The distribution and organisation of repetitive DNA elements in Brassica genomes

芸苔属基因组中重复 DNA 元件的分布和组织

• 批准号: 5233816
• 负责人: Professor Dr. Wolfgang Köhler (†)
• 金额: --
• 依托单位: Lehrstuhl für Pflanzenzüchtung
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Grants
• 财政年份: 2000
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 1999-12-31 至 2002-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/5233816?language=en
• 关键词: distribution; organisation; repetitive; DNA; elements

Pflanzengenome bestehen zum großen Teil aus unterschiedlichen repetitiven DNA-Elementen. Dazu gehören einerseits die sogenannten "tandem repeat"-Sequenzen (z.B. Satelliten-DNA, Telomer-Sequenzen und rDNA-Gene) und andererseits die "dispersed repeat"-Sequenzen (z.-B. Transposons und Retroelemente). Die Analyse der genomischen Verteilung und Organisation dieser repetitiven DNA-Sequenzen kann zur Aufklärung der Genomstrukltur und -evolution zwischen verwandten Arten beitragen. Auf diesem Gebiet wurden in den letzten Jahren mit Hilfe der Fluoreszenz-in situ-Hybridisierung (FISH) große Fortschritte erzielt. Für die Gattung Brassica, zu der zahlreiche agronomisch wichtige Gemüse- und Ölpflanzen gehören, gibt es bislang erst wenig Kenntnis über die physische Organisation repetitiver DNA. Ziel dieses Forschungsvorhabens ist es, verschiedene Klassen repetitiver DNA-Elemente bei Brassica-Arten mittels FISH auf chromosomaler Ebene zu identifizieren, die genomische Organisation wesentlicher, repetitiver Motive innerhalb der einzelnen Brassica-Genome aufzuklären und vergleichende Analysen der verschiedenen Genome durchzuführen.

Pflanzengenome bestehen zum großen Teil aus unterschedlichen repetitiven DNA-Elementen. Dazu gehören einerseits die sogenannten“tandem repeat”-Sequenzen（z.B. Satelliten-DNA，Telomer-Sequenzen和rDNA-Gene）和“分散重复序列”-Sequenzen（Z. B。转座子和逆转录元件）。基因组遗传学和组织学的分析可以重复进行DNA测序，以提高基因组结构和进化的效率。在近几年的时间里，人们开始使用原位杂交（FISH）技术进行大规模的杂交。为了获得芸苔属植物，为了获得具有遗传和非遗传特性的农艺学成果，必须首先确定其生理组织的重复DNA。这些研究结果是，在染色体组的FISH检测中，重复使用DNA元素，基因组组织是一种重复性的动机，它可以在染色体组的基础上进行重复性的分析。