Analysis of 3-dimentional structure β-adrenoceptor ligands and receptor complex by NMR
NMR 分析 β-肾上腺素受体配体和受体复合物的三维结构
基本信息
- 批准号:15590239
- 负责人:
- 金额:$ 2.3万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- 财政年份:2003
- 资助国家:日本
- 起止时间:2003 至 2004
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
Based on the molecular modeling studies, the binding sites between these ligands (SWR-0342SA) and β-adrenoceptors (β-AR) were Asp104 and Leu335 in the β_1-receptors, and Asp117,Ser209,Leu303 and Ser192 and in β_3-adrenoceptors. Potencies of affinities of these compounds were also determined by the radioligand binding assay method. In addition, we analyzed the interaction sites between these compounds and β-AR by NMR. The sequence of 3^<rd> TMD peptide of the β_1- adrenergic receptor was found KKKELWTSVDVLAVTASIETLAVIALDRYLAKK. The peptide was synthesized and purchased from Sigma Genosys and purified to >74% purity as judged by HPLC. The purified peptide was prepared for NMR sample solution by dissolving it in DMSO solution. 1D HNMR and 2D NMR experiment were done in the JEOL 500MHz NMR machine. In 1D HNMR experiment presaturation method was done, whereas 2DNMR experiment was included DQFCOSY (double quantum filtered correlation spectroscopy), NOESY (Neclear Overhauser effects), ROESY (Rotating frame Overhauser spectroscopy), HMQC (hetaronuclear Multiple Quantum coherence) and HMBC (Hetaronuclear Multiple Bond Correlation). The ^1H NMR spectroscopy was performed where x_offset and x_sweep was 5.8 ppm and 12 ppm respectively. The ^<13>C NMR spectroscopy was also done where x_point was 95 ppm and x_sweep was 200 ppm. In NOESY experiment mixing time was 1.872 sec. The NMR spectra of bopindolol and 33 amino acid peptide of 3^<rd> TMD of β_1-AR were obtained individually. Finally we want to perform NMR analysis of complex between bopindolol and 3^<rd> TMD peptide of β_1-AR. We may be able to get the conformational structure of 33^<rd> TMD peptide from the bound and unbound NMR spectroscopy with bopindolol.
经分子模拟研究,这些配体(SWR-0342 SA)与β-肾上腺素受体(β-AR)的结合位点分别为β_1受体的Asp 104和Leu 335,β_3受体的Asp 117、Ser 209、Leu 303和Ser 192。还通过放射性配体结合测定法测定了这些化合物的亲和力。此外,我们还通过核磁共振分析了这些化合物与β-AR的相互作用位点。β<rd>_1-肾上腺素能受体3^ TMD肽序列为KKKELWTSVDVLAVTASIETLAVIALDRYLAK。合成肽并从Sigma Genosys购买,并纯化至通过HPLC判断的>74%纯度。通过将纯化的肽溶解在DMSO溶液中来制备用于NMR样品溶液的纯化的肽。在JEOL 500 MHz核磁共振仪上进行了1D-HNMR和2D-NMR实验。1DNMR实验采用预饱和法,2DNMR实验采用双量子滤波相关谱(DQFCOSY)、核Overhauser效应(NOESY)、旋转标架Overhauser谱(ROESY)、杂原子多量子相干(HMQC)和杂原子多键相关(HMBC)。在x_offset和x_sweep分别为5.8 ppm和12 ppm的情况下进行1H NMR光谱。还<13>进行13 C NMR光谱,其中x_point为95 ppm且x_sweep为200 ppm。在NOESY实验中,混合时间为1.872秒。分别获得了博吲哚洛尔和β_1-AR的3^ TMD的33个氨基酸肽段的NMR谱<rd>。最后,我们对博吲哚洛尔与β_1-AR的3^ TMD肽段的复合物进行了NMR分析<rd>。我们可以<rd>从结合和未结合的核磁共振谱中得到33^ TMD肽的构象结构。
项目成果
期刊论文数量(17)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Ahmed, M. 他: "Binding and functional affinity of some newly synthesized phenethylamine and phenoxypropanolamine delivatives for thier agonistic activity at recombinant human β-3-adrenoceptor"Journal of Pharmacy and Pharmacology. 55. 95-101 (2003)
Ahmed, M. 等人:“一些新合成的苯乙胺和苯氧基丙醇胺衍生物对重组人 β-3-肾上腺素受体的激动活性的结合和功能亲和力”《药学和药理学杂志》55. 95-101 (2003)。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
βアドレナリン受容体遮断薬の分子薬理
β-肾上腺素能受体阻滞剂的分子药理学
- DOI:
- 发表时间:2004
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Noda S;Harada N;Hida A;Fujii-Kuriyama Y;Motohashi H;Yamamoto M.;中村隆志他
- 通讯作者:中村隆志他
Nakamura, T 他: "βアドレナリン受容体遮断薬の分子薬理"応用薬理. (In press). (2004)
Nakamura, T 等人:“β-肾上腺素受体阻滞剂的分子药理学”应用药理学(2004 年出版)。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
Beta-blockers show partial inverse agonism to a novel constitutively active mutant of β_1-adrenoceptor
β-受体阻滞剂对 β_1-肾上腺素受体的新型组成型活性突变体表现出部分反向激动作用
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Ahmed M;Nagatomo T
- 通讯作者:Nagatomo T
Ahmed M. 他: "Molecular characterization of pharmacological properties"Biological and Pharmaceutical Bulletin. (In press). (2004)
Ahmed M. 等人:“药理学特性的分子表征”《生物和药物通报》(出版中)。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
NAGATOMO Takafumi其他文献
NAGATOMO Takafumi的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('NAGATOMO Takafumi', 18)}}的其他基金
Study on the clarification of molecular and pharmacological structure-activity relationships of 5-HT2A antagonists
5-HT2A拮抗剂分子及药理构效关系阐明的研究
- 批准号:
17590231 - 财政年份:2005
- 资助金额:
$ 2.3万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Analysis of relationships between structure and activity of beta _3-adrenoceptor agonists and antagonists by molecular modeling
分子模型分析β_3-肾上腺素受体激动剂和拮抗剂的结构与活性关系
- 批准号:
08670127 - 财政年份:1996
- 资助金额:
$ 2.3万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
The Role of Carbohydrate Moiety in Alpha_1-adrenoceptors in Rat Heart : Composition with those of Beta_1-adrenoceptors (1988-1989).
碳水化合物部分在大鼠心脏α_1-肾上腺素受体中的作用:与β_1-肾上腺素受体的组成(1988-1989)。
- 批准号:
63570102 - 财政年份:1988
- 资助金额:
$ 2.3万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
相似国自然基金
适用膜蛋白-配体复合物结构测定的1H和19F距离约束检测的固体NMR方法研究
- 批准号:JCZRYB202500181
- 批准年份:2025
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
NMR-CRISPR体系的构建及在肝癌ctDNA及miRNA联合检测中的应
用
- 批准号:
- 批准年份:2024
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
基于 NMR 指纹特征图谱与代谢组学结合模式追踪土家药
血筒果实中抗类风湿关节炎的效应物质
- 批准号:2024JJ6347
- 批准年份:2024
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
基于ResNet-CNN和2D1H.13C HSQC NMR技术的多基原藏药'阿布卡'品质整合评控体系构建
- 批准号:
- 批准年份:2024
- 资助金额:0 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
基于微流控-μNMR平台的一滴血检测技术在糖尿病免疫表型分析中的应用研究
- 批准号:
- 批准年份:2024
- 资助金额:15.0 万元
- 项目类别:省市级项目
NMR研究乳酸化TGIF1调控TGF-β/Smad信号转导通路的分子机制
- 批准号:22374155
- 批准年份:2023
- 资助金额:50 万元
- 项目类别:面上项目
基于In-cell NMR策略对“舟楫之剂”桔梗中引经药效物质的快速发现研究
- 批准号:82305053
- 批准年份:2023
- 资助金额:30 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
基于“Geo-marker新概念—HPLC-MS-SPE-NMR联用技术—RONUS-HSQC新方法”研究中药道地性的物质基础——以川芎为例
- 批准号:82374152
- 批准年份:2023
- 资助金额:48 万元
- 项目类别:面上项目
锌基复合金属氧化物催化CO2加氢反应的固体NMR谱学研究
- 批准号:22372160
- 批准年份:2023
- 资助金额:50 万元
- 项目类别:面上项目
超极化增强的固体NMR方法及在分子筛催化不饱和醛选择性加氢反应中的应用研究
- 批准号:22372179
- 批准年份:2023
- 资助金额:50 万元
- 项目类别:面上项目
相似海外基金
Revitalising NMR facilities in South Australia - Stage 2
振兴南澳大利亚 NMR 设施 - 第二阶段
- 批准号:
LE240100147 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 2.3万 - 项目类别:
Linkage Infrastructure, Equipment and Facilities
300 MHz NMR Spectrometer
300 MHz 核磁共振波谱仪
- 批准号:
536629481 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 2.3万 - 项目类别:
Major Research Instrumentation
13C NMR化学シフト値に基づくクレロダン骨格の簡便な相対立体配置決定法の確立と検証
基于13C NMR化学位移值确定氯罗烷骨架相对构型的简单方法的建立和验证
- 批准号:
24K18301 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 2.3万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
定常磁場勾配NMR法を用いた電池セル各部位の拡散係数の充放電その場解析
采用稳定磁场梯度核磁共振法对电池单元各部分的扩散系数进行原位充放电分析
- 批准号:
24K01595 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 2.3万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
NMRによる全固体電池の界面・表面状態解析とイオン伝導現象の関係解明
利用NMR分析全固态电池的界面/表面状态并阐明离子传导现象之间的关系
- 批准号:
24K01597 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 2.3万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
高温超伝導バルク磁石の強力な静磁場勾配による拡散NMRと分子識別の試み
尝试在高温超导块体磁体中使用强静磁场梯度进行扩散核磁共振和分子识别
- 批准号:
24K01618 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 2.3万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
酸化物ガラスのO-17MAS、MQMS NMRによる局所構造解析
利用 O-17MAS 和 MQMS NMR 分析氧化物玻璃的局部结构
- 批准号:
24H02580 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 2.3万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Scientists
GPCRと共役蛋白質の構造アンサンブル相関-擬細胞内環境DNP固体NMRの確立
GPCR与偶联蛋白之间的结构系综相关性-伪细胞内环境的建立DNP固态NMR
- 批准号:
23K27115 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 2.3万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
キナーゼのリン酸化・脱リン酸化を介したシグナル伝達制御のNMR動的構造生物学
通过激酶磷酸化/去磷酸化控制信号转导的 NMR 动态结构生物学
- 批准号:
23K27310 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 2.3万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
二次元拡散NMRを用いたセルロースの分子量決定に関する研究
二维扩散核磁共振测定纤维素分子量的研究
- 批准号:
24K09013 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 2.3万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)