Plastid genome evolution in serial secondary plastids of a green-colord dinoflagellate
Plastid genome evolution in serial secondary plastids of a green-colord dinoflagellate
批准号:
24870004
负责人:
KAMIKAWA Ryoma
金额:
$1.0万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
财政年份:
2011
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2011 至 2012
中文摘要
本研究对绿色甲藻Lepidodinium的质体基因组进行了测序,以追溯其质体的起源和进化。通过次代测序分析,获得了几乎完整的质体基因组序列。通过大型质体基因数据和比较基因组学的系统发育分析表明,鳞藻质体来源于一种与足藻科密切相关的绿藻,并且在获得质体后发生了激烈的基因组重排。
英文摘要
In this study, in order to retrace origin and evolution of plastids in the green colored dinoflagellate Lepidodinium, its plastid genome was sequenced. Nearly complete sequence of the plastid genome was obtained by the next generation sequencing analysis. Phylogenetic analysis with a large plastid gene dataset and comparative genomics revealed that the Lepidodinium plastids are derived from a green alga closely related to Pedinophyceae and drastic genome rearrangement has been occurred after the plastid acquisition.
期刊论文(42)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
登录
查看更多内容
Searching for missing pieces in natural environments: With the emphasis on the importance of culture strains of enigmatic eukaryotes for global eukaryotic phylogeny.
寻找自然环境中缺失的片段:强调神秘真核生物培养株对于全球真核系统发育的重要性。
DOI:
--
发表时间:
2012
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Kamikawa R, Yabuki A, Hashimoto T, Nishimura Y, Inagaki Y]
通讯作者:
Inagaki Y
光合成能進化研究のモデルとしての無色珪藻類Nitzschia spp.
无色硅藻菱形藻作为光合能力进化研究的模型。
DOI:
--
发表时间:
2012
期刊:
影响因子:
--
作者:
[神川龍馬, 吉田昌樹, 平美砂歌, 石田健一郎, 橋 本哲男, 稲垣祐司]
通讯作者:
稲垣祐司
DOI:
10.5772/34251
发表时间:
2012
期刊:
Food Quality
影响因子:
--
作者:
[Shiraishi T, Kamikawa R, Sako Y, Imai I.]
通讯作者:
Imai I.
Mitohondrial evolution: from genomes to metabolisms
线粒体进化:从基因组到新陈代谢
DOI:
--
发表时间:
2012
期刊:
影响因子:
--
作者:
[神川龍馬、Kolisko M, Andersson JO, Simpson AGB、Roger AJ, 稲垣祐司、橋本哲男, 神川龍馬]
通讯作者:
神川龍馬
The phylogenetic position and mitochondrial genome sequence of the enigmatic discobid Tsukubamonas globosa.
神秘的圆盘形筑波单胞菌的系统发育位置和线粒体基因组序列。
DOI:
--
发表时间:
2012
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Kamikawa R, Nishimura Y, Yabuki A, Kolisko M, Simpson A GB, Roger A J, Ken-ichiro Ishida, Hashimoto T, Inagaki Y.]
通讯作者:
Inagaki Y.
共 14 条
海外基金