メンブレンベシクルゲノム解析による根圏細菌間相互作用の解明

通过膜囊泡基因组分析阐明根际细菌之间的相互作用

• 批准号: 22KJ3147
• 负责人: 島崎 智久
• 金额: $ 2.83万
• 依托单位: Hokkaido University (2023)Institute of Physical and Chemical Research (2022)
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2023
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2023-03-08 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22KJ3147/
• 关键词: メンブレンベシクル; ゲノム解析; 遺伝子水平伝播

本研究では細菌が生産するメンブレンベシクルに着目し、その植物根圏における細菌間遺伝子水平伝播への関与を明らかにすることを目的としている。モデル細菌叢を構築するため、タバコ根より20菌株の細菌を単離し、PacBioシークエンス解析によりその全ゲノム配列を決定した。一方で、シークエンスに十分な核酸をメンブレンベシクルから単離することが困難であったため、今後メンブレンベシクルの単離・精製法に改良が必要である。また、細菌から単離したメンブレンベシクルを宿主植物に接種する実験系を構築し、細菌間相互作用に加えメンブレンベシクルの宿主植物への影響を評価することが可能となった。

本研究では細菌が生産するメンブレンベシクルに着目し、その植物根圏における細菌間遺伝子水平伝播への関与を明らかにすることを目的としている。乳酸菌发酵培养基，乳酸菌根际申请20株乳酸菌发酵培养基，PacBio乳酸菌解译试剂盒申请全菌量分配序列确定培养基。一方で、シークエンスに十分な核酸をメンブレンベシクルから単離することが困難であったため、今後メンブレンベシクルの単離·精製法に改良が必要である。また、細菌から単離したメンブレンベシクルを宿主植物に接種する実験系を構築し、細菌間相互作用に加えメンブレンベシクルの宿主植物への影響を評価することが可能となった。

项目成果

Extracellular molecules produced by microbiota commensals interfering with the root growth and immunity in Arabidopsis thaliana

共生微生物产生的细胞外分子干扰拟南芥根部生长和免疫

• 发表时间: 2023
• 作者: 島﨑 智久;Neumann Ulla;中野 亮平
• 通讯作者: 中野 亮平

マックスプランク植物育種学研究所(ドイツ)

马克斯·普朗克植物育种研究所（德国）