大腸菌ゲノムの全体像・ゲノムの機能的全体像

大肠杆菌基因组整体图/基因组功能图

• 批准号: 02237104
• 负责人: 中田 篤男
• 金额: $ 17.92万
• 依托单位: Osaka University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 1990
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1990 至 1991
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-02237104/
• 关键词: リン酸レギュロン; CRPレギュロン; <cyo>___ーオペロン; 鞭毛レギュロン; SSBレギュロン; H^+ーATPase; 細胞の成長と分裂; 熱ショック・プロモ-タ-

本研究班は,「大腸菌ゲノムの全体像」の中で「ゲノムの機能的全体像」を分担している.すなわち,大腸菌の遺伝子群の機能とその発現制御系のネットワ-クを拡大していって,ゲノム全体の機能を明らかにすることが最終の目標である.本年度,遺伝子発現に関して中田と牧野はリン酸レギュロンに属する<phn>___ーオペロン(炭素ーリン・リア-ゼを含む)がペリプラズム中の結合蛋白質に依存した能動輸送系を含み,Kー12株では機能していないこと,また,PhoMがPhoMーORF2とPhoBをリン酸化すること(cross talk)を明らかにした.饗場は8個のCRPーcAMP感受性プロモ-タ-の染色体上の座位と塩基配列を決定し,CRPの転写終結配列がmRNAを安定化して遺伝子発現を正に調節することを証明した.安楽は<cyoABCDE>___ーオペロン(チトクロ-ムb__ー_<562>ーo__ー複合体)をクロ-ニングし,その発現調節と好気的呼吸鎖でプロトンポンプとして働く本酵素複合体の機能の解析を行った.沓掛は鞭毛遺伝子クラスタ-の領域Iの上流部分の塩基配列を決定し,鞭毛形成に必須の遺伝子を発見した.また,領域IIIの<fliA>___ーー<fliB>___ーの間にも新しい遺伝子を発見した.嶋本は一本鎖DNA結合蛋白質(SSB)が遺伝子発現調節との関係で細胞内である濃度に保たれる機構を明らかにしつつある.二井はヌクレオチド関連蛋白質の共通ドメインに突然変異を導入してH^+ーATPaseの活性中心の構造を解析し,また,H^+に対してゲ-ト機能をもつサブユニットについても同様の解析を行った.松橋は細胞の成長と分裂に関与する<mra>___ー領域(遺伝子地図上2分)の<mraY>___ー,<ftsW>___ー,<murCDEFG>___ーと<mre>___ー領域(同71分)の<orfEF>___ーの全塩基配列を決定し,<mraY>___ー,<murD>___ー,<mreCD>___ーの機能を明らかにした.由良は熱ショック遺伝子発現誘導の初期反応の一つがシグマー32合成の翻訳レベルの脱抑制で,それにはmRNAの二次構造が重要な役割を果たすこと,また,ATP依存プロテア-ゼの調節サブユニット<clpA>___ーのアナログである<clpB>___ーも熱ショックプロモ-タ-をもつことを明らかにした.

In this research class, "the whole picture of the fungus, the whole picture of the machine," the whole picture of the machine, share the picture. The machine of the subgroup of bacteria is able to control the system, and the whole machine is able to tell you that the most important information is available. This year, Nakata Makino has been found to be a member of the genus lt;phn&gt. In this paper, the binding protein binding protein is linked to the energy transport system, and the K-12 plant is sensitive to carbon dioxide, carbon dioxide, carbon dioxide, There are 8 CRP cAMP receptivity markers on the chromosome. The base row on the chromosome is determined, and the CRP column is assigned. The mRNA is stabilized and the baby is stable. The complex of ampoule and lt;cyoABCDE>___ was detected by the combination of enzyme and enzyme, and the combination of enzyme and enzyme was analyzed by the machine. In the field I, the upper part of the flagella is determined, and the formation of the flagellum must be recognized. In the field of III, the field of III & lt;fliA>___, and lt;fliB>___, there is a new interest in the field of communication. In this book, the DNA binding protein (SSB) assay is used to detect the intracellular concentration of DNA in the cell. The machine is responsible for the detection of the protein. In the second well, we need to know that the protein is in common use. All of a sudden, the active center of H^ + ATPase is inserted into the active center of H^. The active center of H^, H^. Cell growth, division, division, & lt;mra>___, & lt;mraY>___, & lt;ftsW>___, & lt;murCDEFG>___ & lt;mre>___, (same as 71) & lt;orfEF>___, & lt;mraY>___, & lt MurD>___, & lt;mreCD>___, the machine can tell you how to run a computer. In the initial stage of the experiment, the anti-suppression system was synthesized in the first half of the year, and the mRNA was used to remove the inhibition. The second time, it was important to cut the fruit. The ATP depends on the device, the device, the computer, the ATP, the computer, the lt;clpB&gt. I don't know if I know what I'm going to do.

项目成果

Amemura,M.,K.Makino,H.Shinagawa,and A.Nakata.: "Cross talk to the phosphate regulon of <Escherichia>___ー <coli>___ー by Phom protein:PhoM is a histidine protein kinase and catalyzes phosphorylation of PhoB and PhoMーopen reading frame 2." J.Bacteriol.172. 6

Amemura, M.、K. Makino、H. Shinakawa 和 A. Nakata.：“通过 Phom 蛋白与<埃希氏菌>_____ <大肠杆菌>____ 的磷酸盐调节子进行交流：PhoM 是一种组氨酸蛋白激酶，并且催化PhoB和PhoM的磷酸化－开放阅读框2。” J.Bacteriol.172. 6

Minagawa,J.,H.Nakamura,I.Yamato,T.Mori,and Y.Anraku.: "Transcriptional regulation of the cytochrome b__ー_<562>‥o complex in <Escherichia>___ー coli:gene expression and molecular characterization of the promoter." J.Biol.Chem.265. 11198-11203 (1990)

Minakawa, J.、H. Nakamura、I. Yamato、T. Mori 和 Y. Anraku.：“<大肠杆菌>_____ 中细胞色素 b_____<562>‥o 复合物的转录调控：基因表达和启动子的分子表征。” J.Biol.Chem.265. 11198-11203 (1990)

Takeyama,M.,K.Ihara,Y.Moriyama,T.Noumi,K.Ida,N.Tomioka,A.Itai,M.Maeda,and M.Futai.: "The glycineーrich sequence of the β subunit of <Escherichia>___ー <coli>___ー H^+ーATPase is important for activity." J.Biol.Chem.265. 21279-21284 (1990)

Takeyama, M., K. Ihara, Y. Moriyama, T. Noumi, K. Ida, N. Tomioka, A. Itai, M. Maeda, and M. Futai.：“β亚基富含甘氨酸的序列<埃希氏菌>___ー <大肠杆菌>____ H^+ーATPase 对于活性很重要。” J.Biol.Chem.265. 21279-21284 (1990)

Matsuhashi,M.,F.Ishino,M.Ikeda,H.K.Jung,M.Ueki,A.N.Pankrushina,S.Tomioka,Y.Okada,M.Wachi,and M.D.Song.: "Function of penicillinーbinding proteins and their regulation.H.Kleinkauf and H.v.Do^^¨hren (ed.)," 50 Years of Penicillin Application., (1991)

Matsuhashi, M., F. Ishino, M. Ikeda, H. K. Jung, M. Ueki, A. N. Pankrushina, S. Tomioka, Y. Okada, M. Wachi, and M. D. Song.：“青霉素结合蛋白的功能及其调节.H.Kleinkauf 和 H.v.Do^^¡hren（编辑），“青霉素应用 50 年。”（1991 年）

Yamada,M.,K.Makino,H.Shinagawa,and A.Nakata.: "Regulation of the the phosphate regulon of <Escherichia>___ー <coli>___ー:propterties of <phoR>___ー deletion mutants and subcellular localization of PhoR protein." Mol.Gen.Genet.220. 366-372 (1990)

Yamada, M., K. Makino, H. Shinakawa, 和 A. Nakata.：“<埃希氏菌>___— <大肠杆菌>___— 磷酸盐调节子的调节：<phoR>_____ 缺失突变体的特性和PhoR 蛋白的亚细胞定位。”Mol.Gen.Genet.220. 366-372 (1990)