線虫の胚発生致死温度感受性変異株の網羅的単離とそのデータベース構築

秀丽隐杆线虫胚胎致死温度敏感突变株的全面分离及数据库构建

• 批准号: 18016015
• 负责人: 中村 邦明
• 金额: $ 4.93万
• 依托单位: Osaka University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2006 至 2007
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18016015/
• 关键词: 線虫; 胚発生; 変異株; データベース; ゲノム; 生命システム

多細胞生物体が構築されるためには受精卵がプログラム通りの細胞分裂、細胞分化、形態形成等を行なう必要があるが、プログラムを構成する遺伝子ネットワークは複雑なため、単純な遺伝子破壊法による解析だけでは発生プログラムの理解はむずかしい。温度感受性変異株は、多細胞体の構築という複雑な生命現象における遺伝子ネットワークの解明に取り組む良い方法論となる。そこで当研究課題は、線虫の温度感受性胚発生変異株を網羅的に取得し、この温度感受性変異株ライブラリーのデータベースを構築することを目的としている。本研究では、平成19年度末までに温度感受性変異株ライブラリーの中の約60株(39遺伝子)の原因遺伝子がクローニングされた。この中には、これまで欠損変異株等がとられているものもあったが、新規の変異株、温度感受性変異株として初めてのものが多く含まれており、この温度感受性変異株ライブラリーは有効に機能することが確認された。変異株の原因遺伝子のほとんどはヒトと高い相同性を示す分子であり、疾病や生物に共通した生命現象に関する有効な解析系を提供すると考えられた。例えば、特に、klp-18(kinesin-like protein-18)とrga-2(rho-gap)はそれぞれ微小管とアクチンを制御する分子であり、胚発生の複数の過程で働いていると考えられるため、温度感受性変異株が有効な解析手段となることが期待される。続いて、外部の研究者がこの温度感受性変異株ライブラリーを閲覧できるように、我々は基盤ゲノム支援班の支援をうけて温度感受性変異株のデータベース(WorTS:Worm TS mutant Database)を構築し、現在そのデータベースを公開した(http://worts.biken.osaka-u.ac.jp)。このデータベースには逆遺伝学の研究局面の線虫研究者がアクセスし、ある特定の遺伝子の変異株を検索することが期待される。このようなデータベースの対象者および予想される使用法を考慮して、データベースは表現型に基づいたものというよりは、遺伝子情報に立脚したものとした。

Multicellular organisms が build さ れ る た め に は fertilized egg が プ ロ グ ラ ム tong り の cell division, cell differentiation and morphogenesis を line な う necessary が あ る が, プ ロ グ ラ ム を constitute す る posthumous son 伝 ネ ッ ト ワ ー ク は complex 雑 な た め, 単 pure な heritage 伝 son broken 壊 method に よ る parsing だ け で は 発 raw プ ロ グ ラ ム の understand は む ず か し い. Temperature sensitivity - different strains は, cell body の build と い う complex 雑 な life phenomenon に お け る posthumous son 伝 ネ ッ ト ワ ー ク の interpret に take good り group む い methodology と な る. そ こ で when research topic は, nematodes の temperature sensitivity embryo 発 born - different strains を snare に obtain し, こ の temperature sensitivity - different strains ラ イ ブ ラ リ ー の デ ー タ ベ ー ス を build す る こ と を purpose と し て い る. This study で は, pp.47-53, at the end of the 19th annual ま で に temperature sensitivity - different strains ラ イ ブ ラ リ ー の の in about 60 strains (39 heritage 伝) cause of の survived 伝 が ク ロ ー ニ ン グ さ れ た. In こ の に は, こ れ ま で owe loss - different strains が と ら れ て い る も の も あ っ た が, new rules の - different strain and temperature sensitivity - different strains と し て early め て の も の が く more contain ま れ て お り, こ の temperature sensitivity - different strains ラ イ ブ ラ リ ー は have sharper に function す る こ と が confirm さ れ た. - cause of different strains の survived 伝 の ほ と ん ど は ヒ ト と high い identity を in molecular で す あ り, disease や creature し に た life phenomenon に masato す る have sharper な parsing す を provide る と exam え ら れ た. Examples: えば, special に, klp-18(kinesin-like Protein - 18) と rga - 2 (rho - gap) は そ れ ぞ れ tiny tube と ア ク チ ン を suppression す る molecular で あ り, embryo 発 の plural の process で 働 い て い る と exam え ら れ る た め, temperature sensibility - different strains が have sharper な analytical means と な る こ と が expect さ れ る. 続 い て, external の researchers が こ の temperature sensitivity - different strains ラ イ ブ ラ リ ー を read 覧 で き る よ う に, I 々 は base plate ゲ ノ の ム support class support を う け て temperature sensitivity - different strains の デ ー タ ベ ー ス (WorTS: Worm TS mutant Database) を constructing し, now そ の デ ー タ ベ ー ス を public し た (http://worts.biken.osaka-u.ac.jp). こ の デ ー タ ベ ー ス に は inverse heritage 伝 learn study situation の nematodes の が ア ク セ ス し, あ る specific の heritage 伝 son の - different strains を 検 cable す る こ と が expect さ れ る. こ の よ う な デ ー タ ベ ー ス の like the seaborne お よ び to think さ れ る use を consider し て, デ ー タ ベ ー ス は phenotype に base づ い た も の と い う よ り は, heritage 伝 child intelligence に footing し た も の と し た.

项目成果

Wntシグナルによる極性形成機構-線虫初期胚を例として-

Wnt信号极性形成机制 - 以早期秀丽隐杆线虫胚胎为例 -

• 发表时间: 2006
• 期刊: 生化学 78巻
• 作者: Masaki Shirayama;et. al.;中村邦明
• 通讯作者: 中村邦明

温度感受性変異株のデータベース(WorTS : Worm TS mutant Database)

蠕虫 TS 突变体数据库 (WorTS)

The Conserved Kinases CDK-1, GSK-3, KIN-19, and MBK-2 Promote OMA-1 Destruction to Regulate the Oocyte-to-Embryo Transition in C. elegans

• DOI: 10.1016/j.cub.2005.11.070
• 发表时间: 2006-01
• 期刊: Current Biology
• 影响因子: 9.2
• 作者: M. Shirayama;M. Soto;T. Ishidate;Soyoung Kim;Kuniaki Nakamura;Y. Bei;S. V. D. Heuvel;C. Mello