Monitoring the prevalence of pathogens in the aquatic environment of the Kathmandu Valley using wastewater-based epidemiology and microbial source tracking approaches

使用基于废水的流行病学和微生物源追踪方法监测加德满都谷地水生环境中病原体的流行情况

基本信息

批准号：
22KK0173
负责人：
原本英司
金额：
$ 12.9万
依托单位：
University of Yamanashi
依托单位国家：
日本
项目类别：
Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-10-07 至 2026-03-31
项目状态：
未结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22KK0173/
关键词：
健康関連微生物下水疫学調査微生物起源解析カトマンズ盆地

项目摘要

2022年度は、カウンターパートのSarmila Tandukar研究員（ネパール政策研究所）の協力により、カトマンズ盆地内の2ヶ所の下水処理場において流入水と放流水を定期的に採取した。研究協力者として参画している博士留学生が2023年2月に現地に渡航し、採取した試料中の微生物の濃縮作業等を実施した。不活化処理を施して国内に輸送した試料から新型コロナウイルス、A型インフルエンザウイルスおよびRSウイルスの遺伝子をリアルタイムPCR法によって測定した。A下水処理場からの新型コロナウイルス遺伝子の検出率は68%、A型インフルエンザウイルス遺伝子の検出率は60%、RSウイルス遺伝子の検出率は16%であった。また、B下水処理場からの新型コロナウイルス遺伝子の検出率は68%、A型インフルエンザウイルス遺伝子の検出率は19%であったが、RSウイルス遺伝子はいずれの試料からも検出されなかった。流入水と放流水の間でウイルス遺伝子の濃度に大きな差はなく、下水処理場において十分なウイルスの低減効果が得られていないことが分かった。これらの呼吸器系ウイルスに加え、蚊媒介性感染症への下水疫学調査の適用可能性を検討するため、デングウイルス遺伝子の検出も試みたが、いずれの試料からも検出されなかった。今年度の研究により、新型コロナウイルス感染症のみならず、A型インフルエンザやRSウイルス感染症が現地において流行している可能性が示唆された。

在2022财政年度，与我的同行Sarmila Tandukar（尼泊尔政策研究所）合作，我们定期在加德满都盆地的两个污水处理厂收集流入和排水。一名博士学位学生参加了研究伙伴，于2023年2月前往现场，并在收集的样品中对微生物的富集进行了培训。 COVID-19的基因，流感病毒和RS病毒的基因是通过从被灭活并运送到日本的样品的实时PCR测量的。来自污水处理厂的COVID-19基因的检测率为68％，流感A A A型病毒基因的检测率为60％，RS病毒基因的检测率为16％。此外，B污水处理厂的COVID-19基因的检测率为68％，流感A型A型病毒基因的检测率为19％，但在任何样品中均未检测到RS病毒基因。进水和排出的水之间的病毒基因浓度没有显着差异，发现在污水处理厂没有足够的病毒降低作用。除了这些呼吸道病毒外，我们还试图检测登革热病毒基因，以检查污水流行病学研究对蚊子传播感染的适用性，但未检测到这些样品。今年的研究表明，该地区不仅可以在该地区普遍存在Covid-19感染，而且流感和RS病毒感染也可能普遍存在。