次世代シーケンシングによるHmga2の骨形成制御機構の解明
次世代シーケンシングによるHmga2の骨形成制御機構の解明
批准号:
22K21049
负责人:
根岸 翼
金额:
$1.83万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
财政年份:
2022
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2022-08-31 至 2024-03-31
中文摘要
構造的転写因子High mobility group A2(Hmga2)遺伝子は幹細胞や腫瘍細胞に発現する遺伝子として知られているが、Hmga2ノックアウト(KO)マウスでは骨と体脂肪の形成が著しく減少し、体躯が矮小化したピグミー表現型を示す。ヒトHmga2遺伝子の異常でも同様の症状を呈すことから、Hmga2の骨形成への関与が予想されるが、その役割は全く不明である。本研究ではHmga2による骨芽細胞分化誘導機構に焦点を当て、RNA-seq・ChIP-seqといった次世代シーケンス技術を用いてHmga2の働きを網羅的に解析し、分子生物的・組織化学的に知見を発展・追求することで、未知の骨形成過程における骨芽細胞分化機構を解明し制御することを目的とする。これまでに申請者はマウス顔面骨におけるHmga2の影響と、MC3T3-E1細胞の骨芽細胞分化におけるHmga2の関与を示唆する結果を得ている。また、数点のタイムポイント・サンプルにおいてRNA-seqを実施し、Hmga2KO細胞における、Osterix、アルカリフォスファターゼやWnt5a等の骨芽細胞分化に関連する多くの遺伝子の発現の低下を確認している。しかし、mRNA発現をベースにするRNA-seqでは副次的な影響を含んでいる可能性がある。そこで、Hmga2が直接的に結合している遺伝子プロモーター領域を網羅的に同定するためにChIP-Seqを実施した。その結果、Wnt5bをはじめとするWnt関連遺伝子近傍へのHmga2の結合が確認された。現在、より広域にHmga2の関与が疑われる骨芽細胞分化関連遺伝子を探るとともに、現時点までに得られた候補遺伝子に関する解析を進めている。
英文摘要
構造的転写因子High mobility group A2(Hmga2)遺伝子は幹細胞や腫瘍細胞に発現する遺伝子として知られているが、Hmga2ノックアウト(KO)マウスでは骨と体脂肪の形成が著しく減少し、体躯が矮小化したピグミー表現型を示す。ヒトHmga2遺伝子の異常でも同様の症状を呈すことから、Hmga2の骨形成への関与が予想されるが、その役割は全く不明である。本研究ではHmga2による骨芽細胞分化誘導機構に焦点を当て、RNA-seq・ChIP-seqといった次世代シーケンス技術を用いてHmga2の働きを網羅的に解析し、分子生物的・組織化学的に知見を発展・追求することで、未知の骨形成過程における骨芽細胞分化機構を解明し制御することを目的とする。これまでに申請者はマウス顔面骨におけるHmga2の影響と、MC3T3-E1細胞の骨芽細胞分化におけるHmga2の関与を示唆する結果を得ている。また、数点のタイムポイント・サンプルにおいてRNA-seqを実施し、Hmga2KO細胞における、Osterix、アルカリフォスファターゼやWnt5a等の骨芽細胞分化に関連する多くの遺伝子の発現の低下を確認している。しかし、mRNA発現をベースにするRNA-seqでは副次的な影響を含んでいる可能性がある。そこで、Hmga2が直接的に結合している遺伝子プロモーター領域を網羅的に同定するためにChIP-Seqを実施した。その結果、Wnt5bをはじめとするWnt関連遺伝子近傍へのHmga2の結合が確認された。現在、より広域にHmga2の関与が疑われる骨芽細胞分化関連遺伝子を探るとともに、現時点までに得られた候補遺伝子に関する解析を進めている。
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基于RNA-seq技术探究抗菌肽HX-12C对SA皮肤感染的抑制机理
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批准号:2025JJ70518
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2025
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负责人:汪美凤
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依托单位:
整合RNA-Seq和Iso-Seq数据识别肺纤维化相关可变剪接事件并解析其生物学功能
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批准号:62401300
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:30.00万元
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批准年份:2024
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负责人:刘国君
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依托单位:
利用ATAC-seq联合RNA-seq分析TOP2A介导的HCC肿瘤细胞迁移侵
袭的机制研究
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2024
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负责人:柳静
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依托单位:
基于细菌混池和单细胞RNA-seq技术解析宿主调控合成微生物组代谢与致病异质性的机制
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批准号:32470044
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项目类别:面上项目
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资助金额:50.00万元
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批准年份:2024
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负责人:刘威
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依托单位:
基于BSR-seq和RNA-seq技术的甘蔗抗旱相关QTL定位与候选基因鉴定
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批准号:32460492
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项目类别:地区科学基金项目
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资助金额:32.00万元
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批准年份:2024
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负责人:李文兰
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依托单位:
基于RNA-seq技术对Tau过表达小鼠角膜神经病变的机制研究
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批准号:2023JJ30003
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2023
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负责人:李盛国
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依托单位:
基于比较基因组学和RNA-Seq探讨ClpP抑制剂bohemamines的生物合成机制研究
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批准号:2023JJ40377
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项目类别:省市级项目
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批准年份:2023
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负责人:刘玲
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依托单位:
基于RNA-seq技术探讨土家药白三七总皂苷干预骨折愈合的作用及其转录组学特征
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批准号:2023JJ60130
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项目类别:省市级项目
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批准年份:2023
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负责人:聂孝平
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依托单位:
基于单细胞RNA-seq研究桃砧木AR形成的分子机制
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批准号:32360717
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项目类别:地区科学基金项目
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资助金额:32万元
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批准年份:2023
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负责人:张帆
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依托单位:
基于单细胞RNA-Seq技术的抗NMDAR脑炎B淋巴细胞功能异质性在免疫调控及复发预警中的作用机制研究
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批准号:82371351
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项目类别:面上项目
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资助金额:47万元
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批准年份:2023
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负责人:郭守刚
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依托单位: