Structure based design of novel RNA aptamer against AML1

基于结构的 AML1 新型 RNA 适体设计

• 批准号: 23870026
• 负责人: NOMURA Yusuke
• 金额: $ 2.08万
• 依托单位: Tokyo University of Science
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-23870026/
• 关键词: RNA アプタマー; 立体構造; RNAアプタマー; AML; SELEX; 白血病原因タンパク質; 核酸-蛋白質相互作用

The purpose of this study is to obtain a novel RNA aptamer against AML1 Runt domain by the structure based design.(1)The designed aptamer, Apt14 has high affinity for the Runt domain.(2) The mutant analysis of the Apt14 suggested that internal loop and terminal stem structure are important for the affinity to the Runt domain.

本研究的目的是通过基于结构的设计获得一种针对AML1 Runt结构域的新型RNA适体。（1）设计的适体Apt14对Runt结构域具有高亲和力。(2)Apt14的突变体分析表明，内环和末端茎结构对于与Runt结构域的亲和力是重要的。

项目成果

The Runt domain of AML1 (RUNX1) binds a sequence-conserved RNA motif that mimics a DNA element.

• DOI: 10.1261/rna.037879.112
• 发表时间: 2013-07
• 期刊: RNA (New York, N.Y.)
• 作者: Fukunaga J;Nomura Y;Tanaka Y;Amano R;Tanaka T;Nakamura Y;Kawai G;Sakamoto T;Kozu T
• 通讯作者: Kozu T

RNA アプタマーの立体構造解析

RNA适配体三维结构分析

• 发表时间: 2011
• 作者: Ai Kojima;Junko Y. Toshima* (*corres- ponding authors);Chisa Kanno;Chie Kawata and Jiro Toshima*;川口眞理;坂本泰一,野村祐介
• 通讯作者: 坂本泰一,野村祐介

RNAアプタマーの立体構造解析

RNA适配体三维结构分析

• 发表时间: 2011
• 作者: 坂本泰一;野村祐介
• 通讯作者: 野村祐介

NMR analysis of the interaction between AML1 Runt domain and RNA aptamer

AML1 Runt 结构域与 RNA 适体相互作用的 NMR 分析

• 发表时间: 2012
• 作者: 秋山正志;平井秀憲;宮田敏行;Amano.R,Nomura.Y,Nagata.T,Fukunaga.J.Tanaka.Y.Katahira.M,Nakamura.Y,Kozu.T.Sakamoto.T
• 通讯作者: Amano.R,Nomura.Y,Nagata.T,Fukunaga.J.Tanaka.Y.Katahira.M,Nakamura.Y,Kozu.T.Sakamoto.T

AML1 Runt domain に結合する RNA アプタマーの改良

改进 RNA 适体与 AML1 Runt 结构域的结合

• 发表时间: 2012
• 作者: Ryo Amano;Yusuke Nomura;Takashi Nagata;Jun-ichi Fukunaga;Yoichiro Tanaka;Masato Katahira;Yoshikazu Nakamura;Tomoko Kozu and Taiichi Sakamoto;Yoshihiro Tsuchiya a n d H i d e a k i K a m a t a;三浦収;野村祐介,山崎 香,福永淳一,田中陽一郎,中村義一,神津知子,坂本泰一,鳥越秀峰
• 通讯作者: 野村祐介,山崎 香,福永淳一,田中陽一郎,中村義一,神津知子,坂本泰一,鳥越秀峰