Tissue-specific regulation of translation initiation mediated by ribosome heterogeneity

核糖体异质性介导的翻译起始的组织特异性调控

• 批准号: 22H02549
• 负责人: 藤原 俊伸
• 金额: $ 11.07万
• 依托单位: Kindai University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22H02549/
• 关键词: 翻訳制御; リボソーム; RNA結合蛋白質; RNA結合タンパク質

本年度では、1.ポリオウイルスIRESの翻訳開始機構をモデルとしたリボソーム結合因子による神経細胞特異的翻訳開始制御の分子機構、2.HAVIRESの翻訳開始機構をモデルとしたリボソーム結合因子による肝細胞特異的翻訳開始制御の分子機構の２種類のIRES依存的な翻訳開始の分子機構を生化学的解析した。その結果、これまでに発見しているポリオウイルスの翻訳を制御するリボソーム結合因子の変異体を得ることに成功し、これら変異体がポリオウイルスの翻訳を制御不能となっていることを署名した。さらに、肝細胞由来のリボソーム結合因子がHAV IRES依存的な翻訳を活性化することを発見した。HAVのIRES依存的翻訳機構に関わるリボソーム結合因子同定と性状解析を足がかりに、組織特異的タンパク質合成制御機構とウイルスのトロピズムとの相関を明らかにすることを試みている。分担者の三嶋は、神経細胞および肝細胞由来の培養細胞系でリボソームプロファイリングを実施するための条件検討を行なった。またヒト培養細胞のデータをもとに翻訳効率とRNA制御配列を紐づけるための解析パイプラインを構築した。さらに分担者の伊藤は、哺乳類由来再構成型翻訳システムのすべての因子をヒト由来とするために、それまで異種であるマウス由来かつN末端を削っていたeIF4Gについて、ヒト由来eIF4G1の全長の大量発現系を構築し、精製した。これまでのeIF4Gとほぼ同じ効率で試験管内翻訳システムが機能することを確認した。また代表者は、神経結合タンパク質と翻訳開始因子eIF3との相互作用を明らかにし、神経細胞独自の翻訳システムについて新たな知見を得、論文誌上で発表した。

This year, we have: 1. Molecular mechanisms for the regulation of neuronal cell specific turnover initiation mechanisms for IRES binding factors; 2. Biochemical analysis of molecular mechanisms for IRES dependent turnover initiation mechanisms for hepatocyte specific turnover initiation mechanisms for IRES binding factors The results of this study are as follows: 1. The results of this study are as follows: 1. In this paper, the origin of liver cells and the expression of binding factors HAV IRES dependent on the activation of this protein has been identified. HAV's IRES dependent regulatory mechanisms include: a combination of factors; a characteristic analysis; a tissue-specific regulatory mechanism; and a correlation analysis. A study of the conditions for the development of cultured cell lines derived from neurons and hepatocytes The expression of RNA in cultured cells was determined by DNA sequencing. A large number of development systems for the entire length of eIF4G1 were constructed and refined. The eIF4G and eIF4G are the same function as the test tube. The interaction between the receptor and the initiation factor eIF3 was revealed in the journal.

项目成果

Revisit of miRISC-mediated translation regulation

重新审视 miRISC 介导的翻译调控

• 发表时间: 2022
• 作者: Mai Miyao;Ayumi Mori;Yurika Sakamura;Takumi Tomohiro;Akira Fukao;Yoshinori Funakami;Shungo Adachi;Tohru Natsume;Koji Onomoto;Mitsutoshi Yoneyama;Toru Suzuki;Tadashi Yamamoto and Toshinobu Fujiwara
• 通讯作者: Tadashi Yamamoto and Toshinobu Fujiwara

神経特異的RNA結合タンパク質HuDは翻訳開始因子eIF3と相互作用する

神经特异性 RNA 结合蛋白 HuD 与翻译起始因子 eIF3 相互作用

• 发表时间: 2022
• 作者: 西阪 皓理;友廣 拓生;深尾 亜喜良;船上 仁範;藤原 俊伸
• 通讯作者: 藤原 俊伸

The analysis of hepatitis C virus IRES dependent translation by MAPK signaling pathway

MAPK信号通路对丙型肝炎病毒IRES依赖翻译的分析

• 发表时间: 2022
• 作者: Sakiko Tsujita;Takumi Tomohiro;Akira Fukao;Yoshinori Funakami;Ryosuke Satoh;Reiko Sugiura;Toshinobu Fujiwara
• 通讯作者: Toshinobu Fujiwara

Positive and negative regulation of poliovirus IRES translation by tissue-specific factors

组织特异性因素对脊髓灰质炎病毒 IRES 翻译的正向和负向调节

• 发表时间: 2022
• 作者: Hikaru Sakamoto;Akitoshi Sadahiro;Akira Fukao;Yoshinori Funakami;Naoki Takizawa;Osamu Takeuchi;Toshinobu Fujiwara
• 通讯作者: Toshinobu Fujiwara

A novel factor related to miRISC-mediated translation repression

与 miRISC 介导的翻译抑制相关的新因素

• 发表时间: 2022
• 作者: Ayumi Mori;Mai Miyao;Yurika Sakamura;Takumi Tomohiro;Akira Fukao;Yoshinori Funakami;Shungo Adachi;Tohru Natsume;Koji Onomoto;Mitsutoshi Yoneyama;Toru Suzuki;Tadashi Yamamoto and Toshinobu Fujiwara
• 通讯作者: Tadashi Yamamoto and Toshinobu Fujiwara