Comparative genome analysis of functional endogenous viral elements using massive nucleotide sequence data

使用大量核苷酸序列数据对功能性内源病毒元件进行比较基因组分析

• 批准号: 16K21386
• 负责人: NAKAGAWA So
• 金额: $ 1.58万
• 依托单位: Tokai University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2016
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2016-04-01 至 2018-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-16K21386/
• 关键词: レトロウイルス; レトロトランスポゾン; 比較ゲノム; 分子進化; データベース; 機能ゲノム; 内在性ウイルス様配列; トランスポゾン; 内在性レトロウイルス; ゲノム進化; 新規機能性配列探索; バイオインフォマティクス

项目成果

The Phylogeny of Placental Evolution Through Dynamic Integrations of Retrotransposons

• DOI: 10.1016/bs.pmbts.2016.12.004
• 发表时间: 2017-01-01
• 期刊: MOLECULAR BIOLOGY OF PLACENTAL DEVELOPMENT AND DISEASE
• 作者: Imakawa, K.;Nakagawa, S.
• 通讯作者: Nakagawa, S.

Placental Development and Endogenous Retroviruses

胎盘发育和内源性逆转录病毒

• DOI: 10.2222/jsv.66.1
• 发表时间: 2016
• 期刊: Uirusu
• 作者: 今川和彦;中川草;草間和哉
• 通讯作者: 草間和哉

Novel endogenous retrovirus-derived transcript expressed in the bovine placenta is regulated by WNT signaling.

• DOI: 10.1042/bcj20170531
• 发表时间: 2017-10-10
• 期刊: The Biochemical journal
• 作者: Sakurai T;Nakagawa S;Bai H;Bai R;Kusama K;Ideta A;Aoyagi Y;Kaneko K;Iga K;Yasuda J;Miyazawa T;Imakawa K
• 通讯作者: Imakawa K

Genome-Wide Analyses of Endogenous Viral Elements in Mammalian Genomes Using the gEVE Database and Next-generation DNA Sequencing Data

使用 gEVE 数据库和下一代 DNA 测序数据对哺乳动物基因组中的内源病毒元件进行全基因组分析

• 发表时间: 2017
• 作者: 中川草;上田真保子;So Nakagawa;So Nakagawa
• 通讯作者: So Nakagawa

哺乳類ゲノムに内在化するウイルス由来の比較トランスクリプトーム解析

内化到哺乳动物基因组中的病毒的比较转录组分析

• 发表时间: 2016
• 作者: 中川草;上田真保子
• 通讯作者: 上田真保子