Establishment of the analysis method to identify cell type contained in single-cell RNA sequencing data

单细胞RNA测序数据中细胞类型鉴定分析方法的建立

基本信息

  • 批准号：
    16K16152
  • 负责人：
    Tsuyuzaki Koki
  • 金额：
    $ 2.58万
  • 依托单位：
    Institute of Physical and Chemical Research
  • 依托单位国家：
    日本
  • 项目类别：
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
  • 财政年份：
    2016
  • 资助国家：
    日本
  • 起止时间：
    2016-04-01 至 2019-03-31
  • 项目状态：
    已结题

项目摘要

项目成果

期刊论文数量（6）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
Biological Systems as Heterogeneous Information Networks: A Mini-review and Perspectives
  • DOI：
  • 发表时间：
    2017-12
  • 期刊：
    ArXiv
  • 影响因子：
    0
  • 作者：
    Koki Tsuyuzaki;I. Nikaido
  • 通讯作者：
    Koki Tsuyuzaki;I. Nikaido
CellFishing.jl: an ultrafast and scalable cell search method for single-cell RNA sequencing
  • DOI：
    10.1186/s13059-019-1639-x
  • 发表时间：
    2018-07
  • 期刊：
    Genome Biology
  • 影响因子：
    12.3
  • 作者：
    Kenta Sato;Koki Tsuyuzaki;K. Shimizu;I. Nikaido
  • 通讯作者：
    Kenta Sato;Koki Tsuyuzaki;K. Shimizu;I. Nikaido
シングルセル解析プロトコール
单细胞分析方案
  • DOI：
  • 发表时间：
    2017
  • 期刊：
  • 影响因子：
    0
  • 作者：
    Izumi K;Brett M;Nishi E;Drunat S;Tan ES;Fujiki K;Lebon S;Cham B;Masuda K;Arakawa M;Jacquinet A;Yamazumi Y;Chen ST;Verloes A;Okada Y;Katou Y;Nakamura T;Akiyama T;Gressens P;Foo R;Passemard S;Tan EC;El Ghouzzi V;Shirahige K.;菅野　純夫
  • 通讯作者：
    菅野　純夫
いかにして「使える」データベースを維持し続けるか
如何维护一个“可用”的数据库
  • DOI：
  • 发表时间：
    2017
  • 期刊：
  • 影响因子：
    0
  • 作者：
    Kenta Sato;Koki Tsuyuzaki;Kentaro Shimizu;and Itoshi Nikaido;Koki Tsuyusaki and Itoshi Nikaido;露崎弘毅
  • 通讯作者：
    露崎弘毅
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  • 影响因子：
    0
  • 作者：
    Ikeda Kei;Nakada Taka-Aki;Kageyama Takahiro;Tanaka Shigeru;Yoshida Naoki;Ishikawa Tetsuo;Goshima Yuki;Otaki Natsuko;Iwami Shingo;Shimamura Teppei;Taniguchi Toshibumi;Igari Hidetoshi;Hanaoka Hideki;Yokote Koutaro;Tsuyuzaki Koki;Nakajima Hiroshi;Kawakami Ei;[小林優吾,田村秀希,中内茂樹,南 哲人]
  • 通讯作者：
    [小林優吾,田村秀希,中内茂樹,南 哲人]

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  • 通讯作者：
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    $ 2.58万
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