根粒菌のレトロンと溶原性ファージの溶原化機構の解析

根瘤菌逆转录子和溶原噬菌体的溶原机制分析

基本信息

  • 批准号:
    06854049
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 0.51万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
  • 财政年份:
    1994
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    1994 至 无数据
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

溶原性ファージφUは、クローバ根粒菌4S株に感染し、ファージDNA上のattPと4S株染色体上のattB間で特異的組換えを起こし、菌染色体にインテグレートすることで溶原化する。本研究では、4S株染色体上のattBをクローニングすることを目的とした。併せて、ファージφUと宿主菌株について、レトロン存在の可能性を検討した。1.根粒菌染色体のattBのクローニングクローバ根粒菌CI101株は、ファージφUのattPを保持するプラスミドpCI6を4S株のattBにインテグレートさせた菌株である。CI101株の全DNAの制限酵素断片に対してattPをプローブとしたサザン法を行うことにより、attPとattBの組換えによって生じるファージと菌染色体のキメラ断片であるattLとattRを検出可能であった。CI101株のジーンバンクの中から、attPをプローブとしてスク-ニングし、attLに相当する約4kbのPstI断片を得た。次に、このattL断片をプローブとして、4S株のジーンバンクをスクリーニングすることにより、attBが存在すると予想される2kbのPstI断片を得ることに成功した。現在、attP、attB、attLの塩基配列の解析を進めている。2.レトロンの探索根粒菌4S株及びその派生株について、マルチコピーシングルストランドDNA(msDNA)の存在を指標として、レトロンの検出を試みたが、いずれの菌株からもレトロンを検出することはできなかった。また、一部明らかになっているファージφUDNAの塩基配列のなかに、レトロンの機能と関係深い逆転写酵素の共通配列(12塩基)と相同性の高い配列が存在したものの、それを含むオープンリーディングフレーム、あるいはレトロンの構造を取り得る配列は見いだせず、本研究に使用した菌株では、レトロンの存在は明確にできないことが判明した。
Lysogenic DNA of Rhizopus sp. 4S was infected with attP on DNA and attB on chromosome of Rhizopus sp. 4S. Specific structural changes occurred between attP and attB on chromosome of Rhizopus sp. 4S. In this study, the attB gene on the chromosome of the 4S strain was detected. The possibility of the presence of the host strain was also discussed. 1. The attB of the Rhizoctonia crusta chromosome of the Rhizoctonia crusta CI101 strain has the same attB as the attB of the 4S strain, which maintains the attP of the chromosome of the Rhizoctonia crusta pCI6. The restriction enzyme fragment of the whole DNA of CI101 strain is related to attP and attB. The restriction enzyme fragment of the whole DNA of CI 101 strain is related to attP and attB. A 4kb fragment of PstI was obtained from CI101 strain. Second, the attL fragment was successfully removed from the 4S strain. Now, attP, attB, attL and the analysis of the base alignment are in progress. 2. To explore the existence of Rhizoctonia sp. DNA(msDNA) in 4S strain and its derivatives. A part of the gene sequence of UDNA is related to the function of the gene sequence. The gene sequence of UDNA is related to the function of the gene sequence. The gene sequence of UDNA is related to the function of the gene sequence. The gene sequence of UDNA is related to the function of the gene sequence. The gene sequence of UDNA is related to the function of the gene sequence. The existence of the word is clear.

项目成果

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    $ 0.51万
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