Development and Functional Evaluation of Cyclic Pyrrole-Imidazole Polyamides for Anticancer Drug Applications
用于抗癌药物应用的环状吡咯-咪唑聚酰胺的开发和功能评价
基本信息
- 批准号:22KJ1695
- 负责人:
- 金额:$ 1.41万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
- 财政年份:2023
- 资助国家:日本
- 起止时间:2023-03-08 至 2024-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
ピロール-イミダゾールポリアミド(PIP)はDNAに塩基配列特異的に結合する分子である。本研究課題では、特に環状構造を持つPIP(cPIP)の機能評価・改善を行うことを目標としている。cPIPは従来のヘアピン型PIP(hPIP)に比べて高い結合能・特異性を示すことが知られており、様々な疾患に対する薬剤としての応用が期待できる。当該年度は主に(A) PIPの細胞取り込み効率の違いを生む要因の解明と(B) CAG/CTG 反復配列を標的としたcPIPの機能向上に取り組んだ。(A) これまでの研究で、cPIPがhPIPより低い細胞取り込み効率を示すことが示唆されていた。そこで、今年度はそのような違いが生じる要因を解明しcPIPの細胞内機能の改善につなげることを目指した。まず、フローサイトメトリーによる細胞取り込み機構の評価を行った結果、PIPが複数のエンドサイトーシス経路を介して細胞に取り込まれていることが示唆された。さらに、NMRや分子モデリング、MDシミュレーションによる解析の結果、PIPと細胞膜との相互作用の様式や、相互作用の強さに影響しうる構造の違いに関するいくつかの知見を得た。なお、これらの研究はクイーンズランド大学のDavid Fairlie教授、Huy Hoang博士、Liping Liu博士の指導のもとで行った。(B) これまでの研究において、様々な疾患の原因となるCAG/CTG反復配列に対して高い結合能・特異性を示すcPIPを開発し、そのcPIPが疾患の原因となる異常な遺伝子の発現抑制や病態の改善を示すことが明らかになっていた。今年度はそのcPIPの構造に修飾を加えることでその活性を向上することを目指し、PIPとDNAとの複合体の分子モデリングを行うことで修飾部位とPIPとをつなぐ適切なリンカー長の見積もりを行った。
The DNA sequence is specific to the molecule. This research topic aims to evaluate and improve the functions of PIP (cPIP) based on its unique ring structure. cPIP has a higher binding energy and specificity than hPIP, and it is expected that cPIP will be able to detect and detect diseases. When the year is reversed,(A) PIP's cell selection ratio and violation rate are analyzed, and (B) CAG/CTG repeated allocation ratio and PIP's function are selected upward. (A)This study was conducted in conjunction with a study of the effects of low PIP on cell viability. The main reasons for the improvement of intracellular functions of PIP are explained. The results of the evaluation of the cell selection mechanism, PIP, and multiple cell selection mechanisms are shown below. The results of NMR molecular chemistry analysis, MD system analysis, PIP and cell membrane interaction model, interaction strength and structure analysis were obtained. Professor David Fairlie, Dr. Huy Hoang and Dr. Liping Liu of the University of Hong Kong (B)This study focuses on the causes of disease, CAG/CTG repeat alignment, high binding energy, specificity, development of cPIP, and inhibition of abnormal gene development and improvement of disease. This year, the structural modification of PIP is added to the activity of PIP and DNA. The molecular modification of PIP and DNA is carried out in an appropriate way.
项目成果
期刊论文数量(14)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Evaluation of the properties of a cyclic pyrrole-imidazole polyamide, which specifically binds to CAG/CTG repeat DNA
评估与 CAG/CTG 重复 DNA 特异性结合的环状吡咯-咪唑聚酰胺的特性
- DOI:
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Yuki Hirose;Tomo Ohno;Sefan Asamitsu;Kaori Hashiya;Toshikazu Bando;Hiroshi Sugiyama
- 通讯作者:Hiroshi Sugiyama
Sequence specific alkylation by a cyclic pyrrole-imidazole polyamide-chlorambucil conjugate
环状吡咯-咪唑聚酰胺-苯丁酸氮芥缀合物的序列特异性烷基化
- DOI:
- 发表时间:2021
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Yuki Hirose;Kaori Hashiya;Toshikazu Bando;Hiroshi Sugiyama
- 通讯作者:Hiroshi Sugiyama
CAG/CTG 反復配列を標的とした環状ピロールイミダゾールポリアミドによる遺伝子発現制御
环吡咯咪唑聚酰胺靶向 CAG/CTG 重复序列调控基因表达
- DOI:
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:廣瀬優希;大野智;朝光世煌;橋谷かおり;板東俊和;杉山弘
- 通讯作者:杉山弘
Structural Differences (Cyclic versus Linear) Affect the Activity of DNA-Binding Pyrrole-Imidazole Polyamides
结构差异(环状与线性)影响 DNA 结合吡咯-咪唑聚酰胺的活性
- DOI:
- 发表时间:2022
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Yuki Hirose;Huy N. Hoang;Toshikazu Bando;Hiroshi Sugiyama;David P. Fairlie
- 通讯作者:David P. Fairlie
Comparing the Properties of DNA Binding Pyrrole-Imidazole Polyamides with Different Structures (Linear versus Cyclic)
不同结构(线性与环状)吡咯-咪唑聚酰胺 DNA 结合性能的比较
- DOI:
- 发表时间:2023
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:廣瀬優希;Huy Hoang;橋谷かおり;板東俊和;杉山弘;David Fairlie
- 通讯作者:David Fairlie
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廣瀬 優希其他文献
逆配向型環状PIP-DNA複合体のX線結晶構造
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- DOI:
- 发表时间:
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- 影响因子:0
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杉山 弘
Photoalignment of Liquid Crystalline Materials: Basic and New Trends
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- 发表时间:
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- 影响因子:0
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- DOI:
- 发表时间:
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- 影响因子:0
- 作者:
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塩田 倫史
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- DOI:
- 发表时间:
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- 影响因子:0
- 作者:
Kokuda R;Watanabe R;Okuzaki D;Akamatsu H;Oneyama C.;廣瀬 優希;圦本 尚義 - 通讯作者:
圦本 尚義
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