Development of MALDI glycotyping technology targeting a wide range of biological samples.
Development of MALDI glycotyping technology targeting a wide range of biological samples.
批准号:
22H02191
负责人:
比能 洋
金额:
$10.9万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份:
2022
资助国家:
日本
项目状态:
未结题
起止时间:
2022-04-01 至 2026-03-31
中文摘要
初年度は糖タンパク質を対象とした直接解析条件の改良をまず実施した。その結果、1,5-diaminonaphtalen (DAN)を2,5-dihydroxybenzoic acid (DHB)に添加し、少量のアルカリ金属を添加したマトリックスがf mol量の無処理糖タンパク質に対し、高感度N-結合型糖鎖選択的切断と糖鎖選択的イオン化を実現できることを見出した。また、このマトリックスはウズラおよび鶏の卵白から直接N-結合型糖鎖のパターン解析が可能となることを実証した。さらに、この反応系をバクテリアの糖鎖の直接解析へと応用することを検討したところ、カラムやHILIC操作なしで、1コロニーの大腸菌から1時間以内にそのO抗原糖鎖パターンを解析できることを見出した。さらに、糖鎖亜型が報告されているO1型大腸菌とO6型大腸菌を購入し、そのO抗原糖鎖パターンを調査したところ、調査したO1型大腸菌はO1Aと呼ばれる糖鎖亜型であり、O6はJannsonらにより報告された糖鎖亜型であることを明確に示すスペクトルが確認された。これまで糖鎖亜型の確認には大腸菌の大量培養、LSPのフェノール抽出、O抗原の弱酸加水分解、および数段階のカラム操作を経てmg単位のO抗原多糖を分離し、これをNMRにより解析する必要があった。これに対し、我々が見出した技術ではいずれも寒天培地に蒔いた菌株から1コロニーをPCRチューブに入れ、簡単なチューブ内処理によりそれぞれのO抗原を同定できることを実証した。また、O1、O6、O157抗原を有する3種の大腸菌を混合して寒天培地に蒔き任意の10コロニーを選択し、解析したところ、それぞれのコロニーのO抗原を並列操作で同定できることを実証した。さらに、1コロニーを分割しそれぞれからタンパク質解析による菌種同定と糖鎖解析によるO抗原同定を並行して実施できることを実証した。
英文摘要
初年度は糖タンパク質を対象とした直接解析条件の改良をまず実施した。その結果、1,5-diaminonaphtalen (DAN)を2,5-dihydroxybenzoic acid (DHB)に添加し、少量のアルカリ金属を添加したマトリックスがf mol量の無処理糖タンパク質に対し、高感度N-結合型糖鎖選択的切断と糖鎖選択的イオン化を実現できることを見出した。また、このマトリックスはウズラおよび鶏の卵白から直接N-結合型糖鎖のパターン解析が可能となることを実証した。さらに、この反応系をバクテリアの糖鎖の直接解析へと応用することを検討したところ、カラムやHILIC操作なしで、1コロニーの大腸菌から1時間以内にそのO抗原糖鎖パターンを解析できることを見出した。さらに、糖鎖亜型が報告されているO1型大腸菌とO6型大腸菌を購入し、そのO抗原糖鎖パターンを調査したところ、調査したO1型大腸菌はO1Aと呼ばれる糖鎖亜型であり、O6はJannsonらにより報告された糖鎖亜型であることを明確に示すスペクトルが確認された。これまで糖鎖亜型の確認には大腸菌の大量培養、LSPのフェノール抽出、O抗原の弱酸加水分解、および数段階のカラム操作を経てmg単位のO抗原多糖を分離し、これをNMRにより解析する必要があった。これに対し、我々が見出した技術ではいずれも寒天培地に蒔いた菌株から1コロニーをPCRチューブに入れ、簡単なチューブ内処理によりそれぞれのO抗原を同定できることを実証した。また、O1、O6、O157抗原を有する3種の大腸菌を混合して寒天培地に蒔き任意の10コロニーを選択し、解析したところ、それぞれのコロニーのO抗原を並列操作で同定できることを実証した。さらに、1コロニーを分割しそれぞれからタンパク質解析による菌種同定と糖鎖解析によるO抗原同定を並行して実施できることを実証した。
期刊论文(15)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
登录
查看更多内容
研究者インタビュー「糖を知りたい!甘さだけじゃない糖の魅力」
研究员采访“我想了解糖!糖的魅力不仅仅是甜味”
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Generation 6 Polyamidoamine Dendrimer Provides an Ideal Nanoparticular Platform for Enzyme-assisted Synthesis of Glycopeptides Having Bulky and Complex Glycans
第 6 代聚酰胺胺树枝状聚合物为酶辅助合成具有庞大且复杂聚糖的糖肽提供了理想的纳米颗粒平台
DOI:
10.1246/cl.220344
发表时间:
2022
期刊:
Chemistry Letters
影响因子:
1.6
作者:
[Matsushita Takahiko, Hinou Hiroshi, Nishimura Shin-Ichiro]
通讯作者:
Nishimura Shin-Ichiro
浦上彰吾さんが、第70 回質量分析総合討論会でベストプレゼンテーション賞最優秀賞を受賞
浦上正吾荣获第 70 届质谱大会最佳演讲奖
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
生命科学院博士課程 1年 浦上彰吾さんが、第4回日本糖質学会優秀講演賞を受賞
生命科学学院博士生浦上正吾荣获第四届日本碳水化合物学会优秀演讲奖。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Development of O Antigen Rapid Typing by MALDI-TOF MS
MALDI-TOF MS 开发 O 抗原快速分型
DOI:
10.5702/massspec.s22-60
发表时间:
2022
期刊:
Journal of the Mass Spectrometry Society of Japan
影响因子:
--
作者:
[Urakami Shogo, Hinou Hiroshi]
通讯作者:
Hinou Hiroshi
共 10 条
広範な生体サンプル糖鎖を標的としたMALDIバイオタイピング技術の開発
-
批准号:23K23458
-
项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
-
资助金额:$4.33万
-
财政年份:2024
-
负责人:比能 洋
-
依托单位:
海外基金