Theoretical elucidation on the full reaction mechanisms of threonine synthase

苏氨酸合酶全反应机制的理论阐明

• 批准号: 26410002
• 负责人: SHOJI MITSUO
• 金额: $ 3.24万
• 依托单位: University of Tsukuba
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2014
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2014-04-01 至 2017-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-26410002/
• 关键词: トレオニン合成酵素; 反応機構; 生成物支援機構; QM/MM; molecular dynamics; 自由エネルギー; スパコン; 反応制御; 反応制御機構; 副反応経路; molecular dynamics (MD); スーパーコンピュータ; 量子古典混合計算; 酵素反応

项目成果

Large-scale QM/MM calculations of the CaMn4O5 cluster in the S3 state of the oxygen evolving complex of photosystem II. Comparison between water-inserted and no water-inserted structures.

• DOI: 10.1039/c6fd00230g
• 发表时间: 2017-06
• 期刊: Faraday discussions
• 影响因子: 3.4
• 作者: M. Shoji;H. Isobe;T. Nakajima;Y. Shigeta;M. Suga;F. Akita;Jian-Ren Shen;K. Yamaguchi

Full Geometry Optimizations of the CaMn4O4 Model Cluster for the Oxygen Evolving Complex of Photosystem II

光系统 II 放氧复合体 CaMn4O4 模型簇的全几何优化

• DOI: 10.1016/j.cplett.2015.10.006
• 发表时间: 2015
• 期刊: Chemical Physics Letters
• 影响因子: 2.8
• 作者: M.Shoji;H.Isobe;T.Nakajima;K.Yamaguchi
• 通讯作者: K.Yamaguchi

QM/MM study on the possible reactions of Photosystem II oxygen evolving complex in the S2 to S3 transition

QM/MM 研究光系统 II 放氧复合体在 S2 到 S3 转变中可能发生的反应

• 发表时间: 2015
• 作者: 庄司光男;栢沼愛;重田教育照;長友重紀;長井雅子;Mitsuo Shoji;Mitsuo Shoji
• 通讯作者: Mitsuo Shoji

QM/MM study on the L-threonine formation reaction of threonine synthase

苏氨酸合酶L-苏氨酸形成反应的QM/MM研究

• 发表时间: 2014
• 作者: Mitsuo Shoji;Yuzuru Ujiie;Wataru Tanaka;Megumi Kayanuma;Ryuhei Harada;Hiroaki Umeda;Yasuteru Shigeta;Takeshi Murakawa;Hideyuki Hayashi
• 通讯作者: Hideyuki Hayashi

金属錯体の量子・計算化学”、錯体化学会選書10

《金属络合物的量子与计算化学》，日本配位化学学会论文选10

• 发表时间: 2014
• 作者: 庄司光男（山口兆;榊茂好;増田秀樹編著）
• 通讯作者: 増田秀樹編著）