安定なヘアピン様構造を形成するRNA断片の合成と構造解析

形成稳定发夹样结构的RNA片段的合成和结构分析

• 批准号: 03242202
• 负责人: 平尾 一郎
• 金额: $ 1.66万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 1991
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1991 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-03242202/
• 关键词: DNA・RNAの安定なヘアピン構造; in vitroタンパク質合成系

我々は,すでにGCGAAAGCという配列のDNA断片が異常に安定なヘアピン構造を形成することを発見している。本年度は,この配列のRNA,および一部配列を変えたDNAやRNAの断片を種々合成しそれらの構造を調べた。まずGCGAAAGC配列のRNA断片は,DNAほどではないが,ある程度安定なヘアピン構造を形成することがわかった。DNAとRNAでのこの安定性の違いを調べるために,ステム部分のGC配列に注目し,この部分の配列を変えて種々の断片を合成した。その結果,ステム部分の配列の違いは,DNAとRNAでそれほど差はなく,すべてDNAの断片の方が安定なヘアピン構造を形成することがわかった。これらは,DNAの場合はB型構造,RNAの場合はA型構造の安定性とそれぞれのヘアピン構造の安定性に相関性があることがわかった。またGCGAAGCのDNA断片を合成し,その構造を調べた。この配列は,Aが3つあるGCGAAAGCと同程度の高い安定性を示したので,さらにNMRスペクトルを測定した。その結果このd(GCGAAGC)断片は,d(GCGAAAGC)とは異なったかなり特異な構造を形成していることがわかった。これらのヘアピンDNAの一部は,in vitroのタンパク質合成系でそのタンパク質の合成量に影響をおよぼすことがわかり,種々の工学的応用につながる可能性がでてきた。以上のように申請した内容の大半を達成することが出来た。

The DNA fragments in the GCGAAGC sequence are abnormal and stable. This year, the sequence of RNA, DNA and RNA fragments was modified. The RNA fragment of GCGAAAGC is very stable. DNA RNA is stable, stable, and stable. As a result, the alignment of DNA and RNA fragments is different, and DNA fragments form stable structures. In the case of DNA, the stability of B-type structure and the correlation of A-type structure are discussed. GCGAAGC DNA fragment synthesis, structural adjustment This configuration is shown in the GCGAAGC to have the same degree of high stability as that measured by NMR. As a result, d(GCGAAGC) was formed. d(GCGAAGC) was formed. This is the possibility that a part of DNA is affected by the amount of DNA synthesized in the vitro system and the use of engineering. Most of the above applications were completed.

项目成果

平尾 一郎: "核酸分子内の異常に安定なヘアピン構造について" 日本化学会「化学と工業」2月号, 5 (1992)

平尾一郎：“核酸分子内异常稳定的发夹结构”日本化学学会《化学工业》2月号，5（1992年）

Satoko Yoshizawa: "Ettect of hairpin DNA on poly(phenylalanine)synthesis" Nucleic Acids Symp.Ser.25. 167-168 (1991)

Satoko Yoshizawa：“发夹 DNA 对聚（苯丙氨酸）合成的影响”核酸 Symp.Ser.25。

Ichiro Hirao: "Stabilization of mRNA in an Escherichia coli cellーfree translation system" FEBS Letter.

Ichiro Hirao：“大肠杆菌无细胞翻译系统中 mRNA 的稳定性”FEBS Letter。

Ichiro Hirao: "Extraordinarily stable miniーhairpins formed by the DNA fragment d(GCGAAAGC)and its sequence variants" Nucleic Acids Res.

Ichiro Hirao：“由 DNA 片段 d(GCGAAAGC) 及其序列变体形成的极其稳定的迷你发夹”《核酸研究》。