生体膜を介した物質輸送の構造生物学的研究
生体膜を介した物質輸送の構造生物学的研究
批准号:
19036004
负责人:
石谷 隆一郎
金额:
$4.48万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2007
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2007 至 2008
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英文摘要
金属イオン輸送体の構造解析に関しては、我々の結晶構造解析の結果(Nature, 2007)から示唆されたMg^<2+>依存的な構造変化を検証すべく, MgtE細胞質ドメインの分子動力学シミュレーションを行った. その結果, 計算機内で細胞質ドメインのMg^<2+>依存的な開閉構造変化を再現することに成功し, 細胞質ドメイン中のNドメインが構造変化に果たす役割が示唆された(PNAS, 2008). さらに結晶構造やシミュレーション結果から示唆されたMg^<2+>ホメオスタシス機構を検証するために, パッチクランプ法等を用いた変異体解析を行った(論文準備中). ペプチド膜透過装置に関しては、SecYEのセレノメチオニン置換体結晶を用いた多波長異常分散法により位相決定に成功し、最終的に3.2A分解能での構造決定を行った(Nature, 2008)。さらにTSecDFについては, ペリプラズム領域のみの高分解能構造を、結晶構造解析・NMR法を用いて決定した。今後全長の電子密度マップにこれらの構造を当てはめ、新規膜タンパク質TSecDFの分子モデルを構築中である。(論文準備中)
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The structure of the pyrrolysyl-tRNA synthetase : tRNP^<pyl> complex reveals the molecular basis of orthogonality
吡咯赖氨酰-tRNA 合成酶的结构:tRNP^<pyl> 复合物揭示了正交性的分子基础
DOI:
--
发表时间:
2009
期刊:
Nature 457
影响因子:
--
作者:
[Nozawa K, (他3名) Ishitani R, & Soll D, Nureki O]
通讯作者:
Nureki O
マグネシウム輸送体MgtEの分子動力学シミュレーション
镁转运蛋白MgtE的分子动力学模拟
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Kaneko, K., Yamada, Y., Sueyoshi ; N., Watanabe, A., Asada. Y., Kameshita. I., 石谷隆一郎,杉田有治,濡木理]
通讯作者:
石谷隆一郎,杉田有治,濡木理
Crystal structure of the radical SAM. enzyme catalyzing tricyclic modified base formation in tENA
自由基 SAM 的晶体结构。
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
J. Mol. Biol. 372(5)
影响因子:
--
作者:
[(5名) Ishitani R, Nureki o]
通讯作者:
Nureki o
DOI:
10.1038/nature07421
发表时间:
2008-10-16
期刊:
NATURE
影响因子:
64.8
作者:
[Tsukazaki, Tomoya, Mori, Hiroyuki, Fukai, Shuya, Ishitani, Ryuichiro, Mori, Takaharu, Dohmae, Naoshi, Perederina, Anna, Sugita, Yuji, Vassylyev, Dmitry G., Ito, Koreaki, Nureki, Osamu]
通讯作者:
Nureki, Osamu
DOI:
10.1093/nar/gkp158
发表时间:
2009-05
期刊:
Nucleic acids research
影响因子:
14.9
作者:
[Suzuki Y, Noma A, Suzuki T, Ishitani R, Nureki O]
通讯作者:
Nureki O
共 14 条
細胞膜に関連したエネルギー変換マシーナリーの構造・機能相関
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批准号:19042007
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$4.1万
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财政年份:2007
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负责人:石谷 隆一郎
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依托单位:
海外基金