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Monitoring the prevalence of pathogens in the aquatic environment of the Kathmandu Valley using wastewater-based epidemiology and microbial source tracking approaches

使用基于废水的流行病学和微生物源追踪方法监测加德满都谷地水生环境中病原体的流行情况

基本信息

批准号：
22KK0173
负责人：
原本英司
金额：
$ 12.9万
依托单位：
University of Yamanashi
依托单位国家：
日本
项目类别：
Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))
财政年份：
2022
资助国家：
日本
起止时间：
2022-10-07 至 2026-03-31
项目状态：
未结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22KK0173/
关键词：
健康関連微生物下水疫学調査微生物起源解析カトマンズ盆地

项目摘要

2022年度は、カウンターパートのSarmila Tandukar研究員（ネパール政策研究所）の協力により、カトマンズ盆地内の2ヶ所の下水処理場において流入水と放流水を定期的に採取した。研究協力者として参画している博士留学生が2023年2月に現地に渡航し、採取した試料中の微生物の濃縮作業等を実施した。不活化処理を施して国内に輸送した試料から新型コロナウイルス、A型インフルエンザウイルスおよびRSウイルスの遺伝子をリアルタイムPCR法によって測定した。A下水処理場からの新型コロナウイルス遺伝子の検出率は68%、A型インフルエンザウイルス遺伝子の検出率は60%、RSウイルス遺伝子の検出率は16%であった。また、B下水処理場からの新型コロナウイルス遺伝子の検出率は68%、A型インフルエンザウイルス遺伝子の検出率は19%であったが、RSウイルス遺伝子はいずれの試料からも検出されなかった。流入水と放流水の間でウイルス遺伝子の濃度に大きな差はなく、下水処理場において十分なウイルスの低減効果が得られていないことが分かった。これらの呼吸器系ウイルスに加え、蚊媒介性感染症への下水疫学調査の適用可能性を検討するため、デングウイルス遺伝子の検出も試みたが、いずれの試料からも検出されなかった。今年度の研究により、新型コロナウイルス感染症のみならず、A型インフルエンザやRSウイルス感染症が現地において流行している可能性が示唆された。

In 2022, Sarmila Tandukar, a researcher at the Institute of Environmental Policy, cooperated with the two sewage treatment plants in the basin to collect water from the inflow and discharge. Research collaborators and doctoral students will conduct on-site navigation in February 2023 to collect microorganisms from samples and concentrate them. No activation treatment was applied to the domestic transportation of samples from new types of PCR, A-type PCR and RS. The detection rate of A sewage treatment plant is 68%, that of A sewage treatment plant is 60%, and that of RS sewage treatment plant is 16%. The detection rate of new type of C-type and B-type wastewater treatment plants was 68%, and the detection rate of type A wastewater treatment plants was 19%. The concentration of pollutants in influent water and effluent water varies greatly, and the decrease of pollutants in sewage treatment field varies greatly. The respiratory system is used to investigate the possibility of aquatic epidemiological investigation of mosquito-borne infections. This year's research shows the possibility of A new type of infection, a new type of infection, and a new type of infection.