Theoretical elucidation of dynamical solvent effects in controling chemical reactions

控制化学反应中动态溶剂效应的理论阐明

• 批准号: 16KT0050
• 负责人: Kawai Shinnosuke
• 金额: $ 6.24万
• 依托单位: Shizuoka University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2016
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2016-07-19 至 2023-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-16KT0050/
• 关键词: 反応動力学; 機械学習; エネルギー移動; 反応性境界; 相空間構造; 異性化反応; 化学物理; 溶媒効果; クラスター; 化学反応動力学; 反応境界

项目成果

Extraction of multi-dimensional molecular dynamics from limited observations

从有限的观察中提取多维分子动力学

• 发表时间: 2018
• 作者: 清水将裕;野口泰徳;﨑山友香里;川上広宣;片山勉;高田彰二;Shinnosuke KAWAI
• 通讯作者: Shinnosuke KAWAI

Extraction of Essential Coordinates for Analysis of Molecular Dynamics

提取分子动力学分析的基本坐标

• 发表时间: 2020
• 作者: 蓮見 雄;Shinnosuke KAWAI
• 通讯作者: Shinnosuke KAWAI

Modified AMBER force-field (FUJI) parameters for sulfated and phosphorylated tyrosine residues: Development and application to CCR5-derived peptide systems

硫酸化和磷酸化酪氨酸残基的改良 AMBER 力场 (FUJI) 参数：CCR5 衍生肽系统的开发和应用

• DOI: 10.1063/1.5137924
• 发表时间: 2019
• 期刊: AIP Conf. Proc.
• 作者: Yamashita Takefumi;Okajima Ryo;Miyanabe Kazuhiro;Tsumoto Kouhei
• 通讯作者: Tsumoto Kouhei

構造生物学2.0としての分子動力学シミュレーション：創薬応用への道 Molecular Dynamics Simulations as Structural Biology 2.0: Application to Drug Design

分子动力学模拟作为结构生物学 2.0：在药物设计中的应用

• 发表时间: 2019
• 期刊: 月刊「細胞」(The Cell)
• 作者: Yamashita Takefumi;Okajima Ryo;Miyanabe Kazuhiro;Tsumoto Kouhei;Shoji Takada;蓮見 雄;Shoji Takada;山下雄史
• 通讯作者: 山下雄史

Environmental Coordinates in the Structural Dynamics of a Dipeptide

二肽结构动力学中的环境坐标

• 发表时间: 2019
• 作者: Shoji Takada;蓮見 雄;Shinnosuke Kawai
• 通讯作者: Shinnosuke Kawai