Construction of a disease type discriminator based on cell histomorphology and realization of a platform for atypicality analysis of malignant lymphomas

本研究の目標は、悪性リンパ腫の病型ごとに固有な、細胞組織の異型性を定量評価するための形態特徴を明らかにすることである。そのためにまず、H&E染色病理画像からの病型識別器を構築する。病型識別器の実現には、細胞核ごとに病型識別への寄与度を求めるために、H&E染色画像をCell-Graphで記述した上でGraph Neural Networkを採用する。Cell-Graphは細胞核をノードとし、近接する細胞核どうしを辺で結んで得られる病理画像表現である。構築した病型識別器に基づき、病理医に解釈可能な形態特徴による異型性の定量評価基準を明らかにするために、Concept Attributionの枠組みを採用する。病理医に解釈可能な形態特徴の冗長なリストを用意し、細胞核ごとに求めた病型識別への寄与度と併せることにより各形態特徴について病型の分離度を評価する。分離度の高い形態特徴を基準として採用する。2022年度にはまず、H&E染色病理画像からの病型識別器を構築した。病型識別器の実現には、細胞核ごとに病型識別への寄与度を求めるために、H&E染色画像をCell-Graphで記述した上でGraph Neural Networkと画像パッチをそのまま入力するCNNを基礎とする手法の双方を採用した。Cell-Graphは細胞核をノードとし、近接する細胞核どうしを辺で結んで得られる病理画像表現である。構築した病型識別器に基づき、病理医に解釈可能な形態特徴による異型性の定量評価基準を明らかにするために、Concept Attributionの枠組みを採用した。この枠組みでは反事実画像を生成することにより病型識別に寄与する術語を明らかにする。2022年度にはCNNを基礎とする手法の解析に注力し、病型に関する反事実画像の生成法を構築した。

本研究の目標は、悪性リンパ腫の病型ごとに固有な、細胞組織の異型性を定量評価するための形態特徴を明らかにすることである。そのためにまず、H&E染色病理画像からの病型識別器を構築する。病型識別器の実現には、細胞核ごとに病型識別への寄与度を求めるために、H&E染色画像をCell-Graphで記述した上でGraph Neural Networkを採用する。Cell-Graphは細胞核をノードとし、近接する細胞核どうしを辺で結んで得られる病理画像表現である。構築した病型識別器に基づき、病理医に解釈可能な形態特徴による異型性の定量評価基準を明らかにするために、Concept Attributionの枠組みを採用する。病理医に解釈可能な形態特徴の冗長なリストを用意し、細胞核ごとに求めた病型識別への寄与度と併せることにより各形態特徴について病型の分離度を評価する。分離度の高い形態特徴を基準として採用する。2022年度にはまず、H&E染色病理画像からの病型識別器を構築した。病型識別器の実現には、細胞核ごとに病型識別への寄与度を求めるために、H&E染色画像をCell-Graphで記述した上でGraph Neural Networkと画像パッチをそのまま入力するCNNを基礎とする手法の双方を採用した。Cell-Graphは細胞核をノードとし、近接する細胞核どうしを辺で結んで得られる病理画像表現である。構築した病型識別器に基づき、病理医に解釈可能な形態特徴による異型性の定量評価基準を明らかにするために、Concept Attributionの枠組みを採用した。この枠組みでは反事実画像を生成することにより病型識別に寄与する術語を明らかにする。2022年度にはCNNを基礎とする手法の解析に注力し、病型に関する反事実画像の生成法を構築した。