Hybrid approach by electron and X-ray structural analysis for large macromolecular assemblies towards pseudo-atomic resolution

通过电子和 X 射线结构分析的混合方法对大型大分子组装体进行伪原子分辨率

• 批准号: 16087207
• 负责人: NAMBA Keiichi
• 金额: $ 129.54万
• 依托单位: Osaka University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2004
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2004 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-16087207/
• 关键词: 1分子計測(SMD); 電子顕微鏡; ナノバイオ; ナノマシン; 分子モーター; 1分子計測 (SMD)

To elucidate the mechanisms of large biological macromolecular complexes underlying various biological functions and to make use of them in the application for medicine and nanotechnology, it is essential to visualize their 3D structures in atomic detail. Electron cryomicroscopy (cryoEM) and image analysis of large complexes, although difficult to achieve atomic resolution by itself, can be combined with X-ray crystallography of component molecules to build pseudo-atomic models of the complexes. We have improved the resolution and throughput of cryoEM image analysis to increase the accuracy and efficiency of atomic model building of the complexes markedly to facilitate our understanding of the biological mechanisms.

为了阐明大型生物大分子复合物在各种生物功能下的作用机制，并将其应用于医学和纳米技术，有必要对其原子细节的三维结构进行可视化。电子低温显微镜（cryoEM）和大型配合物的图像分析虽然难以单独实现原子分辨率，但可以结合成分分子的x射线晶体学来建立配合物的伪原子模型。我们改进了冷冻电镜图像分析的分辨率和吞吐量，显著提高了配合物原子模型构建的准确性和效率，从而促进了我们对生物机制的理解。

项目成果

Crystallization and preliminary X-ray analysis of Salmonella Flil, the ATPase component of the type III flagellar protein-export apparatus.

沙门氏菌 Flil（III 型鞭毛蛋白输出装置的 ATP 酶成分）的结晶和初步 X 射线分析。

• 发表时间: 2006
• 期刊: Acta Crystallographica F62
• 作者: Minamino;T. etal.
• 通讯作者: T. etal.

べん毛III型輸送蛋白質FliJの輸送ATPase FliIに及ぼす影響

鞭毛 III 型转运蛋白 FliJ 对转运 ATPase FliI 的影响

• 发表时间: 2009
• 作者: 伊吹達也;et al
• 通讯作者: et al

Molecular mechanisms of self-assembly and mechanical functions of the bacterial flagellum.

细菌鞭毛自组装的分子机制和机械功能。

• 发表时间: 2008
• 作者: Namba;K.
• 通讯作者: K.

細菌べん毛タンパク質輸送装置の動作機構の遺伝学的機能解析

细菌鞭毛蛋白转运装置运行机制的遗传功能分析

• 发表时间: 2009
• 作者: 南野徹;et al
• 通讯作者: et al

べん毛モーター固定子タンパク質MotBのペリプラズム側断片の機能と結晶化

鞭毛运动定子蛋白MotB周质片段的功能和结晶

• 发表时间: 2007
• 作者: Nakamura;S.;森本雄祐;中村修一;南野徹;守屋奈緒;蔡栄淑;風谷謙一;島田賢史;中村修一;伊吹達也;小嶋誠司;小嶋誠司
• 通讯作者: 小嶋誠司