FT-ICR, MSメタボロミクスによる超微量マーカー探索から一細胞定量への展開
FT-ICR, MSメタボロミクスによる超微量マーカー探索から一細胞定量への展開
批准号:
19021040
负责人:
太田 大策
金额:
$3.2万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2007
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2007 至 2008
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英文摘要
【研究の目的】フーリエ変換イオンサイクロトロン質量分離装置(FT-ICR/MS)による超高分解能・超高感度質量分析を基礎として, 組織や単離オルガネラ, さらに一細胞を材料とした生体分子の超微量同定・定量のための基盤創造を目指す.【方法】未知代謝産物の構造情報取得を目指して微生物・動物の内生メタボライトをカタログ化し, それらの超微量検出と同定・定量を目指す.その基盤において, 試料間でメタボライトプロファイルを比較(ディファレンシャル・メタボロミクス)し, 新規マーカー分子を同定する.【成果】FT-ICR/MS試料直接導入法による一斉解析によって細胞内の代謝産物から生成するイオンに対して精密質量値を取得し, その分析値に対して化合物元素組成を探索するシステムを構築した. さらに, nanoHPLC(日立製)をFT-ICR/MSに連結させ, 分子量のみではなく化学的性質情報を加味した分析を実施した. 推定した元素組成を包括的に解析することを目的にしてvan Krevelen diagramを適用し, 生体反応を元素組成変化によって解析するための基礎を整備することが出来た. 元素組成変化を酵素反応さらには遺伝子機能として帰属させるための検索システムを作成した. 本メタボロミクス実験スキームを骨形成・代謝モデル, 前立腺がん骨転移モデル系におけるメタボロミクス解析に適用し, 新規バイオマーカー候補化合物を特定することが出来た.
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van Krevelen diagramを用いたメタボローム解析による遺伝子機能の探索
使用 van Krevelen 图通过代谢组分析探索基因功能
DOI:
--
发表时间:
2009
期刊:
影响因子:
--
作者:
[甲斐光輔, 南加容, 露口恵太郎, 北野真也, 高橋弘喜, 庄條昌之, 櫻井望, 鈴木秀幸, 柴田大輔, 金谷重彦, 太田大策]
通讯作者:
太田大策
DOI:
10.1007/s00425-009-0916-4
发表时间:
2009-05-01
期刊:
PLANTA
影响因子:
4.3
作者:
[Morikawa, Tomomi, Saga, Hirohisa, Ohta, Daisaku]
通讯作者:
Ohta, Daisaku
DOI:
10.1007/s00425-007-0594-z
发表时间:
2007-12-01
期刊:
PLANTA
影响因子:
4.3
作者:
[Nakamura, Yukiko, Kimura, Atsuko, Ohta, Daisaku]
通讯作者:
Ohta, Daisaku
Metabolic Profiling using Fourie transform ion cyclrotron resonance mass spectrometry
使用傅里叶变换离子回旋共振质谱进行代谢分析
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
Anal.Bioanal Chem 389
影响因子:
--
作者:
[Ohta D, Shibata D, Kanaya S(筆頭著者, 責任著者)]
通讯作者:
責任著者)
DOI:
10.1007/s00216-008-2195-5
发表时间:
2008-08
期刊:
ANALYTICAL AND BIOANALYTICAL CHEMISTRY
影响因子:
4.3
作者:
[Takahashi, Hiroki, Kai, Kosuke, Shinbo, Yoko, Tanaka, Kenichi, Ohta, Daisaku, Oshima, Taku, Altaf-Ul-Amin, Md., Kurokawa, Ken, Ogasawara, Naotake, Kanaya, Shigehiko]
通讯作者:
Kanaya, Shigehiko
共 9 条
フーリエ変換質量分析による超微量生体分子の検出と同定・定量システムの基盤創造
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批准号:18038037
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.09万
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财政年份:2006
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负责人:太田 大策
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依托单位:
植物生体防御ネットワークを統合する一酸化窒素に特異的な情報伝達系路の解明
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批准号:12052224
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.66万
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财政年份:2000
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负责人:太田 大策
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依托单位:
海外基金