) arising in an axillary accessory breast

腋窝副乳中出现的假性血管瘤性间质增生 (PASH)

• DOI: 10.1111/ddg.14710
• 发表时间: 2022
• 期刊: J Dtsch Dermatol Ges.
• 作者: Yuka Maya 1 ;Yasuyuki Fujita 1 ;Kodai Miyamoto 1 ;Machiko Nishimura 2 ;Sari Iwasaki 3 ;Satoko Shimizu 1
• 通讯作者: Satoko Shimizu 1

非腫瘍性疾患病理アトラス 腎

非肿瘤性疾病病理图谱肾

• 发表时间: 2022
• 作者: 仲野 宏;齋藤 元伸;中嶋 正太郎;齋藤 勝治;北堀 有希;片方 雅紀;花山 寛之;渡辺 洋平;後藤 明輝;他;堂本裕加子
• 通讯作者: 堂本裕加子