網羅的プロテオーム解析を用いたIPMNの新規良悪性診断法の開発

利用综合蛋白质组分析开发新的 IPMN 良恶性诊断方法

• 批准号: 16K19344
• 负责人: 堤 康一郎
• 金额: $ 2.5万
• 依托单位: Okayama University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2016
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2016-04-01 至 2017-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-16K19344/
• 关键词: IPMN; プロテオーム; FFPE; 癌

当院にて切除されたIPMN症例のホルマリン固定パラフィン包埋（FFPE）組織を用いて、レーザーマイクロダイセクションにて、「良性群」と「悪性群」に分類、回収後、ショットガン・プロテオーム解析を行った。まず、4検体を用いてサンプル回収後、本施設内の質量分析装置を用いて解析を行ったが、タンパク質の同定数が100前後であり、既報の他疾患の同様の解析報告と比較するとかなり少ない同定数であり、ペプチドの検出が不十分な可能性が考えられた。MSとMSMSのスキャンスピード、active exclusionの条件、分離条件など、さまざまな対策を試みるも改善が得られなかった。そこで、より高精度な質量分析装置を所有する国内の他施設での解析を依頼したところ、同定数が800以上と改善を認めた。今後、サンプル数を増やして解析を試み、悪性化の候補マーカーを同定し、さらに定量的質量分析や免疫染色による検証と絞り込みを行うことで、最適なマーカーが抽出できる可能性がある。この度、本資金による研究継続困難となったが、引き続き解析を継続していく方針である。

When IPMN cases are removed from the hospital, the FFPE tissue is classified, recovered, and analyzed. After the analysis of the quality analysis device in this facility, the number of identical samples in quality is about 100. The analysis report of the same sample of other reported diseases is compared with the number of identical samples in quality. MSMS's search results, active exclusion conditions, separation conditions, and search results The analysis of all other equipment in China depends on the accuracy of the quality analysis device, and the accuracy of the quality analysis device is more than 800. In the future, the number of samples will be increased, the analysis will be performed, the qualitative candidate will be determined, and the quantitative quality analysis will be performed. This is the first time that we've had a chance to study and analyze this issue.