身体活動とVTI1A・TCF7L2遺伝子および大腸癌・乳癌リスクのコホート研究

令和4年度は、佐賀J-MICCスタディのベースライン調査時に採取された末梢血DNAサンプルを用いて、大腸癌および乳癌の発症との関連が予想されるVTI1A遺伝子内の2か所の一塩基多型（rs12241008, rs10506868）、およびTCF7L2遺伝子内の3か所の一塩基多型（rs11196172, rs7903146, rs7904519）の遺伝子多型の測定をTaqMan法（リアルタイムPCR法）を用いて行った。全12,000検体のうち、約10,500検体のDNAサンプルの測定を終了した。令和4年度の当初の研究計画としては「VTI1A遺伝子の一塩基多型を2か所のみ（rs12241008,　rs10506868）測定し（上述のTCF7L2遺伝子内の3か所の一塩基多型は未だ行わずに）、これと同じVTI1A遺伝子のDNAメチル化の測定をパイロシーケンス法を用いて進める」というものだった。しかし、令和4年度の夏の時点で、DNAメチル化測定の最新機器（キアゲン社製Pyromark Q48 Autoprep[これまで使用していたPyromark Q24の約2倍の速度でDNAメチル化の測定を進める事が可能]）が共同機器センターに令和5年度に導入される事が決定していたので、VTI1A遺伝子のDNAメチル化測定は次年度の令和5年度に新しいPyromark Q48 Autoprepを用いて行う事にして、令和4年度は実施しなかった。代わりに、令和4年度には予定していなかったTCF7L2遺伝子内の3か所の一塩基多型（rs11196172, rs7903146, rs7904519）の遺伝子多型の測定を追加して実施した次第である。

令和4年度は、佐賀J-MICCスタディのベースライン調査時に採取された末梢血DNAサンプルを用いて、大腸癌および乳癌の発症との関連が予想されるVTI1A遺伝子内の2か所の一塩基多型（rs12241008, rs10506868）、およびTCF7L2遺伝子内の3か所の一塩基多型（rs11196172, rs7903146, rs7904519）の遺伝子多型の測定をTaqMan法（リアルタイムPCR法）を用いて行った。全12,000検体のうち、約10,500検体のDNAサンプルの測定を終了した。令和4年度の当初の研究計画としては「VTI1A遺伝子の一塩基多型を2か所のみ（rs12241008,　rs10506868）測定し（上述のTCF7L2遺伝子内の3か所の一塩基多型は未だ行わずに）、これと同じVTI1A遺伝子のDNAメチル化の測定をパイロシーケンス法を用いて進める」というものだった。しかし、令和4年度の夏の時点で、DNAメチル化測定の最新機器（キアゲン社製Pyromark Q48 Autoprep[これまで使用していたPyromark Q24の約2倍の速度でDNAメチル化の測定を進める事が可能]）が共同機器センターに令和5年度に導入される事が決定していたので、VTI1A遺伝子のDNAメチル化測定は次年度の令和5年度に新しいPyromark Q48 Autoprepを用いて行う事にして、令和4年度は実施しなかった。代わりに、令和4年度には予定していなかったTCF7L2遺伝子内の3か所の一塩基多型（rs11196172, rs7903146, rs7904519）の遺伝子多型の測定を追加して実施した次第である。