大腸菌tRNAにおけるwobble位ウリジンのヒドロキシル化修飾生合成機構の解明
大腸菌tRNAにおけるwobble位ウリジンのヒドロキシル化修飾生合成機構の解明
批准号:
13J10357
负责人:
酒井 雄介
金额:
$1.73万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2013
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2013-04-01 至 2016-03-31
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転移RNA(tRNA)は遺伝子発現において重要な、翻訳のアダプター分子である。tRNAはtRNA修飾酵素によって、様々な化学修飾が施され、機能が微調整されている。大腸菌tRNAの34位(wobble位)にみられる修飾塩基5-カルボキシメトキシウリジン(cmo5U)及びそのメチルエステル誘導体(mcmo5U)はコドン拡張の機能を持ち、翻訳に影響を与えることがわかっているが、生合成機構には未解明な点が多い。本研究の目的は、cmo5U/mcmo5Uの生合成機構の初段階であるウリジンの5位のヒドロキシル化機構を明らかにすることである。2年目までにtRNAのヒドロキシル化に関わる2つの遺伝子を明らかにし、それぞれが修飾に必要とする低分子を1つずつ同定していた。一方、cmo5Uからmcmo5Uを合成するメチル化酵素の遺伝子を同定し、試験管内修飾再構成に成功していた。また、修飾遺伝子欠損株の形質を見出していた。最終年度は、前年度までに同定したヒドロキシル化遺伝子と低分子をもちいてヒドロキシル化修飾の生化学的同定を行うと共に、修飾遺伝子欠損株を解析してその生理的意義を明らかにすることを目指した。また、cmo5Uメチル化遺伝子について論文として発表する計画であった。その結果、1 ウリジンのヒドロキシル化について、2つの遺伝子の一方で試験管内修飾再構成に成功し、その遺伝子が修飾酵素であることを証明した。2 cmo5Uのメチル化について、論文に発表した。この論文は発行元の上位1-2%に授与されるNAR Breakthrouh Articleに選出された。3 修飾の形質について解析し、ヒドロキシル化及びcmo5U修飾がそれぞれある塩基との対合に寄与していることを明らかにした。今後、1と3についてさらに研究を進めた上で論文に発表する予定である。
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Biogenesis and function of tRNA modification involved in the decoding process (provisional title)
解码过程中涉及的 tRNA 修饰的生物发生和功能(暂定标题)
DOI:
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发表时间:
2016
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Yusuke Sakai, Kenjyo Miyauchi, Satoshi Kimura, Tsutomu Suzuki, Yusuke Sakai]
通讯作者:
Yusuke Sakai
CmoM, the novel methyltransferase responsible for the last step of uridine-5-oxyacetic acid methyl ester (mcmo5U) biogenesis
CmoM,负责尿苷-5-氧乙酸甲酯 (mcmo5U) 生物合成最后一步的新型甲基转移酶
DOI:
--
发表时间:
2014
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Yusuke Sakai, Kenjyo Miyauchi, Satoshi Kimura, Tsutomu Suzuki]
通讯作者:
Tsutomu Suzuki
Biogenesis and function of tRNA modification involved in the decoding process
参与解码过程的 tRNA 修饰的生物发生和功能
DOI:
--
发表时间:
2016
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Yusuke Sakai, Kenjyo Miyauchi, Satoshi Kimura, Tsutomu Suzuki, Yusuke Sakai, Yusuke Sakai]
通讯作者:
Yusuke Sakai
Identification of Novel tRNA methyltransferase CmoM and the biogenesis of cmo5U
新型 tRNA 甲基转移酶 CmoM 的鉴定及 cmo5U 的生物发生
DOI:
--
发表时间:
2015
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Yusuke Sakai, Kenjyo Miyauchi, Satoshi Kimura, Tsutomu Suzuki, Yusuke Sakai, Yusuke Sakai, Kojiro Higuchi and Yoshihiro Horihata, Yusuke Sakai]
通讯作者:
Yusuke Sakai
Hierarchical Self-Assembly of 2D DNA Platform for Multi-Scale Nanoarray
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批准号:23K13646
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项目类别:Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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资助金额:$3.0万
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财政年份:2023
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负责人:酒井 雄介
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依托单位:
国内基金
海外基金
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POLR3G通过重塑tRNA图谱上调增殖因子LMNB1的蛋白表达促进前列腺癌进展的机制研究
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批准号:2026JJ50071
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2026
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负责人:邹成
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依托单位:
热带病原菌钩端螺旋体的tRNA修饰定位与生理生化功能分析
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2026
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负责人:林桓
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依托单位:
天冬氨酸/天冬氨酰tRNA合成酶-1轴通过调控钙稳态促进结直肠癌进展的作用与机制研究
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批准号:2026JJ30151
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2026
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负责人:刘先领
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依托单位:
利用阻抑tRNA系统靶向RPGR基因治疗视网膜色素变性的作用及机制研究
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批准号:2026JJ81550
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2026
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负责人:鲁元媛
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依托单位:
线粒体丙氨酰tRNA合成酶AARS2介导组蛋白乳酸化在脑缺血再灌注损伤中调控铁死亡的作用及机制
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批准号:2026JJ81960
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2026
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负责人:刘际童
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依托单位:
能量过剩介导tRNA衍生的小RNAs靶向自
噬及焦亡导致糖尿病心肌损伤的机制研
究
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:10.0万元
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批准年份:2025
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负责人:王丽宏
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依托单位:
tRNA-m1A修饰促前列腺癌恶性进展的分
子机制与潜在临床应用研究
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:10.0万元
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批准年份:2025
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负责人:张定校
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依托单位:
假尿苷修饰介导tRNA-Glu剪切产生 tRF-30-87R8WP9N1EWJ调控肝癌中MDM2/p53通路的机制研究
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批准号:JCZRYB202500445
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2025
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负责人:
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依托单位:
谷氨酰-tRNA还原酶易聚集区域的定向改造及其在四吡咯生物合成中的功能研究
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批准号:JCZRYB202501112
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2025
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负责人:
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依托单位:
TRMT61B介导线粒体tRNA m1A修饰在全氟
丁酸致肺细胞早衰中作用和机制
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:10.0万元
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批准年份:2025
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负责人:张文娟
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依托单位: