Analysis for the pollen number controlling pathway in wheat

初年度であるR4年度はコムギの花粉関連形質に関する基礎データの取得を目的とした。コムギの大規模種子ストックセンターであるNBRPコムギのコアコレクションのうち、四倍体コムギおよび六倍体コムギ合計350個体を育成し、セルカウンターにより花粉数、花粉サイズ、葯長を計測した。各形質の計測として、まず1系統から2もしくは4個体をサンプリングし、それぞれの個体から1穂あたり2小花分の葯（合計6葯）を1.5mlチューブに採取した。この葯について、カメラ付き実体顕微鏡により画像を取得し、画像解析によって葯長を算出した。これらの葯については1.5mlチューブ内で葯を切断し、2.5%Tween-20液を加えることで花粉液を作製した。この花粉液には100μm以上の葯の細胞片や20μm以下のゴミが含まれる。これらの不要なゴミを除去する目的で目開き20μmもしくは100μmのナイロンメッシュと0.5mlを組み合わせた自作カラムによって不要な粒子を除去した。この花粉液をセルカウンターにより計測し、1花あたりの花粉数および花粉サイズを算出した。その結果、系統間で1小花あたりの花粉数に10倍近い違いがあることがわかった。興味深いことに四倍体コムギでは野生種に比べて栽培種の花粉が有意に少なく、また、六倍体コムギでは在来系統と比較して近代品種で花粉数が少ないことがわかった。今回の花粉数の減少は栽培化を通じて花粉数が減少したことを示すものである可能性がある。次に花粉数や、花粉サイズや葯長についてゲノムワイド関連解析を行った。その結果、それぞれの形質と有意な相関を示すSNPを検出した。今後はこれらのSNPについて他の植物などで既知の花粉関連遺伝子があるかどうか、周辺領域も含めて探索する予定である。

初年度であるR4年度はコムギの花粉関連形質に関する基礎データの取得を目的とした。コムギの大規模種子ストックセンターであるNBRPコムギのコアコレクションのうち、四倍体コムギおよび六倍体コムギ合計350個体を育成し、セルカウンターにより花粉数、花粉サイズ、葯長を計測した。各形質の計測として、まず1系統から2もしくは4個体をサンプリングし、それぞれの個体から1穂あたり2小花分の葯（合計6葯）を1.5mlチューブに採取した。この葯について、カメラ付き実体顕微鏡により画像を取得し、画像解析によって葯長を算出した。これらの葯については1.5mlチューブ内で葯を切断し、2.5%Tween-20液を加えることで花粉液を作製した。この花粉液には100μm以上の葯の細胞片や20μm以下のゴミが含まれる。これらの不要なゴミを除去する目的で目開き20μmもしくは100μmのナイロンメッシュと0.5mlを組み合わせた自作カラムによって不要な粒子を除去した。この花粉液をセルカウンターにより計測し、1花あたりの花粉数および花粉サイズを算出した。その結果、系統間で1小花あたりの花粉数に10倍近い違いがあることがわかった。興味深いことに四倍体コムギでは野生種に比べて栽培種の花粉が有意に少なく、また、六倍体コムギでは在来系統と比較して近代品種で花粉数が少ないことがわかった。今回の花粉数の減少は栽培化を通じて花粉数が減少したことを示すものである可能性がある。次に花粉数や、花粉サイズや葯長についてゲノムワイド関連解析を行った。その結果、それぞれの形質と有意な相関を示すSNPを検出した。今後はこれらのSNPについて他の植物などで既知の花粉関連遺伝子があるかどうか、周辺領域も含めて探索する予定である。