Simultaneous expression system of herbicide-metabolizing genes key to the expression of multiple-herbicide resistance in E. phyllopogon

除草剂代谢基因的同时表达系统是毛茅多除草剂抗性表达的关键

• 批准号: 22H02347
• 负责人: 岩上 哲史
• 金额: $ 10.98万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2026-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22H02347/
• 关键词: タイヌビエ; 抵抗性; 雑草; 解毒代謝; 除草剤; P450; 形質転換

（１）タイヌビエゲノムの解読について、これまでの研究でシーケンス自体は完了していたものの、アセンブルについて改善の必要があった。ダウンサンプリングや交雑後代のddRADリードを利用してscafoldingし、大部分の染色体についてテロメア・トゥ・テロメアレベルの精度で解読することに成功した。構造アノテーションについても実施し、原因遺伝子単離に向けたゲノム基盤を構築することができた。交雑後代について、ddRAD-seqによる遺伝子型の決定と除草剤感受性の評価から、候補遺伝子領域を1 Mbpの範囲に絞り込むことができた。（２）多様な組織からRNAを抽出し、RNA-seq解析を実施した。得られたリードを用いて共発現解析を実施し、抵抗性を引き起こすP450遺伝子と共発現性の高い転写因子を同定した。遺伝子の機能解析に向け、P450遺伝子のプロモーター領域と、転写因子のコード領域をクローニングした。本遺伝子は（１）のゲノム領域とは異なる遺伝子座に座乗することから、抵抗性の原因となる遺伝子変異とは直接関係しないと考えられた。（３）タイヌビエ形質転換敬の構築に向け、タイヌビエのカルスについて形態的特性から３つに分類し、それぞれ再分化効率とパーティクルガンによる遺伝子導入効率を比較した。タイプ１とタイプ２のカルスが細分化効率および遺伝子導入効率が高いことが明らかになった。（４）P450の内生基質の特定に向け、in vitro実験系の構築に取り組んだものの成功していない。

(1) タ イ ヌ ビ エ ゲ ノ ム の solution 読 に つ い て, こ れ ま で の research で シ ー ケ ン ス autologous は finished し て い た も の の, ア セ ン ブ ル に つ い て improve の necessary が あ っ た. ダ ウ ン サ ン プ リ ン グ や pay 雑 offspring の ddRAD リ ー ド を using し て scafolding し, most の chromosome に つ い て テ ロ メ ア · ト ゥ · テ ロ メ ア レ ベ ル の で solution precision 読 す る こ と に successful し た. Tectonic ア ノ テ ー シ ョ ン に つ い て も be cause of し, but 伝 単 from に to け た ゲ ノ ム base plate を build す る こ と が で き た. Pay 雑 offspring に つ い て, ddRAD - seq に よ る heritage 伝 sub-type の decided と weeding tonic susceptibility の review 価 か ら, alternate heritage 伝 sub-fields を 1 Mbp の van 囲 に ground り 込 む こ と が で き た. (2) Multiple な tissue らRNAを extraction <s:1>, RNA-seq analysis を implementation <s:1>. Have ら れ た リ ー ド を with い て total analytical を 発 now be し, resistance を lead き up こ す P450 heritage 伝 son と altogether 発 is の high い planning write factor を be し た. Heritage 伝 の function analytical に to け, P450 heritage 伝 son の プ ロ モ ー タ と ー field, planning to write factor の コ ー ド field を ク ロ ー ニ ン グ し た. This heritage 伝 son は (1) の ゲ ノ ム field と は different な る heritage 伝 son bridge に 乗 す る こ と か ら, resistance の と な る heritage 伝 sub - different と は masato is directly し な い と exam え ら れ た. (3) タ イ ヌ ビ エ form quality planning in worship の build に け, タ イ ヌ ビ エ の カ ル ス に つ い features in the form of て か ら 3 つ に classification し, そ れ ぞ れ redifferentiation sharper rate と パ ー テ ィ ク ル ガ ン に よ る heritage 伝 を import working rate comparing し た. タ イ プ 1 と タ イ プ 2 の カ ル ス が differentiation rate of unseen お よ び posthumous son 伝 import high rate of unseen が い こ と が Ming ら か に な っ た. (4) P450 specific に の endogenous substrate の け, the in vitro be 験 is の build に group take り ん だ も の の successful し て い な い.

项目成果

タイヌビエの高精度ゲノム解読からわかる日本国内の遺伝的多様性

通过日本小米的高精度基因组测序揭示日本的遗传多样性

• 发表时间: 2023
• 作者: Kawakubo Ayaka;Gallois Jean-Luc;Nakahara Kenji S.;佐藤光彦・岩上哲史・福西詩奏・杉浦快・保田謙太郎・磯部 祥子・白澤健太
• 通讯作者: 佐藤光彦・岩上哲史・福西詩奏・杉浦快・保田謙太郎・磯部 祥子・白澤健太