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非コード転写とエピゲノムによる植物の環境応答制御機構の解明

非コード転写とエピゲノムによる植物の環境応答制御機構の解明
通过非编码转录和表观基因组阐明植物的环境响应控制机制
批准号：
22H02299
负责人：
稲垣 宗一
金额：
$11.07万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2022
资助国家：
日本
项目状态：
未结题
起止时间：
2022-04-01 至 2025-03-31
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22H02299/
关键词：
非コード転写エピゲノム植物環境応答転写制御非コードRNA

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
非コード転写に駆動されるエピゲノム制御のメカニズムと意義を探るために、主に2つの研究を進めた。1つは、シロイヌナズナのfld変異体で起きるFLC遺伝子の高発現と開花の遅延を抑圧する新規変異体の探索で、次世代シークエンサーを用いた連鎖解析により10以上の変異体について候補原因遺伝子を同定した。これらにはクロマチン制御に関連すると考えられる遺伝子が多く含まれ、H3K4モノメチル化と転写をつなぐ新規クロマチン因子候補を多数同定できたといえる。もう一つは、非コード転写産物を新規に同定するために、クロマチンに結合したRNAを網羅的に同定する試みで、ロングリードシークエンサーを用いる方法を確立することができた。さらに、H3K4メチル化・脱メチル化制御の解析を進め、転写共役的なH3K4メチル化制御機構を同定し、論文として公表した。
英文摘要
非コード転写に駆動されるエピゲノム制御のメカニズムと意義を探るために、主に2つの研究を進めた。1つは、シロイヌナズナのfld変異体で起きるFLC遺伝子の高発現と開花の遅延を抑圧する新規変異体の探索で、次世代シークエンサーを用いた連鎖解析により10以上の変異体について候補原因遺伝子を同定した。これらにはクロマチン制御に関連すると考えられる遺伝子が多く含まれ、H3K4モノメチル化と転写をつなぐ新規クロマチン因子候補を多数同定できたといえる。もう一つは、非コード転写産物を新規に同定するために、クロマチンに結合したRNAを網羅的に同定する試みで、ロングリードシークエンサーを用いる方法を確立することができた。さらに、H3K4メチル化・脱メチル化制御の解析を進め、転写共役的なH3K4メチル化制御機構を同定し、論文として公表した。
期刊论文(11)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Co-transcriptional removal of H3K4me2 via targeting of demethylase to phosphorylated RNA polymerase II
通过将去甲基化酶靶向磷酸化 RNA 聚合酶 II 共转录去除 H3K4me2
DOI： --
发表时间： 2022
期刊：
影响因子： --
作者： [Shusei Mori, Satoyo Oya, Soichi Inagaki, Tetsuji Kakutani]
通讯作者： Tetsuji Kakutani
Local induction of IAA5 and IAA29 promotes DNA damage-triggered stem cell death in Arabidopsis roots
DOI： 10.1101/2022.09.02.506394
发表时间： 2022-09
期刊： bioRxiv
影响因子： --
作者： [Naoki Takahashi;Nobuo Ogita;Toshiya Koike;K. Nishimura;Soichi Inagaki;M. Umeda]
通讯作者： Naoki Takahashi;Nobuo Ogita;Toshiya Koike;K. Nishimura;Soichi Inagaki;M. Umeda
維管束幹細胞の分裂と分化を制御するサイトカイニンの機能と動態
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DOI： --
发表时间： 2022
期刊：
影响因子： --
作者： [島津 舜治, Alif Meem Nurani, 森 秀世, 山田 一貴, 柴田 恭美, 古谷 朋之, 伊藤(大橋) 恭子, 石崎 公庸, 深城 英弘, 朝比奈 雅志, 稲垣 宗一, 角谷 徹仁, 福田 裕穂, 近藤 侑貴]
通讯作者： 近藤 侑貴
シロイヌナズナにおける転写と共役した遺伝子内H3K4メチル化の脱メチル化機構
拟南芥基因内H3K4甲基化与转录耦合的去甲基化机制
DOI： --
发表时间： 2022
期刊：
影响因子： --
作者： [森秀世, 大矢恵代, 稲垣宗一, 角谷徹仁]
通讯作者： 角谷徹仁
共 8 条
    非コード転写とエピゲノムによる植物の環境応答制御機構の解明
    • 批准号：
      23K23565
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额：
      $3.66万
    • 财政年份：
      2024
    • 负责人：
      稲垣 宗一
    • 依托单位：
      The University of Tokyo
    植物のメリステム構築・維持と細胞分裂制御の関わりの分子遺伝学的研究
    • 批准号：
      04J05969
    • 项目类别：
      Grant-in-Aid for JSPS Fellows
    • 资助金额：
      $1.79万
    • 财政年份：
      2004
    • 负责人：
      稲垣 宗一
    • 依托单位：
      Nagoya University
    海外基金