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2-デオキシ-scyllo-イノソース合成酵素の動的解析及びその応用

2-デオキシ-scyllo-イノソース合成酵素の動的解析及びその応用
2-脱氧青蟹肌糖合酶的动态分析及其应用
批准号:
01J11520
负责人:
中西 恵理子 (南後 恵理子)
金额:
$1.92万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2001
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2001 至 2003

项目摘要

项目成果

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2-デオキシ-scyllo-イノソース(DOI)合成酵素は、2-デオキシストレプタミン(DOS)含有型アミノ配糖体抗生物質ブチロシンの生合成鍵酵素で、グルコース-6-リン酸を直接炭素六員環化することによりDOIを生成する。DOIは2,3,4,5-テトラヒドロキシシクロヘキサノン構造を有し、構造的に脱水して芳香環化しやすい化合物であることから、医薬品や香料の原料となるカテコールなどの芳香族化合物に一工程で変換可能である。このように本酵素は応用性の高い酵素として興味深いが、いまだその三次元構造や詳細な反応機構は明らかとなっていない。そこで、本酵素の三次元構造を明らかとするためのX線結晶解析に着手した。250種類のスクリーニングの結果、PEGを用いた系で結晶化することがわかり、この結晶のX線回折測定より、2.3Åの分解能のデータを得ることができた。次に位相を決めるため、分子置換法、セレノメチオニン置換体による他波長異常分散法を検討したが、いずれも決定には至らなかった。続いて、各種重原子試薬を用い、結晶に重原子を導入したところ、水銀、白金による重原子置換体の回折を得ることができ、重原子置換法から位相決定することに成功した。現在モデルビルディング及び構造精密化を行なって、活性部位などのアミノ酸残基の解明に努めている。次に反応機構解析を行なうため、基質類縁体carbaglucose-6-phosphate(C-6-P)の重水素標識体を合成した。この標識体と本酵素の反応を^2H-NMRにて追跡したところ、新たなシグナルが観測された。現在この生成物の単離を行なっており、重水素の位置から反応機構に関する知見を得ようと考えている。
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作者: []
通讯作者:
Nango E., Eguch T., Kakinuma K.: "Active Site Mapping of 2-Deoxy-Scyllo-inosose Syntheses, the Key Starter Enzyme for the Biosynthesis of 2-Deoxy Streptamine, Mechanism-Based Inhibition and Identification"J.Org.Chem.. 69. 593-600 (2004)
Nango E.、Eguch T.、Kakinuma K.:“2-脱氧青蟹肌糖合成的活性位点图谱,2-脱氧链霉胺生物合成的关键起始酶,基于机制的抑制和鉴定”J.Org。
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期刊:
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作者: []
通讯作者:
H.Tamegai, E.Nango, A.Koike-Takesita, F.Kudo, K.Kakinuma: "Significance of the 20k-Da Subunit of Heterodimeric 2-Deoxy-scyllo-inosose Synthase for the Biosynthesis of Butirosin Antibiotics"Biosci. Biotechnol. Biochem.. 66・7. 1538-1545 (2002)
H. Tamegai、E. Nango、A. Koike-Takesita、F. Kudo、K. Kakinuma:“异二聚体 2-脱氧青蟹肌糖合成酶的 20k-Da 亚基对 Butirosin 抗生素生物合成的意义”Biosci。生物化学.. 66・7.
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影响因子: --
作者: []
通讯作者:
Nango E., Kudo F., Eguch T., Kakinuma K.: "Reaction Stereochemistry of 2-Deoxy-scyllo-Inosose Synthase the Key Enzyme in the Bioshynthesis of 2-Deoxystreptamine"Chem.Lett.. 32. 438-439 (2003)
Nango E.、Kudo F.、Eguch T.、Kakinuma K.:“2-脱氧青蟹肌糖合成酶的反应立体化学,2-脱氧链霉胺生物合成中的关键酶”Chem.Lett.. 32. 438-439(
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