Identification of gene networks associated with secondary cell wall layer structure.
鉴定与次生细胞壁层结构相关的基因网络。
基本信息
- 批准号:22H02412
- 负责人:
- 金额:$ 11.15万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
- 财政年份:2022
- 资助国家:日本
- 起止时间:2022-04-01 至 2025-03-31
- 项目状态:未结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
二次壁はセルロースミクロフィブリルの配向角度の違いにより3層に区別される。セルロースミクロフィブリルの配向は表層微小管により制御されており、表層微小管とセルロースミクロフィブリルの配向には同調的な変化が見られる。しかし、二次壁の層構造が構築される過程で表層微小管の配向がどのような分子基盤により制御されているかについて多くの謎が残されている。研究代表者らはポプラを用いた遺伝子スクリーニングの結果、S2層の形成を担う転写因子(TF26およびTF26b)を同定している。そこで、本研究ではTF26/26bを起点としたS2層の形成機構の解明とTF26/26bの進化的機能保存性の解明を試みる。まず、トランスクリプトーム解析によりTF26/TF26bの下流で機能する微小管関連タンパク質の同定を行った。TF26およびTF26bにグルココルチコイド受容体(GR)を連結した融合遺伝子を導入したポプラ過剰発現体(35S:TF26-GR、35S:TF26b-GR)を誘導剤(デキサメタゾン)で処理し、一定時間おきにサンプリングを行った。その後、total RNAを抽出し、次世代シークエンサーを用いて発現遺伝子の情報を取得した。次に、二次壁形成への関与が推定される微小管関連タンパク質(10遺伝子)について、CRISPR/Cas9システムを用いた遺伝子欠損ポプラの作製に着手した。CRISPR/Cas9用の遺伝子コンストラクトを作製後、ポプラへ形質転換を行い、再生個体が得られた遺伝子についてはゲノム編集パターンの解析を行った。また、TF26/26bの進化的機能保存性を解明するために、スギのTF26/26bオルソログ(2遺伝子)について、CRISPR/Cas9用の遺伝子コンストラクトを作製した後、スギ培養細胞へ形質転換を行い、遺伝子欠損スギの作製に着手した。
The secondary wall is different from each other in terms of the angle of alignment. The microtubules in the table, the microtubules, the microtubules. The process table shows that the micro-tubes are used in the process of manufacturing the microtubes. The molecular basis of the microtubes is used to make the system. The representative of the study used the TF26 writing factor (TF26 writing factor) to determine the accuracy of the results. In this study, the starting point of TF26/26b is to understand the mechanism of TF26/26b evolution. In this case, you can use the TF26/TF26b machine to make sure that the microtubes are in line with each other. The TF26 is responsible for the health care of the recipient (GR), the link, the fusion device, the operator (35S:TF26-GR, 35S:TF26b-GR), and the operator (35S:TF26-GR, 35S:TF26b-GR). After a certain period of time, you will be able to do so. After that, total RNA will pull out, and the next generation will use it to realize that you are in love with each other. The secondary and secondary walls are formed by the inference, the tubules, the tubules, and the CRISPR/ Cas9, respectively. After the CRISPR/Cas9 has been used as a tool, the data will be changed in the shape of the file, and the regenerated body will be able to analyze the line in the editing set. The system, the TF26/26b improved machine can be used to understand the performance of the computer, the TF26/26b system, the computer, the computer, the
项目成果
期刊论文数量(11)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
nst/snd multiple mutants raise new questions on xylem cell differentiation and secondary cell wall formation.
nst/snd 多重突变体提出了有关木质部细胞分化和次生细胞壁形成的新问题。
- DOI:
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Takata Naoki;Tsuyama Taku;Nagano Soichiro;Baba Kei’ichi;Yasuda Yuko;Sakamoto Shingo;Mitsuda Nobutaka;Taniguchi Toru
- 通讯作者:Taniguchi Toru
モウソウチクにおけるフェルラ酸転移酵素候補遺伝子PeBAHD1の発現制御に関する転写因子の探索
寻找调节中华木阿魏酸转移酶候选基因PeBAHD1表达的转录因子
- DOI:
- 发表时间:2023
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:宗像典哲;津山濯;雉子谷佳男;高田直樹;坂本真吾;光田展隆
- 通讯作者:光田展隆
ナノポアシークエンサーを用いたゲノム編集パターンの解析手法の最適化
使用纳米孔测序仪优化基因组编辑模式的分析方法
- DOI:
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:佐藤良介;七里吉彦;永野聡一郎;武津英太郎;高田直樹
- 通讯作者:高田直樹
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
高田 直樹其他文献
Structure-function relationship and engineering of dextran glucosidase from Streptococcus mutans
变形链球菌葡聚糖葡萄糖苷酶的结构-功能关系及工程改造
- DOI:
- 发表时间:
2007 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
Nishimura M;Okuyama M;Mori H;Kimura A;高田 直樹;W. Saburi - 通讯作者:
W. Saburi
モデル樹木・ポプラにおける生物時計関連遺伝子の分子進化過程
模式树杨生物钟相关基因的分子进化过程
- DOI:
- 发表时间:
2008 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
Hondoh H;Otsuka H;Saburi W;Mori H;Okuyama M;Kimura A;高田 直樹 - 通讯作者:
高田 直樹
低温ストレスにより生じるイネ酸化タンパク質の解析
低温胁迫引起的水稻氧化蛋白分析
- DOI:
- 发表时间:
2008 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
Nishimura M;Okuyama M;Mori H;Kimura A;高田 直樹;W. Saburi;丹野 有里子 - 通讯作者:
丹野 有里子
Schwanniomyces occidentalis 由来 GH31 α-glucosidaseへの変異導入によるグルコシド結合選択性の変換
通过向西方雪旺酵母 (Schwanniomyces occidentalis) 的 GH31 α-葡萄糖苷酶中引入突变来改变葡萄糖苷键选择性
- DOI:
- 发表时间:
2008 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
Hondoh H;Otsuka H;Saburi W;Mori H;Okuyama M;Kimura A;高田 直樹;西村茉利子 - 通讯作者:
西村茉利子
Solanum属2種の耐凍性の違いに関連した形態学的比較
两种茄属植物耐冻性差异的形态比较
- DOI:
- 发表时间:
2008 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
Hondoh H;Otsuka H;Saburi W;Mori H;Okuyama M;Kimura A;高田 直樹;西村茉利子;伊藤 俊平 - 通讯作者:
伊藤 俊平
高田 直樹的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('高田 直樹', 18)}}的其他基金
目の前に3Dの実像が浮かぶインタラクティブホログラフィック空中ディスプレイの開発
开发交互式全息航空显示器,让 3D 真实图像漂浮在您眼前
- 批准号:
24K15048 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
二次壁の層構造を作り出す分子基盤の解明
阐明产生次生壁层状结构的分子基础
- 批准号:
23K23677 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
リサーチ・テクノロジーの発展と産学の相互作用:質量分析計の事例
研究技术的发展和产学界的互动:以质谱仪为例
- 批准号:
22K13461 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
階調表現と高精細化が可能な時空間分割電子ホログラフィによる実時間三次元動画再生
使用时空分割电子全息技术进行实时3D视频播放,具有层次表现和高清晰度
- 批准号:
21K11996 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
自律的な現場のジレンマとその解決: 共同研究開発のマネジメントに関する実証研究
自主领域困境及其解决:联合研发管理的实证研究
- 批准号:
16J00415 - 财政年份:2016
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
木本植物の休眠・凍結耐性獲得における光周性関連因子の機能解析
光周期因子在木本植物休眠/耐冻性获得中的功能分析
- 批准号:
07J09498 - 财政年份:2007
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
蛋白質リン酸化反応イメージングによるシナプス可塑性のメカニズム解析
蛋白质磷酸化成像突触可塑性机制分析
- 批准号:
98J01304 - 财政年份:1998
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
相似海外基金
電極積層構造制御による二次元半導体のショットキー障壁制御
通过控制电极堆叠结构控制二维半导体中的肖特基势垒
- 批准号:
24KJ0622 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
扇状地特有の地層構造にある水田の地下水涵養機能の評価とその将来予測
冲积扇特有地质结构稻田地下水补给功能评价及未来预测
- 批准号:
24K07655 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
強磁性多層構造を用いた新規ジョセフソン接合の開発
利用铁磁多层结构开发新型约瑟夫森结
- 批准号:
24K08238 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
原子層物質の積層構造による新奇量子物性・新規機能の理論開発
利用原子层材料的堆叠结构理论发展新的量子物理性质和新功能
- 批准号:
24K06968 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
超階層構造スケルタル結晶化学とメゾスコピック機能
超层次骨架晶体化学和介观功能
- 批准号:
24H00470 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
ナノをみる巨大顕微鏡を用いた食試料の階層構造解析
使用巨型纳米显微镜对食品样品进行层次结构分析
- 批准号:
24K08742 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
含水鉱物の階層構造イメージングによる小惑星最表層の含水化/脱水化統一モデル
基于水合矿物分层结构成像的小行星最外层水合/脱水统一模型
- 批准号:
24K17110 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
階層構造を形成する椎間板の生体力学場の再現とヒト椎間板オルガノイドへの展開
形成分层结构的椎间盘生物力学场的再现及其在人体椎间盘类器官中的应用
- 批准号:
24K03263 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
高所作業検査の省力化を目的としたサブテラヘルツ波による複層構造の理解
使用亚太赫兹波了解多层结构,以实现高空作业的省力检查
- 批准号:
24K07967 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
生命現象の多階層構造を記述する数理モデルの構築およびそれを用いた解析手法の開発
描述生物现象多层结构的数学模型的构建以及使用它们的分析方法的开发
- 批准号:
24K16961 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 11.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists