Development of single particle electron microscopy

单粒子电子显微镜的发展

• 批准号: 16087210
• 负责人: SATO Chikara
• 金额: $ 49.22万
• 依托单位: National Institute of Advanced Industrial Science and Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2004
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2004 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-16087210/
• 关键词: タンパク質; 3次元構造決定; 電子顕微鏡; ナノテクノロジー; 画像情報処理; ニューラルネット; グリッドコンピューティング; クライオ電顕; ニューラルネットワーク; グリッドコンピューティンク; 蛋白質; ナノバイオ; 画像、文章、音声認識等; 神経科学

Single particle 3D reconstruction is a method produced bycombining biochemistry, electron microscopy and image analysis. To improve theresolution and automation of single particle reconstruction (SPR), we have introducedsimulated annealing (SA) to SPR, and developed it. These methods were first applied to theion channels, such as TRPC3, TRPM2 and Orai1, then to CFTR ion pump Prestin, carcinogenesis related keap1, and further to Alzheimer disease related γ-secretase.

单粒子三维重建是生物化学、电子显微镜和图像分析相结合的一种方法。为了提高单粒子重建的解析度和自动化程度，我们将模拟退火法引入到单粒子重建中，并对其进行了发展。这些方法首先应用于离子通道，如TRPC3，TRPM2和ORAI1，然后应用于CFTR型离子泵Prestin，致癌相关的KeAP1，以及进一步应用于阿尔茨海默病相关的γ分泌酶。

项目成果

Maximum likelihood appr oach for picking-up process in sing le particle analysis

单粒子分析中拾取过程的最大似然法

• 发表时间: 2008
• 作者: 永田宏次;筒井志穂;中山二郎;園元謙二;田之倉優;C. Sato;C.Sato;H.Nishiyama;M.Suga;小入羽祐治;佐藤主税;C. Sato;Chikara Sato;H.Nishiyama;Chikara Sato;Kazuhiro Mio;佐藤主税;三尾和弘;佐藤主税;佐藤主税;須賀三雄;西山英利;佐藤主税;三尾和弘;佐藤主税;佐藤主税;三尾和弘;西山英利;M. Kawata
• 通讯作者: M. Kawata

New robust method to create finer two-dimensional average imares in single particle analysis

在单粒子分析中创建更精细的二维平均图像的新稳健方法

• 发表时间: 2007
• 作者: 永田宏次;筒井志穂;中山二郎;園元謙二;田之倉優;C. Sato;C.Sato;H.Nishiyama;M.Suga;小入羽祐治;佐藤主税;C. Sato;Chikara Sato;H.Nishiyama;Chikara Sato;Kazuhiro Mio;佐藤主税;三尾和弘;佐藤主税;佐藤主税;須賀三雄;西山英利;佐藤主税;三尾和弘;佐藤主税;佐藤主税;三尾和弘;西山英利;M. Kawata;川田正晃;M. Kawata;佐藤主税;三尾和弘;T. Ogura;佐藤主税;佐藤主税;佐藤主税;佐藤 主税;佐藤 主税;川田 正晃
• 通讯作者: 川田 正晃

New Scanning Electron Microscope Capable of Observing Cells in Solution.

能够观察溶液中细胞的新型扫描电子显微镜。

• 发表时间: 2009
• 期刊: Microsc Microanal VOL.15
• 作者: Miyazono;K.;Watanabe;M.;Kosinski;J.;Ishikawa;K.;Kamo;M.;Sawasaki;T.;Nagata;K.;Bujnicki;J. M.;Endo;Y.;Tanokura;M. and Kobayashi;I.;H.Nishiyama
• 通讯作者: H.Nishiyama

Three-dimensional reconstruction using transmission EM reveals a swollen, bell-shaped structure of TRPM2 cation channel.

使用透射电镜进行三维重建揭示了 TRPM2 阳离子通道的膨胀钟形结构。

• 发表时间: 2007
• 期刊: J. Biol. Chem. 282(51)
• 作者: Maruyama;Y.;Ogura;T.;Mio;K.;Kiyonaka;S.;Kato;K.;Mori;Y.;*Sato;C.
• 通讯作者: C.

電子顕微鏡を用いた単粒子解析法によるIP3受容体チャンネルの構造解明

使用电子显微镜进行单颗粒分析来阐明 IP3 受体通道的结构

• 发表时间: 2004
• 期刊: AIST Today 9
• 作者: 永田宏次;西口賢三;亀田泰広;山村昭裕;中山二郎;園元謙二;田之倉優;佐藤主税
• 通讯作者: 佐藤主税