Integrated single-cell multiomics analysis of primate brain for elucidating the molecular basis of human uniqueness

ヒトらしさをつかさどるヒト特異的脳細胞を同定するために，ヒトと類人猿の死後脳を用いたシングルセル比較トランスクリプトーム解析を行った．ヒトや類人猿は実験動物ではないため，新鮮な脳試料を入手することが難しい．そのため，シングルセルトランスクリプトーム解析に通常用いられる生細胞ではなく，凍結試料でも使用が可能であると考えられている細胞核を用いたシングル核トランスクリプトーム解析の実験プロトコル・解析パイプラインを構築し，実験を推進した．令和4年度は，短鎖型シーケンサーを用いたハイスループットトランスクリプトーム解析と長鎖型シーケンサーを用いた1細胞完全長トランスクリプトーム解析を行った．短鎖型シーケンサーを用いた解析では，ヒト2検体，チンパンジー1個体，ゴリラ1個体死後脳の前頭前野と海馬からサンプルあたり平均7,000個の細胞核の遺伝子発現データを取得した．情報解析の結果，それぞれのサンプルから１細胞核あたり平均2,500遺伝子の発現データを取得することができた．前頭前野と海馬由来の合計8サンプルを統合して解析した結果，合計28種類の細胞タイプを同定することができた．各細胞タイプにおける3種間の構成比を検討した結果，3種間で大きな偏りが認められる細胞タイプを同定した．特に，ミクログリアにおいてはヒト特異的な細胞タイプの存在が示唆された．長鎖型シーケンサーを用いた1細胞完全長トランスクリプトーム解析に関しては，シーケンス結果を取得し，解析中である．

ヒトらしさをつかさどるヒト特異的脳細胞を同定するために，ヒトと類人猿の死後脳を用いたシングルセル比較トランスクリプトーム解析を行った．ヒトや類人猿は実験動物ではないため，新鮮な脳試料を入手することが難しい．そのため，シングルセルトランスクリプトーム解析に通常用いられる生細胞ではなく，凍結試料でも使用が可能であると考えられている細胞核を用いたシングル核トランスクリプトーム解析の実験プロトコル・解析パイプラインを構築し，実験を推進した．令和4年度は，短鎖型シーケンサーを用いたハイスループットトランスクリプトーム解析と長鎖型シーケンサーを用いた1細胞完全長トランスクリプトーム解析を行った．短鎖型シーケンサーを用いた解析では，ヒト2検体，チンパンジー1個体，ゴリラ1個体死後脳の前頭前野と海馬からサンプルあたり平均7,000個の細胞核の遺伝子発現データを取得した．情報解析の結果，それぞれのサンプルから１細胞核あたり平均2,500遺伝子の発現データを取得することができた．前頭前野と海馬由来の合計8サンプルを統合して解析した結果，合計28種類の細胞タイプを同定することができた．各細胞タイプにおける3種間の構成比を検討した結果，3種間で大きな偏りが認められる細胞タイプを同定した．特に，ミクログリアにおいてはヒト特異的な細胞タイプの存在が示唆された．長鎖型シーケンサーを用いた1細胞完全長トランスクリプトーム解析に関しては，シーケンス結果を取得し，解析中である．