糖部をS型立体配座に固定した機能性核酸の創製とそれを用いた遺伝子発現制御法の確立

具有固定在S型构象的糖部分的功能性核酸的创建以及利用它们建立基因表达控制方法

基本信息

  • 批准号:
    02J05111
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.92万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 财政年份:
    2002
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2002 至 2004
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

今年度は、研究計画に従い前年度までに合成に成功した各修飾オリゴヌクレオチド類の機能評価および得られた結果を分子設計にフィードバックした新規人工核酸の合成を行い、以下に示す成果を得た。1.前年度に引き続き、アラビノ骨格を有するtrans-3',4'-BNAの導入位置を変えたオリゴヌクレオチド類の二重鎖形成能および塩基配列選択性について融解温度(T_m)測定法を用いて評価した。その結果、trans-3',4'-BNAの導入位置によらず、オリゴヌクレオチド類の二重鎖の安定性は低下した。しかし、マッチ配列とミスマッチ配列とのT_m値には明らかな差が認められ、本オリゴヌクレオチド類は天然型オリゴヌクレオチドに匹敵する配列選択性を維持していることが明らかになった。さらにCDスペクトル測定の結果から、trans-3',4'-BNA修飾が二重鎖の構造には大きな変化を与えていないことを明らかにした。現在、本研究に関する詳報を投稿中である。2.1の結果を受け、2'位無置換であるチミジンを出発物質に架橋構造を変えたtrans-3',4'-BNA類を新たに設計し、その合成を行った。3'位の立体選択的増炭反応および4'位の4級炭素化反応、その後の増炭反応を経て3種類の新規trans-3'、4'-BNA類の骨格構築に成功した。本研究の一部をTetrahedron Letters誌に発表した。3.前年度に引き続き、P3'→N5'ホスホロアミダート結合を有する糖部S型人工核酸,5'-amino-3',5'-BNAオリゴヌクレオチド類の二重鎖形成能についてT_m測定により詳細に解析した。その結果、本オリゴヌグレオチドは相補鎖核酸に対して安定な二重鎖を形成し、特に相補鎖RNAに対する二重鎖形成能を向上させることが明らかになった。さらに、5'-amino-3',5'-BNAがRNase Hに認識され相補鎖RNAの切断を誘導すること、並びにP3'→N5'ホスホロアミダート結合が穏和な酸性条件下で、選択的かつ速やかに加水分解されることを見い出した。本研究成果をAngewandte Chemie誌およびNucleoside, Nucleotides & Nucleic Acids誌に発表した。
This year's research project was successfully completed in the previous year. The results of the functional evaluation of the modified DNA and the synthesis of the new DNA are shown below. 1. In the past year, the introduction position of trans-3',4'-BNA has been changed, and the double lock formation energy of BNA has been evaluated by the method of melting temperature (T_m) determination. As a result, the stability of trans-3',4'-BNA double lock is lower than that of trans-3',4'-BNA double lock. The T_m value of the array is different from that of the natural type. The array selectivity of the natural type is maintained. The results of CD test show that trans-3',4'-BNA modification is a double-locked structure. Now, this research is related to the detailed report in the submission. 2.1 Results: No substitution at position 2'-BNA, no synthesis at position 2'-BNA The 3'-position carbon enhancement reaction and the 4'-position carbon enhancement reaction were successfully constructed by three new trans-3'and 4'-BNA types. A part of this study was published in Tetrahedron Letters. 3. In the previous year, the double lock formation ability of S-type artificial nucleic acid, 5'-amino-3',5'-BNA, was analyzed in detail. As a result, the DNA sequence of the DNA sequence is reversed, and the DNA sequence of the DNA sequence is reversed. In addition, 5'-amino-3', 5'-BNA can induce cleavage of complementary RNA recognized by RNase H, and it has been found that P3'→ N5'-BNA can be hydrolyzed at a high speed under acidic conditions. The results of this study are presented in the journal Angewandte Chemie and Nucleosides, Nucleides & Nucleic Acids.

项目成果

期刊论文数量(7)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Mitsuaki Sekiguchi, et al.: "Synthesis and conformation of a novel bridged nucleiside with S-type sugar puckering, trans-3',4'-BNA monomer"Tetrahedron Letters. 24/43. 4363-4368 (2002)
Mitsuaki Sekiguchi 等人:“具有 S 型糖褶皱、反式 3,4-BNA 单体的新型桥接核苷的合成和构象”四面体快报。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Mitsuaki Sekiguchi, et al.: "Stable Oligonucleotide-Directed Triplex Formation at Target Sites with CG Interruptions : Strong Sequence-Specific-Recognition by 2',4'-Bridged-Nucleic-Acid-Containing 2-Pyridones under Physiological Conditions"Chemistry A Eur
Mitsuaki Sekiguchi 等人:“在具有 CG 中断的目标位点形成稳定的寡核苷酸定向三链体:在生理条件下通过 2,4-桥接核酸包含 2-吡啶酮进行强序列特异性识别”化学 A
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Synthesis and conformation of a novel bridged nucleic acid having a trans-fused 3,5,8-trioxabicyclo[5.3.0]decane structure
具有转融合3,5,8-三氧杂双环[5.3.0]癸烷结构的新型桥接核酸的合成和构象
  • DOI:
  • 发表时间:
    2004
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    S.Obika;T.Osaki;M.Sekiguchi;R.Somjing;Y.Harada;T.Imanishi
  • 通讯作者:
    T.Imanishi
M.Sekiguchi: "Trans-3',4'-BNAs, novel nucleic acid analogues with an S-type conformation : synthesis and incorporation into oligonucleotides"Nucleic Acid Research Suppl.. 3. 111-112 (2003)
M.Sekiguchi:“Trans-3,4-BNA,具有 S 型构象的新型核酸类似物:合成和掺入寡核苷酸”Nucleic Acid Research Suppl.. 3. 111-112 (2003)
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Synthesis and properties of a novel bridged nucleic acid analogue bearing a P3'→N5' phosphoramidate linkage, 5'-amino-3',5'-BNA
带有 P3→N5 氨基磷酸酯键的新型桥接核酸类似物 5-氨基-3,5-BNA 的合成和性质
  • DOI:
  • 发表时间:
    2004
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    S.Obika et al.;M.Sekiguchi et al.;M.Sekiguchi et al.
  • 通讯作者:
    M.Sekiguchi et al.
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

関口 光明其他文献

関口 光明的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了