A study of distributed database system architecture and its retrieval method
分布式数据库系统体系结构及其检索方法研究
基本信息
- 批准号:09680397
- 负责人:
- 金额:$ 0.96万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- 财政年份:1997
- 资助国家:日本
- 起止时间:1997 至 1998
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
The objective of this research is to find out necessary fuctions of distributed database systems for accessing to heterogeneous molecular biology databases.To achieve this goal, we have constructed, in the first year, a proto-type database system for Genbank, Swiss-prot, PIR, and PDB.In the proto-type system, these four databases are stored in different networked workstations, and can be accessed by OQL (Object Query Language) through an object-oriented database schema.Each database has a database agent written in C and perl, and the agents commnunicate with the user agent using MPI (Message Passing Interface).We also developed a mobile agent using Agent Tcl.The agents autonomously go around the databases and collect relevant data entries.In the second year, we have changed the database agent programs to use Java applet and Horb.Users can easily access databases through web browsers that support Java.A database agent temporarily saves the retrieved data as HORB objects in itself and sends minimum data to the user agent, for example, entry names of the retrieved data.This architecture helps to suppress unnecessary data transfer, because the whole content of the retrieved entry can be sent to the user agent on demand.The time consuming operations such as alignment and aggregation can be done in CPU server workstations by sending data to them.We have good system response time.Currently, the life time period of the HORB objects in the database servers is during the session, however, it can be longer.A database agent itself can assembly multiple entries in terms of the same gene by using homology search.The security problem is yet to be studied.This problem will be faced in almost all systems using agents, because it is not clear whether the agent software surely assures the security of the operational systems.
本研究的目的是找出分布式数据库系统访问异构分子生物学数据库所需的功能。为了实现这一目标,我们在第一年建立了一个原型数据库系统,用于Genbank、Swiss-prot、PIR和PDB。在原型系统中,这四个数据库存储在不同的网络工作站上,并且可以通过OQL访问(对象查询语言)通过面向对象的数据库模式。每个数据库都有一个用C和Perl编写的数据库代理,代理使用MPI与用户代理通信(消息传递接口)。我们还使用Agent Tcl开发了一个移动的代理。代理自主地在数据库中四处走动并收集相关的数据条目。在第二年,我们已经改变了数据库代理程序,使用Java applet和Horb。用户可以通过支持Java的Web浏览器轻松访问数据库。数据库代理将检索到的数据临时保存为HORB对象,并将最小数据发送给用户代理,例如检索到的数据的条目名称。这种体系结构有助于抑制不必要的数据传输,因为检索到的条目的全部内容可以按需发送到用户代理。通过向CPU服务器工作站发送数据,可以在CPU服务器工作站中完成对齐和聚合等耗时操作。我们有良好的系统响应时间。目前,数据库服务器中HORB对象的生命周期是在会话期间,但是,它可以更长。数据库代理本身可以通过使用同源搜索来组装根据同一基因的多个条目。安全问题还有待研究。几乎所有使用代理的系统都将面临这个问题,因为不清楚代理软件是否确实保证操作系统的安全性。
项目成果
期刊论文数量(21)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
川本芳久,日浦太,中西通雄,松田秀雄,橋本昭洋: "単語の共起頻度と範囲内重要度による分子生物学データベースの関連エントリ探索手法" 電子情報通信学会データ工学研究会. DE98-3. 15-22 (1998)
Yoshihisa Kawamoto、Futoshi Hiura、Michio Nakanishi、Hideo Matsuda、Akihiro Hashimoto:“使用单词共现频率和范围内重要性的分子生物学数据库中的相关条目搜索方法”IEICE 数据工程研究组 DE98-3 .15-22( 1998)
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
Yoshihisa Kawamoto, Akihiro Inoue, Yoshihiko Tamada, Hideo Matsuda, Michio Nakanishi, Akihiro Hashimoto: "A Method for Retrieving Relevant Entries of Molec-ular Biology Databases using Word Co-occurrence Frequency" Proceedings of Inter-national Symposium
Yoshihisa Kawamoto、Akihiro Inoue、Yoshihiko Tamada、Hideo Matsuda、Michio Nakanishi、Akihiro Hashimoto:“一种利用词共现频率检索分子生物学数据库相关条目的方法”国际研讨会论文集
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
日浦太,川本芳久,中西通雄,松田秀雄,橋本昭洋: "分子生物学データベースにおける単語の共起性と出現位置による関連エントリ探索手法" 電子情報通信学会第9回データ工学ワークショップ(DEWS'98)論文集. CDROM. (1998)
Futoshi Hiura、Yoshihisa Kawamoto、Michio Nakanishi、Hideo Matsuda、Akihiro Hashimoto:“基于分子生物学数据库中单词共现和出现位置的相关条目搜索方法”第 9 届电子信息通信工程师学会数据工程研讨会(DEWS) )98)论文集(1998)。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
吉川孝伸,今井孝,中西通雄,松田秀雄,橋本昭洋: "モバイルエージェントを用いた異種の分子生物学データベースの検索手法" 電子情報通信学会第9回データ工学ワークショップ(DEWS'98)論文集. CDROM. (1998)
Takanobu Yoshikawa、Takashi Imai、Michio Nakanishi、Hideo Matsuda、Akihiro Hashimoto:“使用移动代理的异质分子生物学数据库搜索方法”电子、信息和通信工程师协会第九届数据工程研讨会论文集(DEWS98)。光盘(1998)
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
吉川孝伸,今井孝,中西通雄,松田秀雄,橋本昭洋: "モバイルエージェントを用いた異種の分子生物学データベースの検索手法" 電子情報通信学会 第9回データ工学ワークショップ(DEWS'98)論文集. CDROM. (1998)
Takanobu Yoshikawa、Takashi Imai、Michio Nakanishi、Hideo Matsuda、Akihiro Hashimoto:“使用移动代理的异质分子生物学数据库的搜索方法”电子信息和通信工程师协会第九届数据工程研讨会(DEWS98)会议记录。光盘(1998)
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
NAKANISHI Michio其他文献
NAKANISHI Michio的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('NAKANISHI Michio', 18)}}的其他基金
Construction of information security learning environment using LMS based on VM technology
基于VM技术的LMS信息安全学习环境构建
- 批准号:
23501186 - 财政年份:2011
- 资助金额:
$ 0.96万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
A Scalable Computer System Environment and Course Curriculum for OS and Server System Management
用于操作系统和服务器系统管理的可扩展计算机系统环境和课程
- 批准号:
19500069 - 财政年份:2007
- 资助金额:
$ 0.96万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
A secure system for training OS settings and server construction
用于培训操作系统设置和服务器构建的安全系统
- 批准号:
17500050 - 财政年份:2005
- 资助金额:
$ 0.96万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Implementation and evaluation of information socket servers with authentication, encryption, and load-balancing
具有身份验证、加密和负载平衡功能的信息套接字服务器的实现和评估
- 批准号:
14580449 - 财政年份:2002
- 资助金额:
$ 0.96万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Research on agent mechanism for heterogeneous distributed databases
异构分布式数据库代理机制研究
- 批准号:
12680415 - 财政年份:2000
- 资助金额:
$ 0.96万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
相似国自然基金
城市随迁老年人活动需求的影响机制与动态空间模型预测研究
- 批准号:2025JJ60227
- 批准年份:2025
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
基于Agent的自动化渗透测试技术研究
- 批准号:
- 批准年份:2025
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
AI Agent赋能中小企业智能决策系统研究
- 批准号:
- 批准年份:2025
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
计算机控制Agent在可交互式企业征信报告生成的应用研究
- 批准号:
- 批准年份:2025
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
大模型Agent驱动的AI制药关键技术研究
- 批准号:
- 批准年份:2025
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
复杂网络理论下的智慧景区管理与人流控制方法
- 批准号:
- 批准年份:2024
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
混合多元区域情境下多Agent的自主协同决策方法研究
- 批准号:62306099
- 批准年份:2023
- 资助金额:30.00 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
基于操控员情境意识状态可解释Agent的智能交互触发机制研究
- 批准号:62376220
- 批准年份:2023
- 资助金额:50 万元
- 项目类别:面上项目
基于多Agent仿真模型的新能源汽车市场渗透研究
- 批准号:2023JJ60196
- 批准年份:2023
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
面向联排联调的城市复合洪涝灾害风险Agent建模与智能决策
- 批准号:42371092
- 批准年份:2023
- 资助金额:50 万元
- 项目类别:面上项目
相似海外基金
Collaborative Research: CDS&E: Generalizable RANS Turbulence Models through Scientific Multi-Agent Reinforcement Learning
合作研究:CDS
- 批准号:
2347423 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.96万 - 项目类别:
Standard Grant
CAREER: Impact of MRI contrast agent design on nanoscale interactions with neutrophils and platelets
职业:MRI 造影剂设计对中性粒细胞和血小板纳米级相互作用的影响
- 批准号:
2339015 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.96万 - 项目类别:
Standard Grant
CAREER: Strategic Interactions, Learning, and Dynamics in Large-Scale Multi-Agent Systems: Achieving Tractability via Graph Limits
职业:大规模多智能体系统中的战略交互、学习和动态:通过图限制实现可处理性
- 批准号:
2340289 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.96万 - 项目类别:
Continuing Grant
Multi-agent Self-improving of Large Language Models (LLMs)
大型语言模型 (LLM) 的多智能体自我改进
- 批准号:
2903811 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.96万 - 项目类别:
Studentship
Optimizing Intelligent Vehicular Routing with Edge Computing through Multi-Agent Reinforcement Learning
通过多智能体强化学习利用边缘计算优化智能车辆路由
- 批准号:
24K14913 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.96万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Greatwall in replication stress/DNA damage responses and oral cancer resistance
长城在复制应激/DNA损伤反应和口腔癌抵抗中的作用
- 批准号:
10991546 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.96万 - 项目类别:
Development of a Cathepsin V inhibitor for application as an anti-tumour agent.
开发用作抗肿瘤剂的组织蛋白酶 V 抑制剂。
- 批准号:
MR/Y503447/1 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.96万 - 项目类别:
Research Grant
DNA repair pathway coordination during damage processing
损伤处理过程中 DNA 修复途径的协调
- 批准号:
10748479 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.96万 - 项目类别:
Collaborative Research: CDS&E: Generalizable RANS Turbulence Models through Scientific Multi-Agent Reinforcement Learning
合作研究:CDS
- 批准号:
2347422 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.96万 - 项目类别:
Standard Grant
Applying a complex systems perspective to investigate the relationship between choreography and agent-based modeling as tools for scientific sense-making
应用复杂系统的视角来研究编排和基于代理的建模之间的关系,作为科学意义构建的工具
- 批准号:
2418539 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 0.96万 - 项目类别:
Continuing Grant