Epigenetic analysis of iPS cell and blood sample in moyamoya disease for novel biomarker

烟雾病 iPS 细胞和血液样本的表观遗传学分析,寻找新的生物标志物

基本信息

项目摘要

【方法】表現不一致一卵性双生児1組2名、成人もやもや病患者9名からなる一般患者群と、8名からなる健常対照群の血漿サンプルを用いて、マイクロアレイによるmiRNA網羅的発現解析を行った。凍結血漿200 microLから抽出したRNAは、脱リン酸化反応、ラベル化反応の後、2588種のmiRNAを検出可能なマイクロアレイチップ を用いてハイブリダイゼーションを行った後、シグナルデータを取り込んだ。続いて主成分解析を実施し、血漿miRNA発現のプロファイルを確認した。さらに患者群で共通変動するmiRNAを抽出し、そのうちqPCRによる定量解析を行うものを選択した。さらに別cohortの患者3名と健常者3名の単核球から樹立したiPSECsにおけるmiRNAの発現解析も行った。細胞内total RNAを抽出し、定量解析を行った。続いて発現変動を認めたmiRNAの予測標的遺伝子およびiPSECsのトランスクリプトームデータからpathway解析を行った。【結果】主成分解析では、miRNA発現プロファイルにより患者群と健常群が2つのクラスターに分離されることが示された。2つのcohortで共通変動する23種のmiRNAが同定され、そのうち定量解析ではmiR-6722-3p、miR-328、miR-150-5pの患者群/健常群発現比が有意な発現増加を認め、マイクロアレイ解析の結果とも矛盾しなかった。また、これら3種のmiRNAはiPSECsにおいても、同様の発現傾向を示した。さらに、これらのmiRNAの予測標的遺伝子による制御方向と発現方向が一致した296 iPSECs遺伝子のpathway解析では、PTENシグナル系を筆頭とし、細胞増殖、細胞生存、細胞接着などにかかわる経路が示された。
[methods] inconsistency was found in 1 group of monozygotic twins (n = 2), adult patients (n = 9), general patient group (n = 8) and normal group (n = 8). The blood samples were collected, and the results of the miRNA network were analyzed. After 200 microL of blood was extracted, acidified and acidified, it was found that after 2588 of the miRNA, it was possible to extract the drug after using the drug, and after using the drug, the drug was collected. The principal component analysis method was applied, and the blood miRNA showed that the principal component analysis was correct. The patients were divided into two groups: miRNA extraction and qPCR quantitative analysis. the patients were selected. In 3 patients with cohort, 3 normal patients and 3 normal controls, the iPSECs test was performed in 3 normal patients. MiRNA analysis was performed. Extracellular total RNA was extracted and quantitative analysis was performed. Please verify that the child that miRNA has been tested does not need to be tested. This is not true. The pathway resolution line is not available. [results] Principal component analysis (PCA) and miRNA analysis showed that the patients in the normal population were significantly higher than those in the normal group. (2) the results of quantitative analysis of patients with miR-6722-3p, miR-328, miR-150-5p patients

项目成果

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後大脳動脈領域を含んだ高度脳虚血を有するもやもや病に対する一期的脳血行再建術
一期脑血运重建术治疗烟雾病合并大脑后动脉区严重脑缺血
  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    齋藤久泰;白石啓太朗;山本修輔;髙 正圭;柏﨑大奈;秋岡直樹;桑山直也;黒田 敏;寶金清博
  • 通讯作者:
    寶金清博
後大脳動脈領域を含んだ高度脳虚血を有するもやもや病に対する一期的脳結構再建術
烟雾病合并大脑后动脉区严重脑缺血的一期脑结构重建
  • DOI:
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    齋藤久泰;内野晴登;白石啓太朗;山本修輔;髙 正圭;柏﨑大奈;秋岡直樹;桑山直也;寳金清博;黒田 敏
  • 通讯作者:
    黒田 敏
One-stage revascularization surgery for moyamoya disease with severe cerebral ischemia in the territory of posterior cerebral artery
一期血运重建术治疗烟雾病合并大脑后动脉区严重脑缺血
  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Saito Hisayasu;Kuroda Satoshi;Houkin Kiyohiro;Kuwayama Naoya;Akioka Naoki;Kashiwazaki Daina;Koh Masaki;Yamamoto Shusuke;Shiraishi Keitaro;Uchino Haruto.
  • 通讯作者:
    Uchino Haruto.
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齋藤 久泰其他文献

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