膜蛋白質の機能変換から観る機能-構造変化の連関性と分子論的理解

从膜蛋白功能转换中看到的功能与结构变化之间关系的分子理解

• 批准号: 20050012
• 负责人: 須藤 雄気
• 金额: $ 2.18万
• 依托单位: Nagoya University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20050012/
• 关键词: 生物物理学; 分子認識; シグナル伝達; 膜タンパク質; 受容体; 光センサー; ロドプシン; 生物物理

2-1. 忌避応答光センサー蛋白質、SRIIの機能発現分子メカニズム現在阪大/水谷グループと共同で、機能・構造変化に必須のアミノ酸残基(Tyr174)の変化を検出するため、時間分解紫外共鳴ラマン測定を行っている。2-2. デュアル光センサー蛋白質、SRIの機能発現メカニズム(1)新しいSRI分子、SrSRIのCl^-依存的光反応変化を見出した[J.Mol.Biol. 2009](A01:藤井グループとの共同研究)。(2)新しいSRI分子、HvSRIの発現・精製と分光解析[Biochemistry 2010](A01:藤井グループとの共同研究)。(3)SrSRIと伝達タンパク質、SrHtrIの複合体の機能発現系構築に成功し、その分光学的解析を行った[Biochemistry 2009a](A01:藤井グループとの共同研究)。2-3. SRI-HtrIが制御するべん毛蛋白質の解析SRI-HtrIが受けた光情報は、最終的にべん毛モーターの回転方向の制御として出力される。ここでは、べん毛固定子タンパク質MotBの部分結晶構造と[Mol.Microbiol. 2009]、赤外分光法によるNa^+透過経路の検討を行った[Biochemistry 2009b]このように光センサータンパク質の機能発現機構について、分子科学的に迫ることが出来た。

2-1. The functional development of SRII protein and SRII molecules is a common, functional and structural transformation of essential amino acid residues (Tyr174). 2-2. The functional evolution of SRI and SRI in the light of light (1) A novel Cl-dependent photodegradation of SRI molecules and SrSRI molecules has been discovered [J. Mol.Biol. 2009](A01: Fujii Joint Research). (2)Discovery, Purification and Spectroscopic Analysis of Novel SRI Molecules and HvSRI [Biochemistry 2010](A01: Joint Research of Fujii Kakuhiro) (3) The functional development system of SrSRI and SrHtrI complexes has been successfully constructed and analyzed by spectroscopic analysis [Biochemistry 2009a](A01: Joint Research of Fujii). 2-3. Analysis of SRI-HtrI for the control of hair protein SRI-HtrI for the control of light information and the final direction of hair loss Microbiol. Microbiol. 2009]A study of Na^+ transmission pathway by infrared spectroscopy [Biochemistry 2009b], a study of the mechanism for the development of optical properties, and a study of molecular science.

项目成果

Structural changes of Salinibacter sensory rhodopsin I upon formation of the K and M photointermediates.

K 和 M 光中间体形成后盐杆菌感觉视紫红质 I 的结构变化。

• DOI: 10.1021/bi801358b
• 发表时间: 2008
• 期刊: Biochemistry
• 影响因子: 2.9
• 作者: D. Suzuki;Y. Sudo;Y. Furutani;Hazuki Takahashi;M. Homma;H. Kandori
• 通讯作者: H. Kandori

古細菌型ロドプシンを例に、タンパク質の構造と機能の相関性を考える

以古细菌视紫红质为例考虑蛋白质结构与功能之间的关系。

• 发表时间: 2008
• 作者: 須藤雄気;吉住玲;小嶋誠司;本間道夫;Y. Sudo [Invited];須藤雄気[Invited]
• 通讯作者: 須藤雄気[Invited]

Assignment of the essential Na+ binding of a stator unit for torque generation of bacterial flagellar motor by ATR-FTIR spectroscopy

通过 ATR-FTIR 光谱分配用于细菌鞭毛马达扭矩产生的定子单元的必需 Na 结合

• 发表时间: 2009
• 作者: Sudo Y;Kitade Y;Furutani Y;Kojima M;Kojima S;Homma M;Kandori H.
• 通讯作者: Kandori H.

Steric Constraint in the Primary Photoproduct of Sensory Rhodopsin II is a Prerequisite for Light-Signal Transfer to Htrll

感觉视紫红质 II 的初级光产物中的空间约束是光信号转移到 Htrll 的先决条件

• 发表时间: 2008
• 期刊: Biochemistry 47
• 作者: M. Ito;Y. Sudo;Y. Furutani;T. O kitsu;A. Wada;M. Homma;J. L. Spudich;and *H. Kandori
• 通讯作者: and *H. Kandori

光を利用した細菌の営みを分子レベルで解き明かす

阐明细菌如何在分子水平上利用光

• 发表时间: 2009
• 作者: 須藤雄気;本間道夫;須藤雄気
• 通讯作者: 須藤雄気