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イネ科植物におけるMuトランスポゾンの探索

在草中寻找 Mu 转座子

基本信息

批准号：
06760003
负责人：
石川隆二
金额：
$ 0.64万
依托单位：
Hirosaki University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
财政年份：
1994
资助国家：
日本
起止时间：
1994 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-06760003/
关键词：
イネトランスポゾン Mutator 分子生物学系統分化

项目摘要

イネにおけるMuトランスポゾンの相同配列を探索した結果、内部の配列をモチーフにしたプライマーからの増幅産物を得た。その塩基配列はMuトランスポゾンの2つの遺伝子配列に挟まれる非転写領域のため、相同性は40%と低かった。ただし、この配列はイネにおいて反復配列として存在していることが明らかとなり、そのゲイム構成に何らかの影響を与えたと推定される。さらに、イネではMuトランスポゾンの末端反復配列に相同な配列が検出された。複数の相同配列が存在するとともに、インド型、日本型の各品種群間ならびに日本型品種群内における水稲・陸稲の生態型間でRFLPが検出された。この塩基配列を決定するため、インド型品種のIR36のゲラミックライブラリーからのクローニングを試みた。複数のプローブに対して、転写領域に相同な配列を得て制限酵素地図を作成した。この配列部分をプローブとしたサザンハイブリダイゼーションにおいて、イネゲノムには少なくとも2コピー以上の存在することが確認された。この配列をプローブとして用いたサザンハイプリダイゼーションでは、コムギやオオムギなど他の単子葉の穀物植物においても相同な配列の存在とRFLPが確認された。現在、クローニングされた塩基配列のうちMuトランスポゾンから作成したプローブに対して相同性の高い配列をサブクローニングし、塩基配列を解析している。

イネにおけるMuトランスポゾンの Same arrangement をExplore した results, The internal layout of the product is a wide range of products. The その塩婩はMuトランスポゾンの2つの伝子配组に挟まれる无転地のため, the sameness is 40% and the low かった.ただし、この配arrayはイネにおいて Repeated arrangement としてexistent していることが明らかとなり, そのゲイム constitute に何らかの Impact を and えたと presumed される.さらに、イネではMuトランスポゾンの Repeatedly arrange the same な arrangement が検出された. The same arrangement of plurals exists: するとともに, インド type, Japanese type のならびにJapanese type variety group における水稲・地稲の Ecotype RFLP 検出された. IR36, a type of するため and インド type varieties determined by the base arrangementのゲラミックライブラリーからのクローニングをtestみた. Plural のプローブに対して, 転WRITING FIELDS に the same な arrangement を got て restriction enzyme ground 図を made した. Arrangement part , イネゲノムには小なくとも2コピーThe above existence することがconfirm された.この配arrayをプローブとして用いたサザンハイプリダイゼーションでは、コムギやオオムギなどhis の単cotyledonのcereal plantにおいても SameなalignmentのexistentとRFLPがconfirmationされた. Now, the クローニングされた塩娩のうちMuトランスポゾンから成したプローブに対してidentityの高いalignmentをサブクローニングし, 桩basearrayをanalyticしている.