シアノバクテリアの高温適応を制御する遺伝子の網羅的解析

蓝藻高温适应控制基因综合分析

• 批准号: 16013237
• 负责人: 西山 佳孝
• 金额: $ 2.18万
• 依托单位: Ehime University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2004
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2004 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-16013237/
• 关键词: シアノバクテリア; 光合成; 高温適応; プロテオミクス; DNAマイクロアレイ; 情報伝達系

本研究では、シアノバクテリアSynechocystis sp.PCC 6803を用いて光化学系IIの高温耐性を制御する因子を同定し、高温適応に関与する遺伝子を明らかにすることを目的とした。制御因子はチラコイド膜ルーメンに存在することが以前の研究により明らかになっているため、この画分に局在するタンパク質をプロテオミクスで解析し、候補となるタンパク質を絞った。プロテオーム解析の結果、高温により量的に変化したタンパク質が221個確認され、このうちMALDI-TOF質量分析機により86個のタンパク質を同定できた。その中で、著しく存在量の増えたタンパク質は、機能未知の3つのタンパク質、NADH dehydrogenaseなどであった。本研究では、まず機能未知の3つのタンパク質(Sll0072,Slr1852,Slr1106)に着目し、遺伝子破壊法と生化学的解析により光化学系IIの高温耐性との関連を調べた。Sll0072とSlr1106については遺伝子破壊株を作製することに成功した。このうちslr1106遺伝子破壊株では、光化学系IIの熱安定性が少し減少したため、Slr1106が高温耐性と関係していることが示唆された。これら3つのタンパク質を大腸菌で発現させた結果、Sll0072およびSlr1106は不溶化したが、Slr1852は可溶性画分に得られ、精製することができた。精製したSlr1852タンパク質をチラコイド膜と再構成させた結果、光化学系IIの熱安定性は変化しなかったことから、Slr1852は光化学系IIの高温耐性と関係がないことがわかった。今後、Sll0072とSlr1106についてさらに詳細に解析し、光化学系IIの高温耐性との関連を明らかにしていく予定である。また、今回のプロテオーム解析で十分解析ができなかった低分子量タンパク質についても、再度プロテオーム解析を行う。さらに、現在進行中のマイクロアレイ解析とデータを照合して、高温適応に関与する遺伝子とそのネットワークを明らかにしていく予定である。

In this study, the use of PCC6803 in photochemical system II high temperature resistance control factors to determine the same, high temperature adaptation related to the development of the gene The control factor is the existence of the control factor in the previous study. The control factor is the analysis factor in the previous study. The control factor is the candidate factor in the previous study. The results of the analysis of the list, the quality of the high temperature analysis, the quality of the MALDI-TOF mass analyzer, and the quality of the MALDI-TOF mass analyzer were determined. In the middle of the game, the amount of presence is increased, the function is unknown, and the NADH dehydrogenase is increased. In this study, we investigated the relationship between the high temperature resistance of photochemical system II and the detection, molecular analysis and biochemical analysis of three unknown substances (Sll0072, Slr1852, Slr1106). Sll0072 Slr1106 The thermal stability of the photochemical system II is reduced. The thermal stability of the photochemical system II is reduced. The thermal stability of the photochemical system II is reduced. The results of the detection of E. coli in Sll0072 and Slr1106 are insoluble and Slr1852 soluble. The thermal stability of photochemical system II was improved by refining Slr1852, and the high temperature resistance of photochemical system II was improved by refining Slr1852. In the future, Sll0072 and Slr1106 will be analyzed in detail, and the relationship between high temperature resistance and photochemical system II will be clarified. The analysis of low molecular weight compounds is very important. The analysis of low molecular weight compounds is very important. In the meantime, we are in the process of analyzing and analyzing the situation. We are in the process of analyzing and analyzing the situation.

项目成果

Systematic characterization of the ADP-ribose pyrophosphatase family in the cyanobacterium Synechocystis sp.PCC 6803

蓝藻集胞藻 PCC 6803 中 ADP-核糖焦磷酸酶家族的系统表征

• 发表时间: 2005
• 期刊: J.Bacteriol. (印刷中)
• 作者: Okuda;K.;Hayashi;H.;Nishiyama;Y.
• 通讯作者: Y.

The two-step mechanism of photodamage to photosystem II : step one occurs at the oxygen-evolving complex and step two occurs at the photochemical reaction]

光系统 II 光损伤的两步机制：第一步发生在放氧配合物处，第二步发生在光化学反应处]

• 发表时间: 2005
• 期刊: Biochemistry (印刷中)
• 作者: Ohnishi;N.;Allakhverdiev;S.I.;Takahashi;S.;Higashi;S.;Watanabe;M.;Nishiyama;Y.;Murata;N.
• 通讯作者: N.

Inhibition of the repair of Photosystem II by oxidative stress in cyanobacteria

• DOI: 10.1007/s11120-004-6434-0
• 发表时间: 2005-06
• 期刊: Photosynthesis Research
• 影响因子: 3.7
• 作者: Y. Nishiyama;S. Allakhverdiev;N. Murata

Identification and characterization of NuhA, a novel Nudix hydrolase specific for ADP-ribose in the cyanobacterium Synechococcus sp PCC 7002

• DOI: 10.1016/j.bbapap.2004.03.004
• 发表时间: 2004-06-01
• 期刊: BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-PROTEINS AND PROTEOMICS
• 影响因子: 3.2
• 作者: Okuda, K;Nishiyama, Y;Hayashi, H
• 通讯作者: Hayashi, H

Singlet oxygen inhibits the repair of photosystem II by suppressing the translation elongation of the D1 protein in Synechocystis sp PCC 6803

• DOI: 10.1021/bi036178q
• 发表时间: 2004-09-07
• 期刊: BIOCHEMISTRY
• 影响因子: 2.9
• 作者: Nishiyama, Y;Allakhverdiev, SI;Murata, N
• 通讯作者: Murata, N