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A 'kinetic' analysis of environmental signals regulating winter length recognition in deciduous fruit trees.

调节落叶果树冬季长度识别的环境信号的“动力学”分析。

基本信息

批准号：
22H02334
负责人：
齋藤隆徳
金额：
$ 11.32万
依托单位：
Chiba University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-04-01 至 2026-03-31
项目状态：
未结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22H02334/
关键词：
自発休眠温暖化深層学習転移学習細胞培養 RNA-seq

项目摘要

リンゴ芽を用いて自発休眠前後のゲノム構造と転写変動との関係について、深層学習に基づき構築したモデルにより解析を行った。その結果、自発休眠の制御に関わると当初に想定したいた脂質・糖代謝・低温・低酸素・アブシシン酸応答といった５つのシグナルのうち、特に低温とアブシシン酸がリンゴの自発休眠の制御に重要な役割を果たしている可能性が伺えた。低温シグナルについては概日リズムを介して茎頂の発達制御を駆動していることを明らかにするとともに、アブシシン酸が非生物的ストレス応答へ作用していることも明らかとした。細胞分裂サイクルを中心とした茎頂の発達制御や、非生物的ストレスのうち酸化ストレスの自発休眠制御における重要性は、本研究で用いたリンゴのみならず様々な果樹で報告されており、過去の知見と一致するものと考えられた。さらに独自に開発した細胞モデルによりこれらの環境応答性について解析をしたところ、細胞モデルでも低温シグナルが細胞分裂サイクルに作用していることを確認できた。一方でアブシシン酸シグナルは低温に非依存的であり、どのような環境因子を受容しているかは明らかとすることはできなかった。すなわち環境因子という観点からみると、低温に依存して自発休眠を制御する経路と、低温に非依存的な経路が存在する可能性を見出した。現在は低温シグナルから茎頂の発達制御に関わる遺伝子の基礎的な解析を進めるとともに、アブシシン酸による制御を司る環境因子について解析を行っていく予定である。

From the beginning to the end of the sleep, the structure of the sleep and the relationship between the sleep and the sleep, the deep learning, the structure of the sleep and the analysis. As a result, the control of self-dormancy is considered to be important for lipid metabolism, low temperature, low acidity and high temperature. The temperature of the plant is low, and the temperature of the plant is low. In this study, the importance of cell division and dormancy control in non-biological plants was studied. In addition, it is necessary to identify the role of cell division in the development of cell culture. A party is not dependent on low temperature, environmental factors are not affected by low temperature, environmental factors are not affected by low temperature, environmental factors, environmental factors are not affected by low temperature, environmental factors, environmental factors are not affected by low temperature, environmental factors, environmental factors are not affected by low temperature, environmental factors, environmental factors. The possibility of existence of low temperature dependent and independent circuits is revealed. The analysis of environmental factors in the development and control of low temperature, high temperature and high temperature is expected to be carried out.