APOBEC3Aによる抗ウイルス作用と変異導入の分子機序に関する新たな展開

APOBEC3A抗病毒作用及突变导入分子机制的新进展

• 批准号: 22H02882
• 负责人: 岩谷 靖雅
• 金额: $ 11.07万
• 依托单位: National Hospital Organization Nagoya Medical Center
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-22H02882/
• 关键词: レトロウイルス; APOBEC3A; 変異; 抗ウイルス作用; RNA; 核酸; 構造

本研究課題では、これまで想定していなかった、APOBEC3AによるRNA編集という視点からAPOBEC3Aによる抗レトロウイルス作用と変異導入効果の分子機序、ならびに細胞内制御機序を精査することを目的で研究を行っている。本年度は、1)APOBEC3ファミリーのうち、APOBEC3AのみがRNA編集効果を示す理由の解明、2)レトロウイルの遺伝的多様性への効果について進展があった。まず、APOBEC3AのRNA編集における基質特異性として、RNAの二次構造上のloopやbulge領域に存在するUUCトリヌクレオチドを好むことがわかった。通常、DNAとRNAとではリボースの違いにより塩基間距離が異なり、RNAのUUCはAPOBEC3の基質認識部位への配位に不適である。しかし、RNAのloopやbulge(U-shape構造)ではリボースのsugar packerがDNA型(C2´-endo pucker)に変化するため、UUCの塩基間距離はDNAと近似し、APOBEC3の基質認識部位に認識されることがわかった。さらに、APOBEC3ファミリーのうち、APOBEC3Aのみが酵素基質認識領域のloop1配列が短いため、U-shapeのRNAとの立体障害がなく結合できることが分子構造計算により判明した。これらの理由から、APOBEC3Aのみが高効率なRNA編集作用をもつと考えられた (Nakata et al. NAR 2023)。レトロウイルスの遺伝的多様性への影響については、APOBEC3AによるHIV-1の感受性には違いがあることを明らかにした。マクロファージ指向性HIV-1では、T細胞指向性HIV-1に比べAPOBEC3Aに抵抗性をもつことを見出した。APOBEC3AはHIV-1の遺伝的多様性に影響を与え、結果的にHIV-1に細胞指向性による感受性の違いが生じたと考えられた。

This research topic is based on the scenario of APOBEC3A and the RNA compilation of APOBEC3A from the viewpoint of APOBEC3A The purpose of the molecular mechanism of the action and differential introduction effect of るレトロウイルス, and the intracellular control mechanism of ならびにをPurpose and research is done. This year, 1) APOBEC3ファミリーのうち, APOBEC3AのみがRNA compilation effect The explanation of the reason why the effect is shown, 2) The multi-effects of the レトロウイルの伝 and the progress of the があった.まず、APOBEC3AのRNA compilationにおけるMatrix specificityとして、RNAのsecondary structureのloopやbulge field existsするUUCトリヌクレオチドを好むことがわかった. Normally, DNA and RNA are separated by the distance between bases, and RNA UUC and APOBEC3 substrate recognition sites are coordinated and coordinated.しかし、RNAのloopやbulge(U-shape structure)ではリボースのsugar packerがDNA type(C2´-endo pucker), the distance between the bases of UUC, the distance between DNA and the approximation of DNA, and the substrate recognition site of APOBEC3, the recognition of the substrate.さらに、APOBEC3ファミリーのうち、APOBEC3Aのみがenzyme matrix recognition fieldのloop1 arrangementがいため, U-shape のRNA とのstereo-hazard がなく combined with できることが molecular structure calculation により clarification した.これらのREASON から、APOBEC3A のみがHigh-efficiency RNA editing function をもつとtestえられた (Nakata et al. NAR 2023). The multiple influences of レトロウイルスの伝, APOBEC 3AによるHIV-1のsensitivityにはviolationいがあることを明らかにした. HIV-1 directed HIV-1, T-cell directed HIV-1, APOBEC3A resistant, HIV-1 resistant. The polymorphism of APOBEC3A and HIV-1 genes has an impact on the cell directivity and sensitivity of HIV-1 cells.

项目成果

抗HIV/SIVタンパク質である二量体cpzA3Hの生化学的な特徴

抗 HIV/SIV 蛋白二聚体 cpzA3H 的生化特性

• 发表时间: 2022
• 作者: 松岡和弘;中田佳宏;大出裕高;大野美希;久保田舞;杉本温子;岩谷靖雅
• 通讯作者: 岩谷靖雅

Blocking effect of desktop air curtain on aerosols in exhaled breath

桌面风幕对呼出气中气溶胶的阻挡效果

• DOI: 10.1063/5.0086659
• 发表时间: 2022
• 期刊: AIP Advances
• 影响因子: 1.6
• 作者: Takamure Kotaro;Sakamoto Yasuaki;Yagi Tetsuya;Iwatani Yasumasa;Amano Hiroshi;Uchiyama Tomomi
• 通讯作者: Uchiyama Tomomi

Evaluation of the Geenius HIV 1/2 confirmatory assay for HIV-2 samples isolated in Japan

对日本分离的 HIV-2 样本的 Geenius HIV 1/2 验证分析的评估

• DOI: 10.1016/j.jcv.2022.105189
• 发表时间: 2022
• 期刊: Journal of Clinical Virology
• 影响因子: 8.8
• 作者: Shigemi Urara;Yamamura Yoshimi;Matsuda Masakazu;Okazaki Reiko;Kubota Mai;Ibe Shiro;Nemoto Michiko;Maejima-Kitagawa Masami;Sukegawa Sayaka;Imahashi Mayumi;Kikuchi Tadashi;Sugiura Wataru;Iwatani Yasumasa;Hachiya Atsuko;Yokomaku Yoshiyuki
• 通讯作者: Yokomaku Yoshiyuki

SARS-CoV-2ゲノムの遺伝的多様性に対するAPOBEC3の影響

APOBEC3 对 SARS-CoV-2 基因组遗传多样性的影响

• 发表时间: 2022
• 作者: 中田佳宏;大出裕高;久保田舞;今橋真弓;横幕能行;岩谷靖雅
• 通讯作者: 岩谷靖雅