アトピー性疾患の全ゲノム遺伝子検索

特应性疾病的全基因组基因搜索

• 批准号: 01J60003
• 负责人: 西尾 祐美
• 金额: $ 1.28万
• 依托单位: University of Tsukuba
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2001
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2001 至 2002
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-01J60003/
• 关键词: アトピー; 気管支喘息; アトピー性皮膚炎; 花粉症; 遺伝子; 全ゲノム検索

1.アトピー性気管支喘息では、全ゲノム連鎖解析で最も強い連鎖のみられた5q31-q33領域について多型解析を行った。この領域にマップされている遺伝子のコード領域を中心に変異検索を行い、検出された変異のうち比較的頻度の高い-塩基置換多型(SNP)について伝達不平衡テスト(TDT)により解析したが、既知遺伝子のアミノ酸置換を伴う多型には特筆すべき有意な伝達はみられず、原因遺伝子の同定には至らなかった。2.アトピー性皮膚炎では先にアトピー性気管支喘息での連鎖領域の解析を行っていたが、さらに残りの領域についても連鎖解析を行った。しかし、これまでにみられていた5q31-q33領域以上の連鎖・関連はみられず、また、これまでに報告のあったアトピー性皮膚炎の連鎖領域(1q21,3q21,3p24-22,20p)にも連鎖は認められなかった。5q31-q33領域におけるさらなる疾患感受性遺伝子を探すため、関連のみられたマーカー近傍の遺伝子について多型解析を行った。現在までに11遺伝子の解析を行ったが、アミノ酸置換を伴う多型にはTDT解析で有意な伝達はみられず、発症に関わる遺伝子は同定されなかった。3.花粉症では、同様に全ゲノム連鎖解析で最も強い連鎖のみられた4q13領域について、デンスマッピングを行い、連鎖領域を狭めた。さらにTDT解析で関連のみられたマーカー近傍の遺伝子について、変異検索および多型解析を行った。既知の遺伝子については多型の有意な伝達はみられず、機能の不明な遺伝子については末梢血リンパ球や粘膜に発現しているかの確認が必要となるため、現在検討中である。

1. アトピー性気 Branch asthma では, all ゲノム chain analysis で the strongest い chain のみられた5q31-q33 field について polytype analysis を row った.この区にマップされている伝子のコード区をcenterに変different検SOを行い、検出された変differentのうちfrequency of comparisonの高い-塩substitution polytype (SNP)について伝达不Balanced テスト(TDT) によりanalytic したが, known legacy のアミノacid replacement を合う多The type of special pen is the same as the intentional one, and the reason is the same as the original one. 2. Atomy dermatitis, atopic dermatitis, and atopic dermatitis are linked to the field of asthma. Analysis を行っていたが, さらに半りの区についても chain analysis を行った.しかし、これまでにみられていた5q31-q33 The chain and relationship above the field はみられず、また、これまでにreportのあThe chain area of ったアトピーdermatitis (1q21, 3q21, 3p24-22, 20p) にもchain は cognize められなかった. 5q31-q33 field におけるさらなるDisease sensitivity 伝子を探すため, the relationship between the のみられたマーカーaround the の缝子について polytype analysis を行った. Now までに11缝子のanalytic を行ったが、アミノAcid replacement を与う多typeにはTD T analysis means な伝达はみられず, and 発 syndrome に关わる伝子は同定されなかった. 3. Hay fever では, same 様に全ゲノム chain analysis で strongest い chain のみられた4q13 The field is について, the field is narrow and the chain field is narrow.さらにTDT analysis is related to のみられたマーカーclose to の伝子について, 変different検SO およびmulti-type analysis を行った. Known の缝子については Multi-type の意な伝达はみられず, function unknown の缝子についてはPeripheral blood リンパやmucosal に発 appear しているかのconfirmation が となるため, now 検検中である.